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2022 Fiscal Year Annual Research Report

バクテリアべん毛輸送ゲート蛋白質FlhAによる選択的蛋白質輸送のしくみの解明

Research Project

Project/Area Number 22H02573
Allocation TypeSingle-year Grants
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

南野 徹  大阪大学, 大学院生命機能研究科, 准教授 (20402993)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Keywords電子顕微鏡 / 細菌 / 蛋白質
Outline of Annual Research Achievements

細菌の運動器官であるべん毛を作るために必要な蛋白質輸送装置はべん毛の構築過程に応じて輸送基質特異性を段階的にスイッチする。さらに、べん毛輸送装置は細菌のライフサイクルや環境変化に応じて自身の作動機構を巧みに切り替える。本研究は、このように極めてユニークな輸送装置の機能を担っているFlhAの動作機構を徹底的に究明することを目的とする。本年度の主な成果は以下に示す。
flhA変異株の機能解析から、FlhAのC末細胞質ドメイン(FlhAc)に存在するGYXLIモチーフの構造変化により、輸送装置の基質認識モードがフック型から繊維型へスイッチすること、FlhAcの構造変化はFliKやATPaseリング複合体に依存することが明らかとなった。FlgK, FlgL, FliC, FliDの4種類の蛋白質は繊維型輸送基質蛋白質で、フックが完成した後に、FlgK, FlgL, FliD, FliCの順番で運び出される。FlhAcの404番目のバリン残基がメチオニンに変異すると、FliCは効率よく輸送されたが、FlgK, FlgL, FliDはほとんど輸送されなかった。以上の結果から、V404M変異により繊維型タンパク質に対してFlhAcの基質特異性が大きく変化することが示唆された。
輸送装置に装備されている膜電位センサーを同定するために、ΔfliH-fliI flhB(P28T)変異体から膜電位依存性が変化した変異体を多数単離した。DNAシーケンス解析から、膜電位センサーはFlhAに加え、FlhBにも装備されていることが示唆された。
クライオ集束イオンビーム走査型電子顕微鏡を用いて、観察に適したサルモネラの薄層を作製する為の様々な条件検討を行った結果、150μmまで薄く削る方法を確立した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

変異体解析から、FlhAcによる基質認識とその選別のしくみを概ね明らかにすることができた。さらに、輸送装置に装備されている膜電位センサーを同定できた。計画当初から大幅に遅れていたが、2023年8月末までに観察に適したサルモネラの薄層を作製する条件をほぼ決定することができた。

Strategy for Future Research Activity

膜電位依存性が変化したflhAおよびflhB変異体の機能解析を進めるとともに、クライオ電子線トモグラフィー法により、FlhAが実際に働いている現場での構造解析を実施する。

  • Research Products

    (16 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 5 results) Presentation (5 results) Book (1 results)

  • [Int'l Joint Research] ユタ大学(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      ユタ大学
  • [Int'l Joint Research] 南京農業大学(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      南京農業大学
  • [Journal Article] Loss of Flagella-Related Genes Enables a Nonflagellated, Fungal-Predating Bacterium To Strengthen the Synthesis of an Antifungal Weapon2023

    • Author(s)
      Xiong Dan、Yang Zixiang、He Xueting、He Weimei、Shen Danyu、Wang Lu、Lin Long、Murero Aprodisia、Minamino Tohru、Shao Xiaolong、Qian Guoliang
    • Journal Title

      Microbiology Spectrum

      Volume: 11 Pages: e04149-22

    • DOI

      10.1128/spectrum.04149-22

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Purification of the Transmembrane Polypeptide Channel Complex of the Salmonella Flagellar Type III Secretion System2023

    • Author(s)
      Kinoshita Miki、Namba Keiichi、Minamino Tohru
    • Journal Title

      Methods in Molecular Biology

      Volume: 2646 Pages: 3~15

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-3060-0_1

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Measurements of the Ion Channel Activity of the Transmembrane Stator Complex in the Bacterial Flagellar Motor2023

    • Author(s)
      Morimoto Yusuke V.、Minamino Tohru
    • Journal Title

      Methods in Molecular Biology

      Volume: 2646 Pages: 83~94

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-3060-0_8

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] High-Resolution Rotation Assay of the Bacterial Flagellar Motor Near Zero Loads Using a Mutant Having a Rod-Like Straight Hook2023

    • Author(s)
      Nakamura Shuichi、Minamino Tohru
    • Journal Title

      Methods in Molecular Biology

      Volume: 2646 Pages: 125~131

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-3060-0_11

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Insight Into Distinct Functional Roles of the Flagellar ATPase Complex for Flagellar Assembly in Salmonella2022

    • Author(s)
      Minamino Tohru、Kinoshita Miki、Namba Keiichi
    • Journal Title

      Frontiers in Microbiology

      Volume: 13 Pages: 864178

    • DOI

      10.3389/fmicb.2022.864178

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Membrane Voltage-dependent Activation of the Transmembrane Export Gate Complex in the Bacterial Flagellar Type III Secretion System2022

    • Author(s)
      MINAMINO Tohru、KINOSHITA Miki、MORIMOTO Yusuke V.、NAMBA Keiichi
    • Journal Title

      Seibutsu Butsuri

      Volume: 62 Pages: 165~169

    • DOI

      10.2142/biophys.62.165

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Conserved GYXLI Motif of FlhA Is Involved in Dynamic Domain Motions of FlhA Required for Flagellar Protein Export2022

    • Author(s)
      Minamino Tohru、Kinoshita Miki、Inoue Yumi、Kitao Akio、Namba Keiichi
    • Journal Title

      Microbiology Spectrum

      Volume: 10 Pages: e01110-22

    • DOI

      10.1128/spectrum.01110-22

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Activation mechanism of the bacterial flagellar dual-fuel protein export engine2022

    • Author(s)
      Minamino Tohru、Kinoshita Miki、Morimoto Yusuke V.、Namba Keiichi
    • Journal Title

      Biophysics and Physicobiology

      Volume: 19 Pages: e190046

    • DOI

      10.2142/biophysico.bppb-v19.0046

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Role of the cytoplasmic ATPase complex in export switching of the flagellar protein export apparatus2023

    • Author(s)
      Minamino T, Kinoshita M, Namba K.
    • Organizer
      日本細菌学会
  • [Presentation] ビブリオ菌由来のFliKとFlhBはサルモネラのIII型輸送装置の基質特異性を切り替えることができる (Vibrio FliK and FlhB homologs can switch the substrate specificity of the Salmonella type III protein export apparatus)2023

    • Author(s)
      南野徹, 木下実紀, 難波啓一
    • Organizer
      べん毛研究交流会
  • [Presentation] サルモネラIII型輸送装置のポリペプチドチャネル複合体の形成機構 (Assembly mechanism of the polypeptide channel complex of the Salmonella type III protein export apparatus)2023

    • Author(s)
      木下実紀, 宮田知子, 牧野文信, 難波啓一, 南野徹
    • Organizer
      べん毛研究交流会
  • [Presentation] Highly conserved GYXLI motif of FlhA is directly involved in hierarchical flagellar protein export in Salmonella2022

    • Author(s)
      Minamino T, Kinoshita M, Namba K.
    • Organizer
      日本生物物理学会
  • [Presentation] べん毛 III 型輸送 ATPase 複合体の構造変化と作動機構 (Structural change of the ATPase ring complex of the flagellar Type III export apparatus)2022

    • Author(s)
      Usui A, Yano T, Tajima Y, Takekawa N, Kinoshita M, Minamino T, Uchihashi T, Imada K.
    • Organizer
      日本生物物理学会
  • [Book] Bacterial and Archaeal Motility2023

    • Author(s)
      Minamino T , Miyata M, Namba K
    • Total Pages
      405
    • Publisher
      Humana Press

URL: 

Published: 2024-12-25  

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