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2023 Fiscal Year Annual Research Report

Controlling tick-borne pathogens based on the tick symbionts

Research Project

Project/Area Number 22H02505
Allocation TypeSingle-year Grants
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

中尾 亮  北海道大学, 獣医学研究院, 准教授 (50633955)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Keywords吸血源動物 / 共生微生物 / マダニ / ヤマトマダニ / Coxiella / MIG-seq / GRAS-Di
Outline of Annual Research Achievements

マダニの吸血源動物の推定法として、脊椎動物の複数のハウスキーピング遺伝子を増幅し、その増幅産物をMiSeqにより解読するマルチプレックスDNAバーコーディング解析法を開発した。北海道の野外環境から採集したヤマトマダニの成虫を用いて試験したところ、タヌキ、キツネ、アライグマ、イヌ、鳥類などの配列が検出された。供試したマダニのうち、約10%の個体からのみ遺伝子増幅が見られた。マダニの吸血源動物推定研究の過去の報告よりは高い検出率を示したものの、マダニの吸血源動物相の全体像を把握するためには、さらに手法を改良することが必要であると考えられた。
国内のマダニ種において、極めて近縁な2種のチマダニ(Haemaphysalis)属マダニ(オオトゲチマダニ、ヤマトチマダニ)について、その微生物叢・ミトゲノム配列を比較した。その結果、両種においてCoxiella様共生菌を最優占の共生微生物種として検出された。一方で、多様性指数の比較では両者の明瞭な差が観察された。さらに、ミトゲノムに着目すると国内に分布するヤマトチマダニは2つの集団に大分されることが明らかとなった。
マダニ共生微生物とマダニ遺伝子型の関係性を把握するためのマダニ遺伝解析手法の検討として、ヤマトマダニを対象に解析を実施した。ゲノムワイドSNPsを抽出する目的で、Multiplexed ISSR Genotyping by sequencing(MIG-seq)法とGenotyping by Random Amplicon Sequencing-Direct(GRAS-Di)法を用いた。主成分分析の結果から、本邦ヤマトマダニ集団は地域的に維持され、集団間の交雑が少ないことが示唆された。特に、北海道由来マダニ集団と本州以南マダニ集団が明瞭に分離した。GRAS-Di法は分解が進んだDNAサンプルにおいても有効であることが示唆された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

マダニの吸血源動物の推定手法については、今後の改良が必要なものの一定の成果が得られた。マダニの遺伝解析手法の検討からは、MIG-seq法、GRAS-Di法、ミトゲノム解読のそれぞれの利点・欠点が整理でき、次年度以降の大規模な解析への基礎情報が得られた。共生微生物の分離や性状解析に有用な実験室維持マダニ株、マダニ細胞についても順調に整備が進んでいる。
以上のことから、課題研究は順調に進展していると評価する。

Strategy for Future Research Activity

マダニの吸血源動物の推定手法については改良を実施する。また、鳥類など特定の動物群を対象に絞った解析法への展開も検討する。これまでに蓄積した微生物叢データをもとに、マダニ細胞などを用いた共生微生物の分離・性状解析を進める。

  • Research Products

    (20 results)

All 2024 2023 Other

All Int'l Joint Research (6 results) Journal Article (8 results) (of which Int'l Joint Research: 7 results,  Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 3 results) Presentation (6 results) (of which Invited: 2 results)

  • [Int'l Joint Research] クイーンズランド大学/メルボルン大学(オーストラリア)

    • Country Name
      AUSTRALIA
    • Counterpart Institution
      クイーンズランド大学/メルボルン大学
  • [Int'l Joint Research] リバプール大学(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      リバプール大学
  • [Int'l Joint Research] ベルリン自由大学(ドイツ)

    • Country Name
      GERMANY
    • Counterpart Institution
      ベルリン自由大学
  • [Int'l Joint Research] リロングウェ農業天然資源大学(マラウイ)

    • Country Name
      MALAWI
    • Counterpart Institution
      リロングウェ農業天然資源大学
  • [Int'l Joint Research] ラトガース大学(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      ラトガース大学
  • [Int'l Joint Research]

    • # of Other Countries
      4
  • [Journal Article] Insights from entire mitochondrial genome sequences into the phylogeny of ticks of the genera Haemaphysalis and Archaeocroton with the elevation of the subgenus Alloceraea Schulze, 1919 back to the status of a genus2024

    • Author(s)
      Kelava Samuel、Apanaskevich Dmitry A.、Shao Renfu、Gofton Alexander W.、Mans Ben J.、Teo Ernest J. M.、Norval Gerrut、Barker Dayana、Nakao Ryo、Barker Stephen C.
    • Journal Title

      Medical and Veterinary Entomology

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1111/mve.12708

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Experimental demonstration of the transmission of Spiroplasma between different arthropod taxa2024

    • Author(s)
      Ogata Shohei、Hayashi Naoki、Eshita Yuki、Nagasawa Yasuha、Nonaka Nariaki、Nakao Ryo
    • Journal Title

      Journal of Medical Entomology

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1093/jme/tjae020

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Exploring genetic diversity and variation of Ovar-DRB1 gene in Sudan Desert Sheep using targeted next-generation sequencing2024

    • Author(s)
      Salim Bashir、Nakao Ryo、Chatanga Elisha、Marcuzzi Olivia、Eissawi Muna Ahmed、Almathen Faisal、Hanotte Olivier、Giovambattista Guillermo
    • Journal Title

      BMC Genomics

      Volume: 25 Pages: -

    • DOI

      10.1186/s12864-024-10053-3

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] The first cryptic genus of Ixodida, Cryptocroton n. gen. for Amblyomma papuanum Hirst, 1914: a tick of North Queensland, Australia, and Papua New Guinea2024

    • Author(s)
      Barker Stephen C.、Kelava Samuel、Mans Ben J.、Apanaskevich Dmitry A.、Seeman Owen D.、Gofton Alexander、Shao Renfu、Teo Ernest J. M.、Evasco Kimberley L.、Soennichsen KariI F.、Barker Dayana、Nakao Ryo
    • Journal Title

      Zootaxa

      Volume: 5410 Pages: 91~111

    • DOI

      10.11646/zootaxa.5410.1.5

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] A filarial parasite potentially associated with the health burden on domestic chickens in Japan2024

    • Author(s)
      Hayashi Naoki、Hosokawa Kumiko、Yamamoto Yu、Kodama Sachiko、Kurokawa Aoi、Nakao Ryo、Nonaka Nariaki
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 14 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41598-024-55284-2

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Dermacentor (Indocentor) auratus Supino 1897: Potential geographic range, and medical and veterinary significance2024

    • Author(s)
      Teo Ernest J.M.、Apanaskevich Dmitry A.、Barker Stephen C.、Nakao Ryo
    • Journal Title

      Acta Tropica

      Volume: 254 Pages: 107197~107197

    • DOI

      10.1016/j.actatropica.2024.107197

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Human-biting ticks and zoonotic tick-borne pathogens in North Africa: diversity, distribution, and trans-Mediterranean public health challenges2023

    • Author(s)
      Abdelbaset Abdelbaset Eweda、Kwak Mackenzie L.、Nonaka Nariaki、Nakao Ryo
    • Journal Title

      One Health

      Volume: 16 Pages: 100547~100547

    • DOI

      10.1016/j.onehlt.2023.100547

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] A new subgenus, Australixodes n. subgen. (Acari: Ixodidae), for the kiwi tick, Ixodes anatis Chilton, 1904, and validation of the subgenus Coxixodes Schulze, 1941 with a phylogeny of 16 of the 22 subgenera of Ixodes Latreille, 1795 from entire mitochondrial genome sequences2023

    • Author(s)
      Barker Stephen C.、Kelava Samuel、Heath Allen C. G.、Seeman Owen D.、Apanaskevich Dmitry A.、Mmans Ben J.、Shao Renfu、Gofton Alexander W.、Teo Ernest J. M.、Byrne Andrew F.、Ito Takuya、Tan Craig J.、Barker Dayana、Nakao Ryo
    • Journal Title

      Zootaxa

      Volume: 5325 Pages: 529~540

    • DOI

      10.11646/zootaxa.5325.4.4

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Utilising host-vector networks to identify high-risk vectors and forecast spillover pathways2024

    • Author(s)
      Mackenzie L. Kwak, Gregory Markowsky, Ryo Nakao
    • Organizer
      第71回 日本生態学会大会
    • Invited
  • [Presentation] ゲノム解析と統計モデリングから炙り出すマダニの潜在リスク2023

    • Author(s)
      中尾亮
    • Organizer
      第39回日本臨床皮膚科医会総会・臨床学術大会
    • Invited
  • [Presentation] 札幌近郊の公園におけるヤマトマダニIxodes ovatus の形態特徴、遺伝子型、保有微生物叢の解析2023

    • Author(s)
      丹羽志萌、田谷友里恵、伊藤萌林、尾針由真、佐鹿万里子、松野啓太、野中成晃、中尾亮
    • Organizer
      第30回ダニと疾患のインターフェースに関するセミナー
  • [Presentation] Ticks and tick-bites in Singapore: a national overview2023

    • Author(s)
      Mackenzie L. Kwak, Ryo Nakao
    • Organizer
      第30回ダニと疾患のインターフェースに関するセミナー
  • [Presentation] Systematic review and meta-analysis of tick-bite cases in Japan between 2006-20232023

    • Author(s)
      Paula Andrea Jimenez, Mackenzie Kwak, Nariaki Nonaka, Ryo Nakao
    • Organizer
      第30回ダニと疾患のインターフェースに関するセミナー
  • [Presentation] 旗振り法により採集困難なマダニの採集法2023

    • Author(s)
      田谷友里恵、Mackenzie L. Kwak、永谷奈央、小方昌平、丹羽志萌、白木雄翔、尾針由真、綿貫豊、野中成晃、中尾亮
    • Organizer
      第30回ダニと疾患のインターフェースに関するセミナー

URL: 

Published: 2024-12-25  

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