心筋生検検体を用いたシングル核RNA-Seqと空間的解析による肥大型心筋症の病態解明

2023 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 23K07475
• Research Institution: Kanazawa University
• Principal Investigator: 吉田 昌平 金沢大学, 附属病院, 助教 (30623657)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 野村 征太郎 東京大学, 医学部附属病院, 特任准教授 (10722118) ; 野村 章洋 金沢大学, 融合科学系, 准教授 (30707542) ; 多田 隼人 金沢大学, 附属病院, 助教 (90623653)
• Project Period (FY): 2023-04-01 – 2026-03-31
• Keywords: 肥大型心筋症 / snRNA-Seq / 拡張相肥大型心筋症

Outline of Annual Research Achievements

当院で遺伝子を取得していた肥大型心筋症症例72症例に対してショートリード型の当院でのオリジナルパネル用いて遺伝子解析を行った。パネル内には47遺伝子（ACTC1、ACTN2、ALPK3、ANKRD1、BAG3、CAV3、CRYAB、CSRP3、DNAJC19、DES、DMD、DSC2、DSG2、DSP、EMD、FLNC、GAA、GLA、JPH2、JUP、LAMP2、LMNA、MYBPC3、MYH7、MYL2、MYL3、NEXN、OBSCN、PKP2、PLN、PRKAG2、RAF1、RBM20、SCN5A、SOS1、TAZ、TCAP、TMEM43、TNNC1、TNNI3、TNNT2、TPM1、TTN、TTR、VCL）を搭載しており、結果18症例にサルコメア遺伝子変異を同定することができた。その内訳としてはMYBPC3 6症例、MYH7 4症例、TNNI3 3症例、OBSCN3症例、TNNT2 1症例、MYL3 1症例であった。報告よりも遺伝子変異の割合が少なかったが、比較的壁肥厚の乏しい状況から症例が集積されており、そのためと考えられた。
MYBPC3変異症例、MYH7変異症例において拡張相肥大型心筋症症例が多く認められたが、サルコメア遺伝子変異が同定されない拡張相肥大型心筋症症例が3症例同定された。
RNA-laterに保存しているサルコメア遺伝子変異陰性、拡張相肥大型心筋症症例に対して、東京大学においてsnRNA-Seqを施行し、現在結果待ちの状況である。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

肥大型心筋症症例に対する遺伝子解析を終えた。
引き続きsnRNA-Seqを行う。

Strategy for Future Research Activity

snRNA-Seqの結果を検討するが、非常に生検の検体が小さく、細胞数が取れない可能性が実験の経過で指摘された。
採取可能であればその結果を踏まえて病理検体と併せて空間的な解析を行っていく。

Causes of Carryover

snRNA-Seqに関して東京大学での解析を行い、消耗品の支出はまだ行っていない。
次年度に繰り越した資金で支払いを行う予定である。