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2022 Fiscal Year Annual Research Report

全ゲノム領域に共通した正確なDNA修復を保証するDSB修復経路選択機構の研究

Research Project

Project/Area Number 21H03596
Allocation TypeSingle-year Grants
Research InstitutionGunma University

Principal Investigator

柴田 淳史  群馬大学, 未来先端研究機構, 准教授 (30707633)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 山内 基弘  九州大学, アイソトープ統合安全管理センター(馬出地区), 准教授 (60437910)
宮成 悠介  金沢大学, ナノ生命科学研究所, 准教授 (60469608)
安原 崇哲  東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 助教 (90757056)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2025-03-31
KeywordsDNA修復 / 放射線 / クロマチン / 転写 / 染色体転座
Outline of Annual Research Achievements

放射線照射が誘発するDNA二本鎖切断(DSB)は重篤なDNA損傷の一つとされ、その修復の成否は細胞の運命決定に大きな影響を与える。ヒト細胞に生じたDSBは、非相同未端連結(NHEJ)または相同組換え(HR)のいずれかによって修復される。我々は、放射線照射直後、DSB近傍ではNHEJに適したコンパクトなクロマチン構造が構築され、HRの進行と伴にクロマチン構造が変化することで、NHEJからHRへの切り替えを促進していることを明らかにしてきた。そのクロマチン環境変化を制御する因子は53BP1であることが示唆されているが、その詳細な分子機構は未解明である。本研究では、細胞がどのようにしてクロマチン環境をNHEJからHRに適した構造へと変化させているのか、DSB発生から時間の経過と伴に局在を変化させる「53BP1 repositioning(再配置)」と呼ばれる現象に着目し、その分子機構の解明に迫る。昨年度、超高解像度蛍光顕微鏡3D-SIM(OMX)により53BP1を観察した結果、53BP1は複数のナノドメインを構成していることが明らかになった。我々が所有する53BP1変異体にて53BP1ナノドメインを解析した結果、特に53BP1-olimerization変異体にて53BP1ナノドメイン構築に異常が認められた。次に、環境変化が53BP1の集積に影響を及ぼすかどうか検討するため、pH変動、浸透圧変化の条件下において53BP1集積を解析した。その結果、53BP1が液液相分離により集積することと一致して、pH変動や浸透圧変化にて53BP1の集積が起こらなくなることが明らかになった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初の計画通り

Strategy for Future Research Activity

53BP1 repositioning(再配置)が起きた後に、修復経路がNHEJからHRへと切り替わる。その切り替えは分子レベルでは53BP1からRAP80への移行とされていることから、次年度は53BP1とRAP80の関係性について解析を進める。

  • Research Products

    (21 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 1 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 9 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Sussex(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      University of Sussex
  • [Int'l Joint Research] Tata Memorial Hospital(インド)

    • Country Name
      INDIA
    • Counterpart Institution
      Tata Memorial Hospital
  • [Int'l Joint Research] Dr.Cipto National General Hospital(インドネシア)

    • Country Name
      INDONESIA
    • Counterpart Institution
      Dr.Cipto National General Hospital
  • [Journal Article] Analysis of the relationship between LET, γH2AX foci volume and cell killing effect of carbon ions using high-resolution imaging technology2023

    • Author(s)
      Oike Takahiro、Kakoti Sangeeta、Sakai Makoto、Matsumura Akihiko、Ohno Tatsuya、Shibata Atsushi
    • Journal Title

      Journal of Radiation Research

      Volume: 64 Pages: 335~344

    • DOI

      10.1093/jrr/rrac098

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Calreticulin Upregulation in Cervical Cancer Tissues From Patients After 10 Gy Radiation Therapy2023

    • Author(s)
      Okada Kohei、Sato Hiro、Kumazawa Takuya、Mori Yasumasa、Permata Tiara Bunga Mayang、Uchihara Yuki、Noda Shin-ei、Suzuki Keiji、Ikota Hayato、Yokoo Hideaki、Gondhowiardjo Soehartati、Nakano Takashi、Ohno Tatsuya、Shibata Atsushi
    • Journal Title

      Advances in Radiation Oncology

      Volume: 8 Pages: 101159~101159

    • DOI

      10.1016/j.adro.2022.101159

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Carbon ion radiation and clustered DNA double-strand breaks2022

    • Author(s)
      Shibata Atsushi
    • Journal Title

      Enzymes

      Volume: 51 Pages: 117~130

    • DOI

      10.1016/bs.enz.2022.08.008

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Radiosensitization by the Selective Pan-FGFR Inhibitor LY28744552022

    • Author(s)
      Darwis Narisa Dewi Maulany、Horigome Eisuke、Li Shan、Adachi Akiko、Oike Takahiro、Shibata Atsushi、Hirota Yuka、Ohno Tatsuya
    • Journal Title

      Cells

      Volume: 11 Pages: 1727~1727

    • DOI

      10.3390/cells11111727

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] DNA damage promotes HLA class I presentation by stimulating a pioneer round of translation-associated antigen production2022

    • Author(s)
      Uchihara Yuki、Permata Tiara Bunga Mayang、Sato Hiro、Kawabata-Iwakawa Reika、Katada Sayako、Gu Wenchao、Kakoti Sangeeta、Yamauchi Motohiro、Kato Reona、Gondhowiardjo Soehartati、Hosen Naoki、Yasuhara Takaaki、Shibata Atsushi
    • Journal Title

      Molecular Cell

      Volume: 82 Pages: 2557~2570.e7

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2022.04.030

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 放射線治療と免疫チェックポイント阻害剤併用時の最適化を目指した基礎医学研究2023

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      第23回菅原・大西記念癌治療増感研究シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] Regulation of immune-ligand presentation in response to DNA damage.2023

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      The 19th Ataxia-Telangiectasia workshop
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 放射線照射後に生じるDNA損傷を起因とする腫瘍免疫応答の研究2022

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      QST病院講演
    • Invited
  • [Presentation] 教育講演 生物「放射線の細胞への影響」2022

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      日本放射線腫瘍学会第35回学術大会
    • Invited
  • [Presentation] DNA二本鎖切断修復の経路選択性に影響するクロマチン構造変化の解析2022

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
    • Invited
  • [Presentation] The mechanism underlying HLA Class I presentation in response to DNA damage2022

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      The 29th Federation of Asian and Oceanian Biochemists and Molecular Biologists Conference & the 2022 Chinese Society of Biochemistry and Molecular Biology Online Conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] DNA損傷に応答する免疫リガンド発現制御機構2022

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
    • Invited
  • [Presentation] 分子生物学に基づく放射線照射後の細胞応答の可視化2022

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      日本放射線影響学会第65回大会
    • Invited
  • [Presentation] DNA損傷応答により活性化される免疫リガンド発現制御機構2022

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      第3回若手人材育成セミナー
    • Invited
  • [Presentation] 放射線治療時に生じる DNA 損傷を起因とする腫瘍免疫応答の研究2022

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      第27回癌治療増感研究会 シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] DNA損傷により促進されるHLA Class I提示機構2022

    • Author(s)
      柴田 淳史
    • Organizer
      第9回DNA損傷応答ワークショップ Online
  • [Remarks] 柴田研究室

    • URL

      https://shibataxlab.com/

  • [Remarks] SHIBATA LAB

    • URL

      https://shibataxlab.com/english/

URL: 

Published: 2023-12-25  

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