2023 Fiscal Year Research-status Report
腎間質線維芽細胞のエピゲノム多様性に着目した腎間質機能および腎臓病分子病態の解明
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23K14450
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| Research Institution | Tohoku University |
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Principal Investigator |
中井 琢 東北大学, 医学系研究科, 助教 (90971193)
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| Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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| Keywords | 線維芽細胞 / シングルセル / エピゲノム / エリスロポエチン |
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| Outline of Annual Research Achievements |
腎臓の間質には、線維芽細胞や週皮細胞などの多様な細胞が存在しており、実質組織の構造維持だけでなく、多彩な機能を有している。なかでも、腎皮質の尿細管間質線維芽細胞は、赤血球造血因子エリスロポエチン（EPO）を産生するが、申請者の研究からEPO産生能の点において尿細管間質線維芽細胞の多様性が見出されている。腎障害に伴って、尿細管間質線維芽細胞はEPO産生を停止し、筋線維芽細胞へ形質転換するが、病態環境において細胞集団によって異なる性質を示すことが明らかとなっている。
初年度は、多様な腎間質線維芽細胞集団の機能的な分類を目的に、トランスクリプトーム解析およびエピゲノム解析を実施した。腎間質線維芽細胞は、細胞数が少ないことやその脆弱性から、網羅的な解析が難しいが、少数の細胞からのトランスクリプトーム解析に成功した。遺伝子発現様式の解析から、EPO産生性線維芽細胞の特異的な性状および新規マーカーを明らかにすることができた。さらに、腎間質線維芽細胞集団の多様性を決定する分子機構を解明することを目的に、マウスから単離した単一細胞レベルおよび少数細胞でのエピゲノム解析を行なったものの、細胞収量が少なく、解析可能なデータを取得することができなかった。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
初年度は、多様な腎間質線維芽細胞集団の機能的な分類を目的に、トランスクリプトーム解析およびエピゲノム解析を実施した。腎間質線維芽細胞は、細胞数が少ないことやその脆弱性から、網羅的な解析が難しいが、少数の細胞からのトランスクリプトーム解析に成功した。遺伝子発現様式の解析から、EPO産生性線維芽細胞の特異的な性状および新規マーカーを明らかにすることができた。一方で、エピゲノム解析も実施したものの、細胞の収量や脆弱性から、解析に十分な品質のデータを取得することができてなかった。これより、当初予定していた進捗は得られていない。
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| Strategy for Future Research Activity |
トランスクリプトームデータの解析から、腎間質線維芽細胞の新規機能や腎臓病の分子病態に関与する遺伝子の探索に取り組む。候補遺伝子に対するin situハイブリダイゼーションや免疫染色を行い、生体内での発現を確認する。また、単離した腎間質線維芽細胞をex vivoで培養し、標的遺伝子に対する活性化剤あるいは阻害剤を添加する実験を行い、その機能を解明していく。また、エピゲノム解析については、細胞の単離方法や単離後の解析前処理などの条件検討を行い、引き続き解析を続けていく。
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| Causes of Carryover |
本研究計画ではマウスの使用を見込んでいるが、所属大学における動物施設の移転が予定より大幅に遅れたため、動物を使用する実験の進捗に遅れが生じた。マウス細胞を用いたシングルセル解析を予定通り実施することができなったため、次年度に予算を繰り越すこととなった。
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[Journal Article] Crosstalk between osygen signaling and iron metabolism in renal interstitial fibroblasts2024
Author(s)
Norio Suzuki, Yuma Iwamura, Koichiro Kato, Hirotaka Ishioka, Yusuke Konta, Koji Sato, Nao Uchida, Noa Koida, Hiroki Sekine, Tetsuhiro Tanaka, Nanori Kumagai, Taku Nakai
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Journal Title
Jouranl of Clinical Biochemistry and Nutrition
Volume: -
Pages: -
DOI
Peer Reviewed
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