膠芽腫におけるドライバー遺伝子変異の空間的プロテオミクスへの基盤構築

2023 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 23K08546
• Research Institution: Kagoshima University
• Principal Investigator: 比嘉 那優大 鹿児島大学, 医歯学域医学系, 助教 (90792200)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 花谷 亮典 鹿児島大学, 医歯学域医学系, 教授 (60304424) ; 谷本 昭英 鹿児島大学, 医歯学域医学系, 教授 (10217151) ; 米澤 大 鹿児島大学, 医歯学域鹿児島大学病院, 講師 (50550076) ; 横山 勢也 鹿児島大学, 医歯学域医学系, 助教 (20569941) ; 濱田 大治 鹿児島大学, 医歯学域医学系, 助教 (30771480) ; 赤羽 俊章 鹿児島大学, 鹿児島大学病院, 特例助教 (70754480)
• Project Period (FY): 2023-04-01 – 2026-03-31
• Keywords: ゲノムプロファイル / 意義不明変異 / プロテオミクス解析

Outline of Annual Research Achievements

2021年WHO脳腫瘍分類が第5版に改訂され、遺伝子変異をはじめとする分子診断は必須となりつつあるため、がん「遺伝子パネル検査」は、膠芽腫の治療において重要である。しかしながら、このパネル検査結果から数多くの意義不明変異（variant of uncertain significance：VUS）が検出されていることから、病的変異に関するエビデンスの構築は喫緊の課題である。そこで本研究計画では、VUSの意義を解明するとともに、VUSから翻訳される蛋白質の組織内分布解析（空間的プロテオミクス解析）を行うことでVUSの分子生物学的および組織学的背景を明らかにすることを目的とする。解析対象の遺伝子としては予後不良因子としてPDGFRA遺伝子、予後良好因子としてEGFR遺伝子を抽出した。PDGFRA遺伝子変異は男性に多く、高齢という特徴を有していた。しかし、PDGFRA遺伝子変異を有する症例での検討では、細胞内ドメインに変異をもつ症例は女性に多く、細胞外ドメインに変異をもつ症例は男性に多いという特徴を有していた。また、EGFR遺伝子変異を有する症例の検討では、諸外国のコホートと比較して細胞内ドメインに変異をもつ割合が高いことが明らかとなった。以上より、遺伝子変異がどのドメインにあるかによって臨床学的背景が異なることが示唆された。

Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

解析は進んでおり、解析対象とする遺伝子変異の抽出および臨床学的背景の検討は行っている。しかし、本研究で重要な、VUSから翻訳される蛋白質の組織内分布解析に必要な抗体の選定や条件検討には至っていない。

Strategy for Future Research Activity

解析対象とする遺伝子変異の更なる抽出および臨床学的検討を行う。また蛋白質の組織内分布解析に必要な抗体の選定および条件検討を行い対象遺伝子から翻訳された蛋白質の発現状況を免疫染色で確認する。加えて、腫瘍辺縁部も解析を行い、腫瘍部および非腫瘍部の比較から遺伝子変異の位置関係や空間的（組織的）特異性および局在化の有無について検討する。