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2023 Fiscal Year Research-status Report

システイン糖鎖修飾酵素の探索と分子デザイン

Research Project

Project/Area Number 23K13887
Research InstitutionUniversity of Shizuoka

Principal Investigator

藤浪 大輔  静岡県立大学, 食品栄養科学部, 助教 (50805364)

Project Period (FY) 2023-04-01 – 2025-03-31
Keywords蛋白質工学 / 糖鎖修飾
Outline of Annual Research Achievements

翻訳後修飾の一つである糖鎖修飾はタンパク質の機能や安定性に寄与する。システインの側鎖にあるチオール基硫黄へ結合したS型糖鎖は、セリンまたはスレオニンの水酸基酸素に結合したO型糖鎖に比べて高い体内安定性や高生物活性を示す。S型糖鎖の化学合成において、S-Cグリコシド結合の立体制御が煩雑である。そこで申請者は酵素学的な手法により、S型糖鎖の効率的な調製を目指す。
酵素学的なS型糖鎖の調製に用いるための酵素を、ゲノムマイニングにより探索した。その結果、細菌Paenibacillus alvei に由来する糖転移酵素FlgGT1を発見した。生化学的な解析によりFlgGT1が鞭毛構成蛋白質であるHagを糖鎖修飾することが明らかになった。また、FlgGT1は様々な糖ヌクレオチドに対して広いドナー基質特異性を示すことが明らかになった。この性質は将来的な糖タンパク質工学において有用である。
FlgGT1のアクセプター基質特異性について、Hag変異体を用いてin vitroで評価した。その結果、FlgGT1がセリンまたはスレオニンの水酸基を標的とするO型糖転移酵素であることが明らかになった。一方、システインに対しては糖転移反応を示さなかった。このO型選択性のメカニズムを明らかにするために、FlgGT1の構造モデルを精査したところ、ヒスチジンが触媒塩基として機能することが示唆された。ヒスチジンのpKaがO型選択性を規定するという仮説を立てた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

FlgGT1の発見と生化学的解析を行うことができた。結果として、FlgGT1のS型糖転移活性を検出することはできなかった。今後は、蛋白質工学的なアプローチによりFlgGT1をS型糖転移酵素に改変する。

Strategy for Future Research Activity

ヒスチジンのpKaを変化させるために、これをヒスチジン様非典型アミノ酸に置換する。現在までに、δ-メチルヒスチジンと5-チアゾイルアラニン置換体を得ることができている。実験の過程で非典型アミノ酸の導入効率の低さが問題となった。導入効率を上げるために、アンバーサプレッション法のアミノアシルtRNA合成酵素をMjからMmへ、プラスミドをpEVOLからpDuleに変更することを検討する。

Causes of Carryover

非典型アミノ酸などの試薬の購入費に充てる

  • Research Products

    (6 results)

All 2024 2023

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 3 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] In Vitro Characterization of an O-Specific Glycosyltransferase Involved in Flagellin Glycosylation2024

    • Author(s)
      Fujinami Daisuke、Mizui Ayumi、Miyata Azusa、Ito Sohei
    • Journal Title

      ACS Chemical Biology

      Volume: 19 Pages: 992~998

    • DOI

      10.1021/acschembio.4c00045

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Catechol-O-methyltransferase and monoamine oxidase B inhibitory activities of Australian bee pollen2024

    • Author(s)
      Watanabe Chie、Yanagihara Aoi、Miyata Ryo、Mitsui Taichi、Honda Chihiro、Fujinami Daisuke、Kumazawa Shigenori
    • Journal Title

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1093/bbb/zbae041

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural and functional analysis of hyper-thermostable ancestral L-amino acid oxidase that can convert Trp derivatives to D-forms by chemoenzymatic reaction2023

    • Author(s)
      Kawamura Yui、Ishida Chiharu、Miyata Ryo、Miyata Azusa、Hayashi Seiichiro、Fujinami Daisuke、Ito Sohei、Nakano Shogo
    • Journal Title

      Communications Chemistry

      Volume: 6 Pages: 200

    • DOI

      10.1038/s42004-023-01005-1

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Structure Prediction and Genome Mining‐Aided Discovery of the Bacterial C‐Terminal Tryptophan Prenyltransferase PalQ2023

    • Author(s)
      Miyata Azusa、Ito Sohei、Fujinami Daisuke
    • Journal Title

      Advanced Science

      Volume: 11 Pages: 2307372

    • DOI

      10.1002/advs.202307372

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Residue-based correlation between equilibrium and rate constants is an experimental formulation of the consistency principle for smooth structural changes of proteins2023

    • Author(s)
      Kohda Daisuke、Hayashi Seiichiro、Fujinami Daisuke
    • Journal Title

      Biophysics and Physicobiology

      Volume: 20 Pages: e200046

    • DOI

      10.2142/biophysico.bppb-v20.0046

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Functional characterization of ribosomally synthesized peptides produced by Bifidobacterium infantis2023

    • Author(s)
      藤浪大輔
    • Organizer
      第23回日本蛋白質科学年会

URL: 

Published: 2024-12-25  

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