2012 Fiscal Year Annual Research Report
次世代シークエンサーによるグリオーマLOH領域の網羅的解析
Project/Area Number |
23791608
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Research Institution | Kyushu University |
Principal Investigator |
秦 暢宏 九州大学, 大学病院, 助教 (10596034)
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Keywords | IDH1 / IDH2 / LOH / glioma / glioblastoma / cancer stem cell / micro RNA / genome sequencer |
Research Abstract |
脳腫瘍幹細胞における網羅的遺伝子変異解析 九州大学脳神経外科における摘出腫瘍から確立した、神経膠芽腫の腫瘍幹細胞株4例を対象に、TruSeq_Amplicon_Cancer_Panelを用いてアンプリコンPCRを行いillumina miSeq にてシークエンスを実施し、CLC Genomics WorkBenchを用いてマッピングおよび変異解析を行った。 摘出脳腫瘍標本における遺伝子変異解析 九州大学脳神経外科手術症例のうち、神経膠腫203例(GBM 91例、AA 24例、AO29例、DA 23例、OD17例、その他27例)に対して、capillary sequencerを用いてIDH1/2変異解析および1p,19q 10, 17p のLOH解析を行った。 摘出脳腫瘍標本における発現解析 九州大学脳神経外科手術症例のうち、神経膠腫136例(GBM 74例、AA 16例、AO 18例、DA 15例、OD 13例)より神経膠腫解析パネルを作成した。神経膠腫悪性化に関与する遺伝子に対してmRNAと、神経膠腫に関連するmicroRNAの発現解析を行った
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Research Products
(8 results)