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2021 Fiscal Year Annual Research Report

Investigation of the new factors regulating transcription-associated DNA double-strand break repair

Research Project

Project/Area Number 21H03597
Allocation TypeSingle-year Grants
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

安原 崇哲  東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 助教 (90757056)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2026-03-31
KeywordsDSB修復 / 転写 / R-loop / ゲノム安定性 / RAP80
Outline of Annual Research Achievements

ゲノム中の転写領域では、R-loop構造とよばれるDNA-RNAハイブリッド二重鎖と一重鎖DNAからなる特殊な核酸構造を起点としてDNA二重鎖切断(DSB)を正確に修復する。これまでに我々のグループは、S/G2期において転写共役型相同組換え修復がこれらのDSBを正確に修復していることを明らかにしてきた(Yasuhara et al. Cell 2018)。しかしながら、静止期においてこれらのDSBがどのように修復されているかについては分かっていなかった。転写共役型DSB修復に関連する新たな因子として、データベースを用いたスクリーニングから、ユビキチン鎖に結合する分子RAP80を同定した。RAP80欠損細胞ではR-loop構造の不安定化によるゲノム異常の増加が示唆されたため、一重鎖DNA部位の挙動の追跡を行った。その結果、RAP80欠損細胞ではR-loop内の一重鎖DNA部位が不安定化していることが判明した。つまり、RAP80が一重鎖DNAの安定化に寄与することが示された。また、このRAP80によるR-loopの安定化は、特に細胞周期のG1期においてBRCA1, Polθ, LIG1/3などが関与する転写共役型末端結合(TA-EJ)を誘導し、DSBを迅速に修復していることが明らかとなった。これらのことから、転写活性化部位に生じたDSBはR-loopを誘導するが、R-loop内の一重鎖DNAはRAP80の機能によってヌクレアーゼから保護され、TA-EJが転写活性化部位のゲノム安定性に重要な役割を果たしているというモデルが考えられた。ここまでのデータをまとめた論文を出版し、これらのモデルを提唱した(Yasuhara et al. Cell Rep 2022)。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

DSB誘導後にR-loop構造を保護するというRAP80の新たな機能を明らかにすることができた。

Strategy for Future Research Activity

本研究は「我々のゲノムの中で最も重要な転写部位でのゲノム異常の発生を阻止する、転写共役型DSB修復の分子メカニズムの解明」を目的とする。今年度は、転写共役型DSB修復に関連する因子のスクリーニングと、RAP80をDSB部位へ誘導する因子の同定を目指す。

  • Research Products

    (10 results)

All 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 1 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] マサチューセッツ総合病院(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      マサチューセッツ総合病院
  • [Int'l Joint Research] オックスフォード大学(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      オックスフォード大学
  • [Journal Article] RAP80 suppresses the vulnerability of R-loops during DNA double-strand break repair2022

    • Author(s)
      Yasuhara Takaaki、Kato Reona、Yamauchi Motohiro、Uchihara Yuki、Zou Lee、Miyagawa Kiyoshi、Shibata Atsushi
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 38 Pages: 110335~110335

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2022.110335

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Impacts of chromatin dynamics and compartmentalization on DNA repair2021

    • Author(s)
      Yasuhara Takaaki、Zou Lee
    • Journal Title

      DNA Repair

      Volume: 105 Pages: 103162~103162

    • DOI

      10.1016/j.dnarep.2021.103162

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] High linear energy transfer carbon-ion irradiation upregulates PD-L1 expression more significantly than X-rays in human osteosarcoma U2OS cells2021

    • Author(s)
      Permata Tiara Bunga Mayang、Sato Hiro、Gu Wenchao、Kakoti Sangeeta、Uchihara Yuki、Yoshimatsu Yukihiko、Sato Itaru、Kato Reona、Yamauchi Motohiro、Suzuki Keiji、Oike Takahiro、Tsushima Yoshito、Gondhowiardjo Soehartati、Ohno Tatsuya、Yasuhara Takaaki、Shibata Atsushi
    • Journal Title

      Journal of Radiation Research

      Volume: 62 Pages: 773~781

    • DOI

      10.1093/jrr/rrab050

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Mechanism of chromosome rearrangement arising from single-strand breaks2021

    • Author(s)
      Kot Palina、Yasuhara Takaaki、Shibata Atsushi、Hirakawa Miyako、Abe Yu、Yamauchi Motohiro、Matsuda Naoki
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 572 Pages: 191~196

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2021.08.001

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Genome maintenance by RNA-mediated stress responses2022

    • Author(s)
      Takaaki Yasuhara
    • Organizer
      The 12th International Symposium Gunma University Initiative for Advanced Research
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] RNAを介したゲノム安定性維持機構2021

    • Author(s)
      安原 崇哲
    • Organizer
      第26回DNA複製・組換え・修復ワークショップ
  • [Presentation] 核内凝集体を介したがんゲノム不安定性誘導機構2021

    • Author(s)
      安原 崇哲
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会年会
    • Invited
  • [Remarks] タンパク質の設計図を壊さないようにDNA切断を修復する新たな仕組みを発見

    • URL

      https://www.m.u-tokyo.ac.jp/news/press.html#20220202

URL: 

Published: 2022-12-28  

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