シングルセル解析を応用した大腸癌の糖鎖研究

2023 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 23K08136
• Research Institution: Fukushima Medical University
• Principal Investigator: 山田 玲央 福島県立医科大学, 医学部, 博士研究員 (80815100)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 岡山 洋和 福島県立医科大学, 医学部, 講師 (20583397)
• Project Period (FY): 2023-04-01 – 2026-03-31
• Keywords: 大腸癌 / 糖鎖

Outline of Annual Research Achievements

本研究は、シングルセル解析により数十万個の上皮系・間質系・免疫系シングルセルに対して個々に遺伝子プロファイルを解析し、新規の大腸癌サブグループを規定する糖鎖酵素遺伝子候補を抽出する。複数のシングルセルデータ集積と数千サンプル規模のバルクマルチオミクスによるバリデーションを経て、種々の解析プラットフォームおよびin vitroの実験系を駆使し、候補となる糖鎖遺伝子とその制御を受ける糖鎖分子について分子遺伝学的メカニズムの解明、免疫抑制的微小環境との関連づけ、究極的には臨床応用（バイオマーカー、標的治療）への展開を目指すものである。現在はデータ解析を主体としており、今後の各種実験の準備段階である。

Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

データ解析が膨大かつ複雑であること、などが研究のlimitationとなっており予備的検討段階にある。

Strategy for Future Research Activity

いくつかの糖鎖関連候補遺伝子について既存の報告を見直し、また公的データ解析、予備実験を行う。臨床検体を用いて免疫染色を行う。

Causes of Carryover

大規模なデータ解析が主体であったこと、当研究室ですでに確立した実験系が本研究の予備実験に流用可能であったことから、結果として新規の支出が抑えられた。次年度使用額は、消耗品費に充当する。