2023 Fiscal Year Research-status Report
Investigation of Target Protein Degradation and Its Effect on Enhancing Cancer-Specific Antigen Presentation by Quantitative Mass Spectrometry
| Project/Area Number |
23K04971
|
|---|
| Research Institution | Japanese Foundation for Cancer Research |
|---|
Principal Investigator |
峯岸 ゆり子 公益財団法人がん研究会, がんプレシジョン医療研究センター プロテオミクス解析グループ, 研究員 (20621832)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2026-03-31
|
| Keywords | イムノペプチドミクス / KRAS / ネオ抗原 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
申請者は当該年度までにより多くのイムノペプチドの配列種の同定のための網羅的イムノペプチドミクス分析系と、目的の配列種の同定を集中的に行うための標的型イムノペプチドミクスの分析系を確立した。初年度は網羅的イムノペプチドミクス分析手法を用いることでKRAS変異を有するがん細胞株のスクリーニング分析を行い、KRAS変異を有するネオ抗原を提示している細胞株の選定を行った。これらの結果については一部先行して学会等で報告済みである。また、PROTACによる抗原提示増強作用の解析のため、レンチウィルスを用いて目的のKRAS変異を安定発現する細胞株の樹立を行い、この細胞に網羅的・標的型イムノペプチドミクスを用い目的抗原が提示されていることを確認した。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
申請者は当該年度までに複数種のがん細胞株を用いたイムノペプチドミクス解析の結果から、KRAS変異種(G12D、G12V、G12Aなど)を有するネオ抗原候補配列を提示する細胞株を同定することに成功した。G12C配列種を内在性に提示する細胞株についても現在分析を進めている。また、KRAS-G12Vを有するネオ抗原配列を内在性に提示することを確認済みの細胞株Colo-668に、レンチウィルスベクターを用いてKRAS-G12Dの安定発現株を確立し、G12Vに加え、G12Dのネオ抗原配列種も抗原提示されうることを確認し、安定発現株が分析モデルとして有用であることを確認した。
次年度は予定通り、PROTACによる抗原提示増強作用についての検証に移行する予定である。
|
| Strategy for Future Research Activity |
引き続きG12Cのネオ抗原配列の同定とモデル細胞株の作製・樹立を行う。PROTAC試薬については受注後生産品で納期まで長時間必要であったため、すでに合成依頼をし、試薬が届き次第、KRASタンパク質の分解亢進と抗原提示量の関係について、標的型質量分析をもちいたイムノペプチドミクス分析により、その効果について検討を行う予定である。
|
-
-
-
-
-
[Presentation] Simultaneous identification of KRAS mutation-carrying multiple neoepitopes by differential ion mobility-assisted targeted-mass spectrometry.2023
Author(s)
Minegishi, Y., Iwamoto, N., Shimada, T., Kiyotani, K., Nagayama, S., Tran, E., Koguchi, Y., Redmond, W., Piening, B., Fox, B.A., Ueda, K.
Organizer
The 38th annual Meeting of Society for Immunotherapy of Cancer (SITC2023)
Int'l Joint Research
-
[Presentation] Detection of KRAS G12D/G12V neoepitopes expressed by cancer cell lines using LC-MS/MS2023
Author(s)
Iwamoto, N., Minegishi, Y., Ueda, K., Koguchi, Y., Redmond, W., Piening, B., Fox, B.A, Tran, E., Shimada, T.
Organizer
The 38th annual Meeting of Society for Immunotherapy of Cancer (SITC2023)
Int'l Joint Research
-
-
