2023 Fiscal Year Research-status Report
Evo-Devo study of cerebellum-specific neurons using cyclostomes
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23K05881
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| Research Institution | Hyogo Medical University |
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Principal Investigator |
菅原 文昭 兵庫医科大学, 医学部, 准教授 (00611005)
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| Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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| Keywords | 小脳 / 円口類 / ヤツメウナギ / ヌタウナギ / 顆粒細胞 / プルキンエ細胞 / CRISPR/Cas9 / scRNA-seq |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本年度はまず、CRIPR/Cas9システムによるヤツメウナギ胚の遺伝子ノックダウン実験系の確立を目指した。ヤツメウナギ成体の雌雄から受精卵を得た後、１細胞期のうちにガイドRNAとCas9タンパクのマイクロインジェクションを行った。まず、実験系が成立しているのかを確認するために、表現型が目視できる遺伝子をポジティブコントロールとしてインジェクションを行い胚を培養したところ、インジェクション胚の大部分にノックダウンの効果が表れていると思しき表現型が確認できた。そこで今回の主題である小脳特異的ニューロン形成に必須とされる転写因子２種に対するガイドRNAを設計し、受精卵へのインジェクションを行った。胚は一定期間後成長させた後、一部をゲノム解析用に切り取り、脳を含む残りの組織をパラホルムアルデヒドで固定した。現在はこれらの胚の解析の準備を行っている。
ヤツメウナギのシングルセルRNA解析についての困難さのひとつに、組織の細胞を生きた状態で分離して、すぐに解析しなければならないということがある。ヤツメウナギ胚や成体を得られるのは１年のうち限られた期間であるため、この手法では制約が大きい。このため今回、細胞を固定しながら単一細胞に分離する手法ACME（ACetic-MEthanol）法が採用可能かを試みた。結果はまだ出ていないが、少なくとも血球細胞においてはその大部分を１細胞に分離した状態で固定することに成功している。
本研究に直接的・間接的に関与する報告として、原著論文４編、日本語総説１編が公開された。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
大学業務エフォートなどの変化により、まとまった実験の時間が確保できなかったため。
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| Strategy for Future Research Activity |
業務の効率化を図り、まとまった研究の従事時間を確保したい。必要であれば研究期間の延長申請も視野に入れたい。
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| Causes of Carryover |
大学業務エフォートに変化が生じたため、遂行すべき実験が一部遅れているため次年度使用額が生じている。当該年度に計画していた解析を行うための消耗品購入に充てる予定である。
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