A synthetic metabolic network based on RNA modification for biological homeostasis

2022 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 22H02813
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Institution: Tohoku University
• Principal Investigator: 小川 亜希子 東北大学, 加齢医学研究所, 助教 (00868565)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 松田 盛 東北大学, 加齢医学研究所, 助教 (00884272) ; 魏 范研 東北大学, 加齢医学研究所, 教授 (90555773)
• Project Period (FY): 2022-04-01 – 2026-03-31
• Keywords: RNA修飾 / 代謝 / 修飾ヌクレオシド / 核酸医学 / 酵素

Outline of Annual Research Achievements

本研究では多彩な化学修飾を含むRNAメタボライトで構成される核酸因子群の新規代謝経路の同定と機能解析を目的とする。当該年度には、研究計画に基づき代謝酵素のin vitro反応系の構築、ドッキングモデル構築、ノックアウト細胞に対する再導入実験、あるいは疾患関連点変異の活性検討を行い、更にノックアウトマウスの作成と網羅的表現型解析を行った。

Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

質量分析装置の最適化によりin vitro反応系の構築がスムーズに施行出来たこと、またノックアウトマウスの致死率が高いながらも解析に十分な数の個体を得ることが出来たため実験データを採取することができた。

Strategy for Future Research Activity

RNA修飾酵素欠損による表現型をRNA-seqで同定した経路の観点から探索する予定である。更に代謝アダプテーションに対するin silico解析を行い、RNA修飾代謝経路の機能解析を更に進める。

Research Products

• [Journal Article] Activation of the urotensin-II receptor by remdesivir induces cardiomyocyte dysfunction. (2023)
  • Author(s): Ogawa A, Ohira S, Kato Y, Ikuta T, Yanagida S, Mi X, Ishii Y, Kanda Y, Nishida M, Inoue A, Wei FY
  • Journal Title: Communications Biology, in press Volume: - Pages: -
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] COVID-19ワクチン接種後のRNA修飾代謝物排泄の変動. (2022)
  • Author(s): 小川 亜希子、松尾 紀孝、齋藤 一創、魏 范研
  • Journal Title: 痛風と尿酸・核酸(日本痛 風・尿酸核酸学会誌) Volume: 46 Pages: 105-113
  • DOI: 10.14867/gnamtsunyo.46.2_105
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Presentation] RNA由来修飾核酸の代謝酵素の同定 (2023)
  • Author(s): 小川亜希子
  • Organizer: 第56回 日本痛風・尿酸核酸学会総会
• [Presentation] RNAモドミクスが開拓する新しい眼内病態生理学 (2022)
  • Author(s): 小川亜希子
  • Organizer: 第126回日本眼科学会総会 シンポジウム10 オミクス解析によって開かれる新しい扉
  • Invited
• [Presentation] 緑内障術後線維化における RNA 修飾の変動 (2022)
  • Author(s): 小川亜希子
  • Organizer: 第 25 回眼科分子生物学研究会
• [Presentation] Metabolic regulation of modified RNA in immunity and disease (2022)
  • Author(s): 小川亜希子
  • Organizer: 第23回日本RNA学会
• [Presentation] Identification of novel sulfur RNA modification and investigation of its possible functions in physiology and pathology (2022)
  • Author(s): Akiko Ogawa
  • Organizer: The 12th International Conference on the Biology, Chemistry, and Therapeutic Applications of Nitric Oxide
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Exploring the role of RNA modification in autophagy-related signaling (2022)
  • Author(s): Akiko Ogawa
  • Organizer: The 10th International Symposium on Autophagy(ISA2022)
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Activation of the urotensin-II receptor by remdesivir induces cardiomyocyte dysfunction (2022)
  • Author(s): 小川亜希子
  • Organizer: 第45回日本分子生物学会