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2022 Fiscal Year Annual Research Report

Towards the utilization of genetic resources in the original countries by using local rice varieties collected more than half-century ago

Research Project

Project/Area Number 22H02368
Allocation TypeSingle-year Grants
Research InstitutionKobe University

Principal Investigator

石井 尊生  神戸大学, 農学研究科, 教授 (20260648)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 齊藤 大樹  国立研究開発法人国際農林水産業研究センター, 熱帯・島嶼研究拠点, 主任研究員 (10536238)
佐藤 豊  国立遺伝学研究所, ゲノム・進化研究系, 教授 (40345872)
石川 亮  神戸大学, 農学研究科, 准教授 (70467687)
Project Period (FY) 2022-04-01 – 2026-03-31
Keywordsイネ / 在来品種 / 遺伝資源 / インドシナ諸国
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、半世紀以上前にインドシナ諸国で収集され、種子が国立遺伝学研究所で保存されていたイネ在来品種を研究対象とする。そして、当時インドシナ諸国の伝統的稲作を支えていた在来品種の実態を明らかにするとともに、原産国での遺伝資源としての復活を目指している。
本年度は、国立遺伝学研究所から分譲可能であった277系統の種子増殖を試みた。うち、231系統については自然状態での出穂期に関する予備調査を日本南端の石垣島で行った。また、インドシナ諸国(カンボジア、ベトナム、ラオス、タイ)を広くカバーする主要162系統については、葉よりDNAを抽出するとともに7つ種子形質(種子長、種子幅、種子厚、玄米長、玄米幅、玄米厚、100粒重)の調査を行った。さらに、籾殻の色、果皮の色および糯性についても調査した。種子形質に関しては14遺伝子座(GW2, GS2, qLGY3, GS3, GL3.1, TGW3, GS5, GW5, GS6, TGW6, GW6a, GLW7, GL7, GW8)でこれまで報告されている19種類の自然突然変異(insertion/deletion, SNP)の有無を特異的マーカーを用いてサーベイした。籾殻の色、果皮の色および糯性については、それぞれの主要遺伝子座(Bh4, Rc, Waxy)における機能喪失突然変異の有無を特異的マーカーによりサーベイした。これらのデータを比較することにより、種子形質と原因遺伝子の関係について解析した。
パスポートデータに関しては、主要162系統については精査し公表した。残りの系統については手元にある種子袋や報告書等の資料をもとに、全系統の検証を進めている。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

種子増殖、種子形質調査・解析およびパスポートデータの検証については、ほぼ計画通り終えている。

Strategy for Future Research Activity

主要162系統についてはすべて種子増殖を終えているので、それらを用いたいもち病検定の準備ができている。
種子増殖ができていない少数系統については、継続して対応する。
DNAサンプルは各系統から抽出済であるので、今後のマイクロサテライトマーカーを用いた多型調査に取りかかる準備ができている。

  • Research Products

    (2 results)

All 2022 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] CARDI(カンボジア)

    • Country Name
      CAMBODIA
    • Counterpart Institution
      CARDI
  • [Journal Article] Variations in Grain Traits among Local Rice Varieties Collected More Than Half-Century Ago in Indochinese Countries2022

    • Author(s)
      Lim Sathya、Onoda Anna、Orn Chhourn、Iwamoto Hiromu、Ishikawa Ryo、Saito Hiroki、Sato Yutaka、Ishii Takashige
    • Journal Title

      Plants

      Volume: 12 Pages: 133~133

    • DOI

      10.3390/plants12010133

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2023-12-25  

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