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2022 Fiscal Year Annual Research Report

Screening of the proteins involved in uptake of ubiquinone in Saccharomyces cerevisiae using synthetic ubiquinone probes

Research Project

Project/Area Number 22H02273
Allocation TypeSingle-year Grants
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

村井 正俊  京都大学, 農学研究科, 准教授 (80543925)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 奥 公秀  京都先端科学大学, バイオ環境学部, 准教授 (10511230)
青木 航  京都大学, 農学研究科, 助教 (10722184)
Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Keywordsユビキノン(コエンザイムQ) / ミトコンドリア / 光親和性標識 / 出芽酵母
Outline of Annual Research Achievements

“コエンザイム-Q”の名称で広く知られているユビキノン(UQ)は、ミトコンドリアにおける酸化的リン酸化(ATP生合成)に必須の脂溶性分子である。近年、UQはその生合成が完結するミトコンドリア内膜だけに留まるのではなく、細胞内の各所に輸送されてレドックスやエネルギー代謝の制御に関与することが示唆されている。しかし、UQの動態研究に威力を発揮する優れたプローブ分子が開発されていなかったことが一因となり、その全体像は明らかになっていない。本研究は、有機化学の視点から、UQの細胞内輸送に関与する一連のタンパク質を同定することで、UQの細胞内動態や多様な生理機能を理解する基盤の確立を目指すものである。

本研究の申請段階で、申請者は光反応性UQプローブ分子(pUQ5)を合成し、pUQ5が出芽酵母UQ欠損株(ΔCOQ2)の生育を効果的に相補することを見出していた。2022年度は、pUQ5で生育が相補されたΔCOQ2株に対して光親和性標識実験を行い、UQ取り込みに関与するタンパク質として、ミトコンドリア外膜のVDAC1および、内膜上の呼吸鎖複合体IVのサブユニットであるCOX3をを同定した。これら2つのタンパク質は外界に存在するUQが細胞質内に取り込まれ、ミトコンドリアに集積する過程で重要な役割を果たしている可能性が極めて高い。2023年度は、これら2つのタンパク質の生理的な意義について、生化学的あるいは遺伝学的なアプローチを通じて検証する予定である。上記の成果については、その方法論を含めて2023年度内に論文発表することを目指している。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

2022年度は、ユビキノンプローブ(pUQ5)で生育が相補されたΔCOQ2株に対して光親和性標識実験を行い、UQ取り込みに関与するタンパク質として、ミトコンドリア外膜のVDAC1および、内膜上の呼吸鎖複合体IVのサブユニットであるCOX3をを同定することができた。こうした結果から、研究は概ね順調に進展していると考えている。

Strategy for Future Research Activity

上記で言及した2つのタンパク質以外の候補タンパク質についても、探索を続けたいと考えている。分担研究者と連携しつつ、プロテオーム解析や遺伝学的なアプローチを取り入れて、さらに研究を深化させたいと思う。

  • Research Products

    (15 results)

All 2023 2022 Other

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (9 results) Remarks (3 results)

  • [Journal Article] Discovery of Bis-sulfonamides as Novel Inhibitors of Mitochondrial NADH-Quinone Oxidoreductase (Complex I)2023

    • Author(s)
      Tsuji Atsuhito、Masuya Takahiro、Arichi Norihito、Inuki Shinsuke、Murai Masatoshi、Miyoshi Hideto、Ohno Hiroaki
    • Journal Title

      ACS Medicinal Chemistry Letters

      Volume: 14 Pages: 211~216

    • DOI

      10.1021/acsmedchemlett.2c00504

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Diverse reaction behaviors of artificial ubiquinones in mitochondrial respiratory complex I2022

    • Author(s)
      Uno Shinpei、Masuya Takahiro、Zdorevskyi Oleksii、Ikunishi Ryo、Shinzawa-Itoh Kyoko、Lasham Jonathan、Sharma Vivek、Murai Masatoshi、Miyoshi Hideto
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 298 Pages: 102075~102075

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2022.102075

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Cryo-EM structures of Na+-pumping NADH-ubiquinone oxidoreductase from Vibrio cholerae2022

    • Author(s)
      Kishikawa Jun-ichi、Ishikawa Moe、Masuya Takahiro、Murai Masatoshi、Kitazumi Yuki、Butler Nicole L.、Kato Takayuki、Barquera Blanca、Miyoshi Hideto
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 13 Pages: 4082

    • DOI

      10.1038/s41467-022-31718-1

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] ミトコンドリア呼吸鎖複合体-Iを阻害するアセトゲニンの結合部位の同定2023

    • Author(s)
      西田美咲, 桝谷貴洋, 村井正俊, 三芳秀人
    • Organizer
      日本農薬学会第48回大会
  • [Presentation] コレラ菌Na+輸送性NADH-ユビキノン酸化還元酵素におけるユビキノン側鎖の結合部位の同定2023

    • Author(s)
      石川萌, 桝谷貴洋, 村井正俊, Nicole Butler, Blanca Barquera, 三芳秀人
    • Organizer
      日本農薬学会第48回大会
  • [Presentation] クライオ電子顕微鏡によるコレラ菌Na+輸送性NADH-ユビキノン酸化還元酵素の構造解明2023

    • Author(s)
      石川萌, 岸川淳一, 桝谷貴洋, 村井正俊, 北隅優希, Nicole Butler, 加藤貴之, Blanca Barquera, 三芳秀人
    • Organizer
      日本農芸化学会2023年度大会
  • [Presentation] ミトコンドリア呼吸鎖複合体-Iを阻害するアセトゲニンの結合部位の同定2023

    • Author(s)
      西田美咲, 桝谷貴洋, 村井正俊, 三芳秀人
    • Organizer
      日本農芸化学会2023年度大会
  • [Presentation] 人工キノン類を用いた呼吸鎖複合体-Iのキノン結合ポケットに関する研究2023

    • Author(s)
      生西凌, 大谷燎平, 桝谷貴洋, 村井正俊, 志波智生, 三芳秀人
    • Organizer
      日本農芸化学会2023年度大会
  • [Presentation] ミトコンドリア呼吸鎖複合体-Iにおける脱共役ユビキノン類の作用機構2023

    • Author(s)
      越高知生, 冨澤康平, 桝谷貴洋, 村井正俊, 三芳秀人
    • Organizer
      日本農芸化学会2023年度大会
  • [Presentation] クライオ電子顕微鏡を用いたコレラ菌Na+輸送性NADH-ユビキノン酸化還元酵素の構造解明2022

    • Author(s)
      石川萌, 岸川淳一, 桝谷貴洋, 村井正俊 , 北隅優希, Nicole L. Butler, 加藤貴之, Blanca Barquera, 三芳秀人
    • Organizer
      第60回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] コレラ菌Na+輸送性NADH-ユビキノン酸化還元酵素におけるユビキノン側鎖の結合部位の同定2022

    • Author(s)
      石川萌, 桝谷貴洋, 村井正俊, Nicole L. Butler, Blanca Barquera, 三芳秀人
    • Organizer
      日本生体エネルギー研究会第48回討論会
  • [Presentation] 人工キノン類を用いたミトコンドリア呼吸鎖複合体-I のユビキノン反応部位の特性解明2022

    • Author(s)
      桝谷貴洋, 宇野晋平, 越高知生, 生西凌, 富澤康平, 大谷燎平, 奥田健司, 村井正俊, 三芳秀人
    • Organizer
      日本生体エネルギー研究会第48回討論会
  • [Remarks] 所属研究室ホームページ

    • URL

      http://www.biofunc-chem.kais.kyoto-u.ac.jp

  • [Remarks] Researchmap

    • URL

      https://researchmap.jp/read0145924

  • [Remarks] Google Scholar

    • URL

      https://scholar.google.com/citations?user=I66ybkoAAAAJ&hl=ja

URL: 

Published: 2023-12-25  

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