2023 Fiscal Year Research-status Report
Identification of oral cancer neoantigens with proteogenomics HLA ligandome analysis
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23K09337
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| Research Institution | Sapporo Medical University |
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Principal Investigator |
宮本 昇 札幌医科大学, 医学部, 助教 (80749565)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
宮崎 晃亘 札幌医科大学, 医学部, 教授 (10305237)
金関 貴幸 札幌医科大学, 医学部, 講師 (50531266)
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| Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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| Keywords | HLAリガンドーム解析 / 免疫療法 / ネオアンチゲン / 口腔がん |
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| Outline of Annual Research Achievements |
ネオアンチゲンとは、がん細胞の遺伝子変異を含む抗原を指す。ネオアンチゲンは正常細胞には存在しないため、ネオアンチゲン反応性のT細胞は胸腺ネガティブセレクションで除去されず免疫寛容にはならず、免疫原性の高い抗原になる。免疫療法では標的が正常細胞にも発現しているとその細胞を攻撃してしまうため対象とならないが、ネオアンチゲンは腫瘍特異的であるためこの条件を既に満たしており、理想的な標的因子である。ネオアンチゲンの同定にはin silicoでペプチド配列を「予測」する方法が最も多く行われているが、実際にはHLAに提示されていない場合やT細胞免疫応答を誘導しないことが問題点として挙げられる。一方で、HLAリガンドーム解析法は、がん組織やがん細胞に解析対象のHLA特異的抗体を反応させ、免疫沈降した後にマススペクトロメトリーにて網羅的に解析する方法である。同定されるペプチド群は全て実際に提示されていることが最大の特徴である。HLAリガンドーム解析で対象となる遺伝子は網羅的解析で検出されたもののみであり、従来の方法ではデータベース登録されている既知のタンパク配列のみを検索対象としていた。そこで我々は、次世代シーケンサー解析を加える「プロテオゲノミクスHLAリガンドーム解析」を行うことで、遺伝子情報をベースに解析を行い、データベースにない配列も解析可能になり、ネオアンチゲンの同定が可能になった。今回、我々が培った解析技術を活用し、口腔がんにおけるネオアンチゲンのHLA提示と患者T細胞反応の実像を明らかにする。さらに免疫チェックポイント阻害剤(ICI)効果を検証し、口腔がんICI治療における新たなバイオマーカーの確立を目指す。がん組織及び血液の検体は採取済みであったが、他種の悪性腫瘍で蓄積された情報を元に、条件を変更し再収集している。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
条件に合った解析用の検体サンプルの収集、解析を新たに行っているため
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| Strategy for Future Research Activity |
サンプル収集の後、プロテオゲノミクスHLAリガンドーム 解析を行い、口腔がんにおけるネオアンチゲンのHLA提示と患者T細胞反応の実像を明らかにする
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| Causes of Carryover |
共同試薬の支出が予定より少なかったため
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[Journal Article] Three-Dimensional Spheroid Configurations and Cellular Metabolic Properties of Oral Squamous Carcinomas Are Possible Pharmacological and Pathological Indicators.2023
Author(s)
Sho Miyamoto, Nami Nishikiori, Tatsuya Sato, Megumi Watanabe, Araya Umetsu, Yuri Tsugeno, Fumihito Hikage, Takashi Sasaya, Hirotaka Kato, Kazuhiro Ogi, Masato Furuhashi, Hiroshi Ohguro, Akihiro Miyazaki
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Journal Title
Cancers (Basel).
Volume: 17
Pages: 2793-2793
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Exploring olfactory receptor family 7 subfamily C member 1 as a novel oral cancer stem cell target for immunotherapy.2023
Author(s)
Sho Miyamoto, Yoshihiko Hirohashi, Rena Morita, Akihiro Miyazaki, Kazuhiro Ogi, Takayuki Kanaseki, Kentaro Ide, Jumpei Shirakawa, Tomohide Tsukahara, Aiko Murai, Takashi Sasaya, Kazushige Koike, Shinichiro Kina, Toshihiro Kawano, Takahiro Goto, Edward Hosea Ntege, Yusuke Shimizu, Toshihiko Torigoe
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Journal Title
Cancer Sci.
Volume: 114(9)
Pages: 3496-3508
Peer Reviewed / Open Access
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