2024 Fiscal Year Research-status Report
原発性胆汁性胆管炎の新たな病態解明と治療標的の同定を目指した臨床ゲノム解析
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23K07366
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| Research Institution | Department of Clinical Research, National Hospital Organization Nagasaki Medical Center |
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Principal Investigator |
中村 稔 独立行政法人国立病院機構(長崎医療センター臨床研究センター), 臨床研究センター, 客員研究員 (40217906)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
植野 和子 国立研究開発法人国立国際医療研究センター, 研究所, ゲノム医科学プロジェクト戸山プロジェクト 研究員 (00794512)
人見 祐基 国立研究開発法人国立国際医療研究センター, 研究所, 疾患ゲノム研究室長 (10525819)
西田 奈央 東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 准教授 (50456109)
相葉 佳洋 独立行政法人国立病院機構(長崎医療センター臨床研究センター), 臨床研究センター, 研究員 (70450955)
長崎 正朗 九州大学, 生体防御医学研究所, 教授 (90396862)
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| Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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| Keywords | 原発性胆汁性胆管炎 / ゲノムワイド関連解析 / トランスクリプトーム / 疾患感受性遺伝子 / 統合解析 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
原発性胆汁性胆管炎（PBC）の新たな病態解明と治療標的の同定を目的として、PBC症例のゲノムワイド関連解析(GWAS)、肝生検組織や末梢血のトランスクリプトーム解析、GWASとトランスクリプトームとの統合解析などを継続している。
今年度は、PBC症例の臨床情報とGWASやトランスクリプトームとの相関解析から、病態（胆管障害、肝細胞障害、免疫活動性、線維化、など）に特徴的な遺伝子変動を見出した。
これらのPBCで変動している遺伝子セットを用いて、pathway解析、上流・下流解析、肝生検組織の免疫染色、培養胆管細胞を用いたin vitroでの発現解析を行っている。その成果の一部はHepatology 2024, 80:776-790に発表した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
日本人PBC-GWAS解析症例数は計2,303症例, 健常人コントロール 5,692例、PBC-肝生検RNAseq解析140検体, PBC-末梢血RNAseq 解析145検体、さらにはPBC-末梢血DNA 全ゲノムシークエンス320症例が終了し、解析はほぼ順調に経過している。
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| Strategy for Future Research Activity |
さらに多数の検体を収集、解析を行い、臨床情報と遺伝子解析情報の揃った我が国で最大規模のPBCデータベースを構築する。
このデータベースを用いて、新たな病態ネットワークの解明方法を開発する。
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| Causes of Carryover |
今年度は、予想を上回る検体収集が終了し、来年度はその解析に予想を上回る費用を要することが予想されるため。
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[Journal Article] rs10924104 in the expression enhancer motif of CD58 confers susceptibility to human autoimmune diseases.2024
Author(s)
Hitomi Y, Ueno K, Aiba Y, Nishida N, Kawai Y, Kawashima M, Khor SS, Takada S, Iwabuchi C, Nagasaki M, Tokunaga K, Nakamura M.
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Journal Title
Hum Genet.
Volume: 143(1)
Pages: 19-33
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] Identification of PTPN2 as a susceptibility locus for primary biliary cholangitis by genome-wide association study.2024
Author(s)
人見祐基, 植野和子, 相葉佳洋, 西田奈央, 河野通大, 杉原実樹, 河合洋介, 川嶋実苗, Seik-Soon Khor, 石垣和慶, 長崎正朗, 徳永勝士, 中村 稔
Organizer
日本人類遺伝学会第69回大会
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[Presentation] 原発性胆汁性胆管炎の末梢血における網羅的遺伝子発現解析.2024
Author(s)
相葉佳洋, 植野和子, 人見祐基, 杉 和洋, 河野博孝, 長沼 篤, 万波智彦, 岩本 諭, 古田 清, 廣岡可奈, 小森敦正, 中村 稔.
Organizer
第61回日本消化器免疫学会総会.
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