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2023 Fiscal Year Annual Research Report

Biosynthesis of sequence-regulated polyesters and analysis of synthetic mechanism

Research Project

Project/Area Number 20H04368
Allocation TypeSingle-year Grants
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

松本 謙一郎  北海道大学, 工学研究院, 教授 (80360642)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2025-03-31
Keywordsバイオベースプラスチック
Outline of Annual Research Achievements

微生物産生ポリエステルであり生分解性プラスチックとして利用できるポリヒドロキシアルカン酸(PHA)の新規構造制御法を開発した。PHAの構造制御は、材料物性に直結する重要な技術課題である。申請者が独自に見出したPHA合成酵素により、非天然モノマーであるグリコール酸を含むブロック共重合体をポリマーを得ることができた。得られた共重合体は、同一分子内にランダム共重合体とホモポリマーセグメントを有する、特殊な配列構造を有していた。本成果はFrontiers in Bioengineering and Biotechnology誌で発表した。さらに、ブロック共重合体の化学構造の拡張に取り組んだ。使用している配列制御型重合酵素は、3-hydroxyhexanoate (3HHx)モノマーに弱い活性を有する。3HHxは材料に柔軟性を付与する性質がある事が知られ、PHAの重要な構成成分の一つである。そこで、進化工学的手法を用いて3HHxモノマーに対する活性が向上した変異体を創出した。こうして得られた新たな重合酵素を用いることで、3HHxモノマーから構成される新規ブロック共重合体を合成することができた。さらに本成果を構造類縁体である6-hydroxyhexanoate (6HHx)に応用し、これまでで最も6HHx分率の高いポリマーを合成することができた。これらの成果はBiomacromolecules誌で発表した。獲得した優良変異体を用いて、D型ポリ乳酸を含むブロック共重合体の合成にも初めて成功した(ACS Sus Chem Eng)。ブロック配列の合成機構を解明するため、独自に開発したNMR法およびreal-time NMR法を用いたin vitro解析を行った。その結果、2つのセグメントが合成される順序を明らかにした。本成果はBiophysical Chemistry誌で発表した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本研究課題では、ブロック共重合体の構造拡張と、合成機構の解明を目的としている。構造拡張では、3ーヒドロキシヘキサン酸、6-ヒドロキシヘキサン酸を含む共重合体、構造中にD型ポリ乳酸を含むブロック共重合体など、有用な物性が期待できる新規ポリマーの合成を複数達成した。また、合成機構解明についても、人工合成基質を用いたアッセイ系を順調に構築しており、間もなく結果が得られる見込みである。以上より、本研究課題は順調に進展していると言える。

Strategy for Future Research Activity

今後とくに力を入れて取り組むのは、ブロック配列の生成機構の解明である。
配列制御型重合酵素は、複数基質の混合物から自発的にブロック共重合体を合成する。これまでの研究で、3-hydroxybutyrate(3HB)と2-hydroxybutyrate(2HB)の二元共重合体をインビトロ合成し、生成物の構造を解析することで、本二元共重合体を合成する条件では、P(3HB)セグメントが先に重合されることが判明した。初期状態の重合酵素は2HB重合活性を示さず、P(3HB)重合後の酵素は2HB重合活性を示すことから、P(3HB)の重合が酵素の機能に影響を与え、2HBの重合を可能にしていることが分かった。また、この機能変化がブロック共重合体が自発的に生じる機構の一部であると考えられた。この知見に基づいて、P(3HB)の重合がなぜ酵素機能に影響を与えるのかを解明することに取り組む。重合酵素が3HBモノマーを重合する際、すべての分子が均一に重合反応を進行させるのではなく、一部の酵素分子のみが反応し、多くの酵素分子が未反応のままになる。したがって、2HBの重合を開始する際、機能変化した酵素分子としていない分子が混在することとなり、これにより正確に機能評価を行うことが困難となる。この問題を解決するため、人工合成プライマーを用いた酵素アッセイを実施する。プライマーは、末端の水酸基を除去した構造を有する3HB三量体である。プライマーを用いると、重合開始直後の状態で反応を一旦停止させることができる。その状態の酵素機能を評価することにより、上記の問題の解決を試みる。プライミング酵素に2HB重合活性があるかを評価し、次に、プライミング酵素に3HBを重合させ、2HB重合活性がどのように変化するか調べる。本手法により、重合酵素に2HB重合活性が生じる構造的要因を明らかにする。

  • Research Products

    (6 results)

All 2024 2023 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] HES-SO(スイス)

    • Country Name
      SWITZERLAND
    • Counterpart Institution
      HES-SO
  • [Journal Article] Toward the production of block copolymers in microbial cells: achievements and perspectives2024

    • Author(s)
      Matsumoto Ken’ichiro
    • Journal Title

      Applied Microbiology and Biotechnology

      Volume: 108 Pages: -

    • DOI

      10.1007/s00253-023-12973-8

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Engineering of the long-main-chain monomer-incorporating polyhydroxyalkanoate synthase PhaCAR for the biosynthesis of poly[(R)-3-hydroxybutyrate-co-6-hydroxyalkanoate]2024

    • Author(s)
      Yuka Hozumi, Shin-ichi Hachisuka, Hiroya Tomita, Hiroshi Kikukawa, Ken'ichiro Matsumoto
    • Journal Title

      iomacromolecules

      Volume: in press Pages: -

    • DOI

      10.1021/acs.biomac.4c00116

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] (R/S)-lactate/2-hydroxybutyrate dehydrogenases in and biosynthesis of block copolyesters by Ralstonia eutropha2023

    • Author(s)
      Ishihara Shizuru、Orita Izumi、Matsumoto Ken’ichiro、Fukui Toshiaki
    • Journal Title

      Applied Microbiology and Biotechnology

      Volume: 107 Pages: 7557~7569

    • DOI

      10.1007/s00253-023-12797-6

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Biosynthesis of High-Molecular-Weight Poly(d-lactate)-Containing Block Copolyesters Using Evolved Sequence-Regulating Polyhydroxyalkanoate Synthase PhaCAR2023

    • Author(s)
      Phan Hien Thi、Furukawa Shoko、Imai Koto、Tomita Hiroya、Isono Takuya、Satoh Toshifumi、Matsumoto Ken’ichiro
    • Journal Title

      ACS Sustainable Chemistry & Engineering

      Volume: 11 Pages: 11123~11129

    • DOI

      10.1021/acssuschemeng.3c01696

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Real-time NMR analysis of polyhydroxyalkanoate synthase reaction that synthesizes block copolymer comprising glycolate and 3-hydroxybutyrate2023

    • Author(s)
      Yanagawa Kengo、Kajikawa Ayaka、Sakakibara Sayaka、Kumeta Hiroyuki、Tomita Hiroya、Matsumoto Ken'ichiro
    • Journal Title

      Biophysical Chemistry

      Volume: 296 Pages: 107001~107001

    • DOI

      10.1016/j.bpc.2023.107001

    • Peer Reviewed

URL: 

Published: 2024-12-25  

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