2023 Fiscal Year Research-status Report
細胞外小胞 -「界」を超えるコミュニケーションツールからお米を科学する
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23K05071
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| Research Institution | Gifu University |
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Principal Investigator |
山田 名美 岐阜大学, 大学院医学系研究科, 助教 (40727319)
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| Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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| Keywords | cross-kingdom RNAi / plant microRNA / extracellular vesicles |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究は、日々摂取する食事に含まれる細胞外小胞（Extracellular vesicles, EVs）およびEVsが内包するmicroRNAsを用いて腸内細菌叢に干渉することで大腸がんを制御できるのではないか、という仮説に基づき、立案したものである。本研究は特に、コメに含まれるEVsおよびmicroRNAsを用いて腸内細菌叢へ干渉し、米食によって大腸がんの発生や進行を抑制できるかを明らかにすることを目的としている。
研究計画１年目の本年度は岐阜県産のハツシモ苗を入手し実際に米を育成するところからはじめ、成長過程を経時観察するとともに、秋には市内の複数の農産物直売所より2023年度産ハツシモ玄米を入手した。次にハツシモ玄米からEVs単離方法の確立、およびEVsからRNAを抽出する方法の確立を行った。EVsの単離方法や核酸の抽出方法には哺乳類の細胞や組織からおこなうものと異なる点が多々あり、１からプロトコールの確立が必要となった。抽出したtotal RNAを用いてmicroRNA-seqを行い、コメ由来EVsに内包されるmicroRNAを網羅的に解析した。
並行してコメタンパクに対する抗体の作成を行った。標準植物であるシロイヌナズナに対する抗体は、ヒトやマウスに比べると少ないものの市販されていることが多い。しかしコメに対する市販抗体は非常に少なく、必要な抗体は自作する必要がある。そこで、ヒトでEVsのマーカータンパクとして知られるテトラスパニンのコメにおけるオルソログを探索し、候補タンパクを選定、それに対する抗体作成を行った。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
植物の試料を取り扱うのが初めてということもあり、基本的なプロトコールの確立にやや時間がかかったものの、miRNA-seqや抗体作成などと並行して行ったことでおおむね順調に進んでいる。
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| Strategy for Future Research Activity |
研究２として計画書に記載した「コメ由来EVs/microRNAsの加熱調理・消化液・ヌクレースへの耐性試験」および研究３「コメ由来EVs/microRNAsの腸内細菌叢へ与える影響の解析」を遂行する。
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| Causes of Carryover |
蛍光顕微鏡用の備品が予定よりも安く手に入ったため。また、網羅的解析を行うサンプル数を絞ったため、経費節約につながった。
次年度の物品費として、消耗品などの購入に使用する。
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