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2023 Fiscal Year Annual Research Report

Comprehensive and immediate environmental measurement of various chemical contaminants assisted by Informatics

Research Project

Project/Area Number 23H00539
Research InstitutionNational Institute for Environmental Studies

Principal Investigator

橋本 俊次  国立研究開発法人国立環境研究所, 環境リスク・健康領域, 室長 (80321719)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 松神 秀徳  国立研究開発法人国立環境研究所, 資源循環領域, 主任研究員 (10639040)
早川 英介  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 研究員 (20739809)
大塚 宜寿  埼玉県環境科学国際センター, 研究推進室, 副室長 (30415393)
大谷 隆浩  名古屋市立大学, 医薬学総合研究院(医学), 講師 (30726146)
山本 敦史  公立鳥取環境大学, 環境学部, 准教授 (40332449)
竹峰 秀祐  埼玉県環境科学国際センター, 化学物質・環境放射能担当, 専門研究員 (40512380)
家田 曜世  国立研究開発法人国立環境研究所, 環境リスク・健康領域, 主任研究員 (40761078)
宮脇 崇  北九州市立大学, 国際環境工学部, 准教授 (70346691)
江口 哲史  千葉大学, 予防医学センター, 講師 (70595826)
頭士 泰之  国立研究開発法人産業技術総合研究所, エネルギー・環境領域, 主任研究員 (80611780)
Project Period (FY) 2023-04-01 – 2026-03-31
Keywordsノンターゲット分析 / ラウンドロビンテスト / GC/MS / LC/MS / 異常検出 / 機械学習
Outline of Annual Research Achievements

ノンターゲット分析法の最適化と共通化の可能性を探るため、様々な機器と測定条件における検出能力を把握するために、農薬、VOC、界面活性剤などの混合標準品を11機関に配布し、GC/MS、LC/MS、ICP(/MS)による共同分析を開始した。
埼玉県下で採取された河川水質の分析データを用い、データ処理ワークフローのプロトタイプの作成を行った。同一条件で測定されたGC/MSあるいはLC/MSデータのピーク検出、デコンボリューション、アノテーション及びアライメントは、MS-DIAL上で行い、その後の次元削減とデータ分類(特徴抽出、異常検出)には、Uniform Manifold Approximation and Projection(UMAP)を採用し、Web上で動作する環境を試作した。ノイズの除去と異常の要因抽出にはNonnegative Matrix Factorization(NMF)が有効であると考えられた。
成果は、総説を含め誌上発表が2件、ポスター発表を含む口頭発表が15件として発信した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

サブテーマ1における共同分析では、標準品の調達に時間を要したために開始が遅くなったが、2024年度早々にデータを収集・解析する準備をしており、多少の計画の遅れは解消する見込みである。

Strategy for Future Research Activity

埼玉県下での継続的なノンターゲットモニタリングにより収集されるデータの解析を試みつつ、定常状態の定義と異常検出の手法を固める予定である。また、ノンターゲット分析の検出力を確認するため、環境試料への濃度レベルと種類を変えた標準試薬の添加実験と人為的に作成した模擬データを混入させた実験を実施する。共同分析の解析結果を、LCMS、GCMSの測定条件の共通化と最適化に反映していく計画である。

  • Research Products

    (17 results)

All 2024 2023

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (15 results) (of which Invited: 2 results)

  • [Journal Article] ノンターゲットメタボロミクスにおけるイオンモビリティの活用2023

    • Author(s)
      1.早川英介,平田香南子
    • Journal Title

      Journal of the Mass Spectrometry Society of Japan

      Volume: 71 Pages: 165-167

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 災害・事故時における迅速対応統合プラットフォームの開発2023

    • Author(s)
      高橋邦彦, 大谷隆浩
    • Journal Title

      地球環境

      Volume: 28 Pages: 187-194

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Network-based Metabolomics Data Integration: Towards Comprehensive Integrative Reanalysis2024

    • Author(s)
      Eisuke Hayakawa
    • Organizer
      第7回 京都生体質量分析研究会国際シンポジウム・第521回 生存圏シンポジウム
  • [Presentation] iNTA科研費研究の紹介&データ処理どうしましょう?2023

    • Author(s)
      橋本俊次
    • Organizer
      統計数理研究所共同研究「令和5年度 統計学的アプローチによる問題解決のための環境化学分析の最適化・高度化に関する研究集会」
  • [Presentation] 環境ノンターゲット分析における同定信頼度評価に係るLC保持指標の国内検討2023

    • Author(s)
      松神秀徳
    • Organizer
      統計数理研究所共同研究「令和5年度 統計学的アプローチによる問題解決のための環境化学分析の最適化・高度化に関する研究集会」
  • [Presentation] UoA RTI Platformの保持指標変換法で算出可能なLC保持指標の検討2023

    • Author(s)
      松神秀徳、頭士泰之、江口哲史、浅川大地、橋本俊次
    • Organizer
      第26回日本水環境学会シンポジウム
  • [Presentation] LCで利用可能な保持指標の検討 ~UoA RTI Platformの保持指標変換法の適用~2023

    • Author(s)
      松神秀徳、頭士泰之、江口哲史、浅川大地、橋本俊次
    • Organizer
      第2回環境化学物質3学会合同大会
  • [Presentation] 高分解能質量分析計を用いた生体試料中環境化学物質の探索と曝露影響解析2023

    • Author(s)
      江口哲史
    • Organizer
      第2回環境化学物質3学会合同大会
    • Invited
  • [Presentation] オミクス技術を用いたコホート調査・動物試料における化学物質曝露影響の探索2023

    • Author(s)
      江口哲史, 櫻井健一, 森 千里
    • Organizer
      第2回環境化学物質3学会合同大会
    • Invited
  • [Presentation] Comparison of dimensionality reduction methods for high-dimensional mass spectrometry data2023

    • Author(s)
      江口哲史
    • Organizer
      第7回ケミカルハザードシンポジウム
  • [Presentation] Investigation of comprehensive analysis of environmental chemicals and metabolome to determine the exposure effect using LC-QToFMS2023

    • Author(s)
      江口哲史
    • Organizer
      地球惑星科学連合
  • [Presentation] SCCPsおよびMCCPsの2次元GCによる分離同定に関する検討2023

    • Author(s)
      頭士泰之、松神秀徳、羽成修康
    • Organizer
      第2回環境化学物質3学会合同大会
  • [Presentation] 環境ノンターゲット分析を飛躍させるためのHRMS2DBスペクトル検索システムとラボ間データキャンペーン - Level 4からLevel 2aの世界へ-2023

    • Author(s)
      頭士泰之
    • Organizer
      統計数理研究所共同研究 「令和5年度 統計学的アプローチによる問題解決のための環境化学分析の最適化・高度化に関する研究集会」
  • [Presentation] LC-HRMS/MSによる環境ノンターゲット分析とスペクトル同定に関する検討2023

    • Author(s)
      頭士泰之
    • Organizer
      第58回日本水環境学会年会
  • [Presentation] ケモインフォマティクスおよび機械学習を利用したLC/MS分析における化合物の保持時間および感度の予測2023

    • Author(s)
      竹峰秀祐,大塚宜寿,門上希和夫,橋本俊次
    • Organizer
      第2回環境化学物質3学会合同大会
  • [Presentation] 未知化合物解析支援のための質量スペクトルネットワーク可視化ツール2023

    • Author(s)
      早川英介,平田香南子,近藤一成,有田正規
    • Organizer
      日本食品衛生学会第119回学術講演会
  • [Presentation] GC×GC‐HRToFMSを用いた環境試料ノンターゲット分析手法の開発?これまでの成果と現状の課題?2023

    • Author(s)
      家田曜世
    • Organizer
      統計数理研究所共同研究「令和5年度 統計学的アプローチによる問題解決のための環境化学分析の最適化・高度化に関する研究集会」

URL: 

Published: 2024-12-25  

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