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2022 Fiscal Year Annual Research Report

活性酸素種による緑藻の光走性調節分子機構とその生理的意義の解明

Research Project

Project/Area Number 22H02642
Allocation TypeSingle-year Grants
Research InstitutionKyoto Sangyo University

Principal Investigator

若林 憲一  京都産業大学, 生命科学部, 教授 (80420248)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 田中 寛  東京工業大学, 科学技術創成研究院, 教授 (60222113)
Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Keywordsクラミドモナス / 光走性 / ROS
Outline of Annual Research Achievements

我々は緑藻クラミドモナスの光走性の正負が細胞質の活性酸素種(ROS)量に応じて調節されることを明らかにした。これを可能にする分子機構は何か?そして、この制御機構には光合成生物にとってどのような生理的意義があるのか?これらの未解明問題を解決することが本研究の目的である。
令和4年度は以下の2つを柱にした研究を行った。
①負の走光性しか示せない変異株の原因遺伝子の解析を行った。その結果、これがある種のキナーゼであることがわかった。抗体を作成して局在などを調べたが、発現量が少ないのか、明らかにすることができなかった。引き続き、リン酸化反応の標的同定実験に入った。
②ROSセンサーの導入実験を行った。市販のH2O2センサーを導入したが、高発現株が得られなかった。そこで、先行研究で開発されたクラミドモナス用のH2O2センサーを導入することとして、いくつかの細胞内コンパートメントに局在させるための発現ベクターを入手し、導入実験を開始した。
これらの研究を行う途中で藻類培養インキュベーターが故障したため、繰越を余儀なくされた。
令和5年度は修理されたインキュベーターを用いて上記実験を継続して行うとともに、計画のもう1つの柱である③ストレスのある環境下での光走性が生残性への寄与の検証に着手した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

インキュベーター故障による遅れはあったものの、初年度に予定していた実験は、予想していた困難も含めて、おおむね計画通りに進行した。

Strategy for Future Research Activity

キナーゼのターゲット絞り込み、ROSセンサーの導入、光走性の意義検証実験をそれぞれ並行して行う。

  • Research Products

    (42 results)

All 2024 2023 2022

All Journal Article (10 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 10 results,  Open Access: 3 results) Presentation (30 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Invited: 1 results) Book (2 results)

  • [Journal Article] Cells collectively migrate during ammonium chemotaxis in Chlamydomonas reinhardtii2023

    • Author(s)
      G. Nelson, A. Strain, A. Isu, A. Rahnama, K. Wakabayashi, A. T. Melvin, N. Kato
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 13 Pages: 10781

    • DOI

      10.1038/s41598-023-36818-6

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Mechanoresponses mediated by the TRP11 channel in cilia of Chlamydomonas reinhardtii2023

    • Author(s)
      D. Oshima, M. Yoshida, K. Saga, N. Ito, M. Tsuji, A. Isu, N. Watanabe, K. Wakabayashi, K. Yoshimura
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 26 Pages: 107926

    • DOI

      10.1016/j.isci.2023.107926

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Molecular bulkiness of a single amino acid in the F1 α subunit determines the robustness of cyanobacterial ATP synthase2023

    • Author(s)
      A. Machida, K. Kondo, K. Wakabayashi, K. Tanaka, T. Hisabori
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: 64 Pages: 1590-1600

    • DOI

      10.1093/pcp/pcad109

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Two specific domains of the γ subunit of chloroplast FoF1 provide redox regulation of the ATP synthesis through conformational changes2023

    • Author(s)
      Akiyama, K., Ozawa, S., Takahashi, Y., Yoshida, K., Suzuki, T., Kondo, K., Wakabayashi, K., Hisabori, T.
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

      Volume: 120 Pages: _e2218187120

    • DOI

      10.1073/pnas.2218187120

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The importance of the C-terminal Cys pair of phosphoribulokinase in phototrophs in thioredoxin-dependent regulation2022

    • Author(s)
      Fukui, K., Yoshida, K., Yokochi, Y., Sekiguchi, T., Wakabayashi, K., Hisabori, T., Mihara, S.
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: 63 Pages: 855-868

    • DOI

      10.1093/pcp/pcac050

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Verification of the relationship between redox regulation of thioredoxin target proteins and their proximity to thylakoid membranes2022

    • Author(s)
      Fukushi, Y., Yokochi, Y., Wakabayashi, K., Yoshida, K., Hisabori, T.
    • Journal Title

      Antioxidants

      Volume: 11 Pages: 773

    • DOI

      10.3390/antiox11040773

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Reactivation of demembranated cell model in Chlamydomonas reinhardtii2022

    • Author(s)
      Ueki N., Isu A., Wakabayashi, K.
    • Journal Title

      Journal of Visualized Experiments

      Volume: ー Pages: e63869

    • DOI

      10.3791/63869

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Observation of Photobehavior in Chlamydomonas reinhardtii2022

    • Author(s)
      Ueki N., Isu A., Kyuji A., Asahina Y., So S., Takahashi R., Hisabori T., Wakabayashi K.
    • Journal Title

      Journal of Visualized Experiments

      Volume: ー Pages: e63961

    • DOI

      10.3791/63961

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dissipation of the proton electrochemical gradient in chloroplasts promotes the oxidation of ATP synthase by thioredoxin-like proteins2022

    • Author(s)
      Sekiguchi, T., Yoshida, K., Wakabayashi, K., Hisabori, T.
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 298 Pages: 102541

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2022.102541

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Changes in intracellular energetic and metabolite states due to increased galactolipid levels in Synechococcus elongatus PCC 7942.2022

    • Author(s)
      Kondo, K., Yoshimi, R., Apdila, E.G., Wakabayashi, K., Awai, K., Hisabori, T.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 13 Pages: 259

    • DOI

      10.1038/s41598-022-26760-4

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] ボルボックス目におけるレイノルズ数の増加に適応した光誘起繊毛反応の進化2024

    • Author(s)
      植木紀子、若林憲一
    • Organizer
      生体運動研究合同班会議
  • [Presentation] クラミドモナス走光性符号異常株から繊毛運動調節機構を紐解く2024

    • Author(s)
      坂本一馬、森下純、猪川玲夫、上野恵資、苗加彰、植木紀子、若林憲一
    • Organizer
      生体運動研究合同班会議
  • [Presentation] Isolation and analysis of non-phptotactic mutants that show alternate ciliary beatings in Chlamydomonas reinhardtii2023

    • Author(s)
      Kazuma Sakamoto, Akira Noga, Keisuke Ueno, Toru Hisabori, Ken-ichi Wakabayashi
    • Organizer
      The 20th International Conference on the Cell and Molecular Biology of Chlamydomonas
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Relationship between photoreaction patterns of cilia and size evolution in Vovocales2023

    • Author(s)
      Noriko Ueki, Ken-ichi Wakabayashi
    • Organizer
      The 20th International Conference on the Cell and Molecular Biology of Chlamydomonas
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Transition of photoresponse styles in cilia as a function of Reynolds number in Volvocales2023

    • Author(s)
      Noriko Ueki, Ken-ichi Wakabayashi
    • Organizer
      The 7th International Volvox Comference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Reynolds-number-dependent ciliary regulation in the swimming green algae Volvocales2023

    • Author(s)
      Noriko Ueki, Ken-ichi Wakabayashi
    • Organizer
      第61回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] クラミドモナス除膜細胞モデル運動再活性化実験のコツ2023

    • Author(s)
      若林憲一、植木紀子
    • Organizer
      第17回クラミドモナス研究会
  • [Presentation] 緑藻クラミドモナスの 2 本の繊毛間における異種ダイニン間相互作用の相違2023

    • Author(s)
      猪川玲夫、高野和歌子、時田将嵩、若林憲一
    • Organizer
      第17回クラミドモナス研究会
  • [Presentation] ボルボックス目の多細胞化に伴う流体環境の変化とそれに対する適応2023

    • Author(s)
      植木紀子、若林憲一
    • Organizer
      第17回クラミドモナス研究会
  • [Presentation] クラミドモナスの過酸化水素に対する走化性の検証2023

    • Author(s)
      高野真由、前川優太、植木紀子、若林憲一
    • Organizer
      第17回クラミドモナス研究会
  • [Presentation] ボルボックスからの繊毛の単離2023

    • Author(s)
      苗加彰、植木紀子、若林憲一
    • Organizer
      第17回クラミドモナス研究会
  • [Presentation] 外腕ダイニン Ca2+結合軽鎖 LC4 欠損株の 2 本の繊毛の非同調運動2023

    • Author(s)
      上野恵資、久次史花、植木紀子、柴小菊、稲葉一男、若林憲一
    • Organizer
      第17回クラミドモナス研究会
  • [Presentation] 軸糸外腕ダイニンのチオレドキシン様軽鎖の機能2023

    • Author(s)
      久次史花, 小板橋亮矩, 宋叡陽, 柳沢春明, 山野隆志, 吉川雅英, 福澤秀哉, 久堀徹, 若林憲一
    • Organizer
      生体運動研究合同班会議
  • [Presentation] TRPチャネルの機械受容による繊毛運動の制御2023

    • Author(s)
      嵯峨康佑, 大島大地, 吉田愛美, 井須敦子, 若林憲一, 吉村建二郎
    • Organizer
      生体運動研究合同班会議
  • [Presentation] 緑藻クラミドモナスにおける_光性符号変動と_化性2023

    • Author(s)
      前川優太、朝比奈佑磨、高野真由、久堀徹、若林憲一
    • Organizer
      第16回クラミドモナス研究会
  • [Presentation] 軸糸外腕ダイニンのチオレドキシン様軽鎖の機能2023

    • Author(s)
      久次史花, 小板橋亮矩, 宋叡陽, 柳沢春明, 山野隆志, 吉川雅英, 福澤秀哉, 久堀徹, 若林憲一
    • Organizer
      第16回クラミドモナス研究会
  • [Presentation] カルシウム依存性カリウムチャネル KCA1 による脱繊_の抑制2023

    • Author(s)
      高橋里奈、朝比奈佑磨、宇佐美曉俊、内山志織 、箕浦高子 、吉村建二郎、久堀徹 、若林憲一
    • Organizer
      第16回クラミドモナス研究会
  • [Presentation] クラミドモナスのグライディング開始に必要な TRP チャネル2023

    • Author(s)
      伊藤音緒, 井須敦子, 若林憲一, 吉村建二郎
    • Organizer
      第16回クラミドモナス研究会
  • [Presentation] Involvement of Chloroplast-localized Trx-like proteins in the Regulation of Non-Photochemical Quenching inArabidopsis thaliana2023

    • Author(s)
      Yuka Fukushi, Yuichi Yokochi, Ken-ichi Wakabayashi, Keisuke Yoshida, Toru Hisabori
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] PSI 光防御における PGRL1 の機能解析2023

    • Author(s)
      高橋拓子 、高山健太、井須敦子、若林憲一、久堀徹、西山佳孝
    • Organizer
      第17回クラミドモナス研究会
  • [Presentation] Photobehavior in the Volvocales green algae with different cell numbers: Chlamydomonas, Tetrabaena, and Volvox2022

    • Author(s)
      Ken-ichi Wakabayashi
    • Organizer
      One-day workshop on the cellular level ethological dynamics towards “proto-intelligence”
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] The four-celled Volvocales green alga_Tetrabaena socialis_exhibits weak photobehavior and high-photoprotection ability2022

    • Author(s)
      Asuka Tanno, Yoko Arakaki, Noriko Ueki, Ryutaro Tokutsu, Jun Minagawa, Kenjiro Yoshimura, Toru Hisabori, Hisayoshi Nozaki and Ken-ichi Wakabayashi
    • Organizer
      International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast Regulation
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Oxidative regulation of chloroplast ATP synthase by thioredoxin-like proteins2022

    • Author(s)
      Takatoshi Sekiguchi, Keisuke Yoshida, Ken-ichi Wakabayashi, Toru Hisabori
    • Organizer
      International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast Regulation
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] TrxおよびTrx様タンパク質による葉緑体タンパク質の酸化制御2022

    • Author(s)
      福士結香, 横地佑一, 吉田啓亮, 若林憲一, 久堀徹
    • Organizer
      第12回日本光合成学会年会
  • [Presentation] シアノバクテリアATP合成酵素αサブユニットのY252C変異2022

    • Author(s)
      町田亮人,近藤久益子,若林憲一,久堀徹
    • Organizer
      第12回日本光合成学会年会
  • [Presentation] シアノバクテリアSynechococcus elongatus PCC 7942のチラコイド膜脂質合成経路の改変による細胞内の変化2022

    • Author(s)
      近藤久益子,吉見里奈, Egi Tritya Apdila, 若林憲一,粟井光一郎, 久堀徹
    • Organizer
      第12回日本光合成学会年会
  • [Presentation] クラミドモナス繊毛交互打ち変異株の単離と解析2022

    • Author(s)
      坂本一馬, 井須敦子, 久堀徹, 若林憲一
    • Organizer
      日本動物学会第93回大会
  • [Presentation] Analysis of a Chlamydomonas mutant showing alternate ciliary beatings2022

    • Author(s)
      坂本一馬, 井須敦子, 久堀徹, 若林憲一
    • Organizer
      第60回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] Trx様タンパク質による葉緑体ATP合成酵素の不活性化制御2022

    • Author(s)
      関口敬俊, 吉田啓亮, 若林憲一, 久堀徹
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
  • [Presentation] 葉緑体ATP合成酵素のレドックス制御機構:γサブユニットのβ-hairpin構造とRedox loop構造の協調と活性調節2022

    • Author(s)
      秋山健太郎、小澤真一郎、高橋裕一郎、若林憲一、久堀徹
    • Organizer
      第48回日本生体エネルギー研究会
  • [Book] 分子細胞生物学 第9版2023

    • Author(s)
      Lodish,Berk,Kaiser,Krieger,Bretscher, Ploegh, Martin, Yaffe, Amon著,堅田利明,須藤和夫,山本啓一監訳, 岩井佳子,上村慎治,北川大樹,齋藤康太,坪井貴司,富田泰輔,名黒功,仁科博史,宮澤恵二,山本啓一,若林憲一訳
    • Total Pages
      1112
    • Publisher
      東京化学同人
    • ISBN
      9784807920518
  • [Book] he Chlamydomonas Sourcebook 3rd ed., Vol. 3, Chap. 162023

    • Author(s)
      Dieckmann, C., Wakabayashi, K., Hegemann, P., Kreimer, G.
    • Total Pages
      470
    • Publisher
      Elsevier
    • ISBN
      978-0128225080

URL: 

Published: 2024-12-25  

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