Probing intratumor heterogeneity and elucidating developmental mechanisms based on cancer-associated genetic mutations in ovarian endometrial carcinoma

2023 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 23K08857
• Research Institution: Kindai University
• Principal Investigator: 貫戸 明子 近畿大学, 医学部, 講師 (60550811)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 松村 謙臣 近畿大学, 医学部, 教授 (20452336) ; 村上 幸祐 近畿大学, 医学部, 講師 (60734671)
• Project Period (FY): 2023-04-01 – 2026-03-31
• Keywords: 卵巣がん / 類内膜がん / 腫瘍内不均一性 / PIK3CA / KRAS / CTNNB1

Outline of Annual Research Achievements

卵巣類内膜がんの腫瘍内不均一性について、がん関連遺伝子変異の不均一性をベースに探索しつつ、さらに類内膜がんの発生機序について明らかにすることを目標に研究を進めている。プレリミナリー研究で収集し、がん遺伝子変異パネル検査を行った卵巣類内膜がんサンプルのうち、当該年度は、変異ホットスポットを持つPIK3CA、KRAS、CTNNB1に着目し、これらの遺伝子変異を持つことがわかっているサンプルから、レーザーマイクロダイセクションの手法を用いて、空間的位置関係を考慮しながら腫瘍部分と間質部分を明確に分けてサンプリング（１検体につき12箇所程度）し、DNAを抽出した。非常に微量のDNAからでも変異を検出可能なdroplet digital PCRを用いて、マイクロダイセクションサンプルの変異の有無およびmutant allele frequencyを算出することに成功した。さらに、この中に、卵巣がんと子宮内膜がんの重複症例がいくつか含まれていることに着目した。重複がんの起源、クローナリティについて調べるため、重複がんの子宮内膜がん部位についても、同様にレーザーマイクロダイセクション、droplet digital PCRを行い、検討を行っている。また、CTNNB1変異について、droplet digital PCRによって得られた変異の分布と、免疫染色との整合性について調べるために、現在解析を進めている。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当該年度は、主にサンプリングとデータの収集を中心に行った。レーザーマイクロダイセクション、droplet digital PCRの技術も安定し、十分に解析可能なデータを獲得することができた。当初想定していた通りのペースであり、新たに検討すべき内容の進展も見えてきており、研究の進捗は概ね順調であると考えている。

Strategy for Future Research Activity

得られたデータから、不均一性の分布やクローナリティについて、腫瘍部分・間質部分の空間的な位置関係を元に解析を進めていく。必要に応じて、症例・サンプルの追加を行う。さらに、重複がんについて、卵巣部分・子宮内膜部分の変異を詳細に解析し、それぞれの関係性、起源について検討を進めることを目標とする。