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2022 Fiscal Year Annual Research Report

Elucidation of Xenophagy Regulation by Bacterial Glycan Recognition

Research Project

Project/Area Number 22H02868
Allocation TypeSingle-year Grants
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

中川 一路  京都大学, 医学研究科, 教授 (70294113)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 野澤 孝志  京都大学, 医学研究科, 准教授 (10598858)
村瀬 一典  京都大学, 医学研究科, 助教 (40710869)
Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Keywordsゼノファジー / A群レンサ球菌 / ユビキチン / 認識 / GBP1 / ガレクチン3 / TBK1
Outline of Annual Research Achievements

自然免疫における新領域として注目されているゼノファジー(病原体に対するオートファジー)は、ユビキチン依存的な選択的分解システムである。細胞内に侵入した細菌に対してK48/K63結合型の典型的なユビキチン鎖が病原体を標識することで、選択的に病原体を標的とする。一方で、A群レンサ球菌の流行株などの高病原性細菌はこうした認識から回避し、細胞内で増殖するが、そのメカニズムはほとんど明らかになっていない。そこで本研究では、表層糖鎖認識を介した細菌のユビキチン化をモデルとして、小分子可視化プローブや高解像度顕微鏡を駆使することで、感染時におけるユビキチンリガーゼや鎖特異的ユビキチン鎖の細胞内挙動を解析し、ゼノファジーによる細菌認識メカニズムを明らかにする。本年度は、このユビキチン依存的な分解のキーとなるguanylate-binding protein (GBP)の機能について解析をおこなった。この中で、特にGBP1が、TBK1のリン酸化を促進することにより、侵入したA群レンサ球菌(GAS)に対するゼノファジーを誘導することを明らかにした。GBP1は、細胞内に侵入した細菌が引き起こす膜損傷に対してGASを取り囲むような局在を示し、膜損傷センサーであるガレクチン3がそのリクルートを媒介する。GBP1をノックアウトすると、TBK1の活性化が抑制され、p62のリクルートが減少し、ゼノファジーによる殺菌活性が低下することが明らかになった。以上のことから、ガレクチン3-GBP1-TBK1がオートファジーのアダプタータンパク質p62を介したゼノファジーを制御していることが明らかになった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

細菌感染におけるゼノファジー誘導は、これまで様々な菌種で報告されているが、細胞内における細菌種の認識能についてはほとんど研究が進展していない。本研究では、その細菌種の違いを明らかとするために、その認識能への影響について解析を行った。細菌感染時には、インターフェロン(IFN)が一連の「インターフェロン刺激遺伝子」の発現を活性化し、免疫応答経路を活性化する。これらの遺伝子にはグアニル酸結合タンパク質(GBP)ファミリーのメンバーが含まれ、マウスには11、ヒトには7のホモログがあり、これらの両種において抗病原性作用を発揮することが報告されている。例えば、マウスGBP7はNADPHオキシダーゼ成分と相互作用し、Listeria monocytogenesやMycobacterium bovis BCGの分解を促進する。一方、ヒトGBP1はグラム陰性菌の細胞壁成分であるリポポリサッカライド(LPS)と結合し、インフラマソーム形成に必要なCaspase-4の活性化をサポートする。また、ヒトGBP1、2、3、4がShigella flexneriの運動性を阻害する一方で、細菌がユビキチン-プロテアソームシステムを介してGBPを分解することを意図していることが報告されている。本研究では、ヒトGBP1がA群レンサ球菌の分解に関わっていること明らかとすることができた。これは、ゼノファジーの活性化には、単に菌の認識だけでなく、IFN経路も関わっていることを示す知見である。

Strategy for Future Research Activity

これまでのユビキチン化研究の多くは、細胞を破砕してまとめて解析する生化学的な解析や、GFPに代表される蛍光タンパク質を目的の生体分子に遺伝子的に融合し細胞内で発現させることで細胞内局在や動態を解析していたが、元々細胞が持つ「内在性」のタンパク質の本来の感染時の挙動を見落としている可能性、また分子量の大きなタグを付与することで、本来とは異なる挙動や局在を示す可能性が示唆されている。特に、本研究では、GFPタグ等の蛍光タンパク質そのものがユビキチン化される可能性が否定できない。そこで本研究では、京都大学工学部浜地研究室の協力を得て、小分子プローブを用いた内在性タンパク質の標識により内在性ユビキチン化関連タンパク質のイメージングを行う。

  • Research Products

    (22 results)

All 2023 2022

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results) Presentation (15 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 3 results) Book (3 results)

  • [Journal Article] Complete Genome Sequences of Three Streptococcus ruminantium Strains Obtained from Endocarditis Lesions of Cattle in Japan2022

    • Author(s)
      Nomoto Ryohei、Ishida-Kuroki Kasumi、Tohya Mari、Nakagawa Ichiro、Sekizaki Tsutomu
    • Journal Title

      Microbiology Resource Announcements

      Volume: 11 Pages: e01248-21

    • DOI

      10.1128/mra.01248-21

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Complete Genome Sequences of Four Streptococcus parasuis Strains Obtained from Saliva of Domestic Pigs in Japan2022

    • Author(s)
      Nomoto Ryohei、Ishida-Kuroki Kasumi、Nakagawa Ichiro、Sekizaki Tsutomu
    • Journal Title

      Microbiology Resource Announcements

      Volume: 11 Pages: e01245-1

    • DOI

      10.1128/mra.01245-21

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Guanylate-Binding Protein 1 Regulates Infection-Induced Autophagy through TBK1 Phosphorylation2022

    • Author(s)
      Hikichi Miyako、Toh Hirotaka、Minowa-Nozawa Atsuko、Nozawa Takashi、Nakagawa Ichiro
    • Journal Title

      Cellular Microbiology

      Volume: 2022 Pages: 1~18

    • DOI

      10.1155/2022/8612113

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Genomic dissection of the Vibrio cholerae O-serogroup global reference strains: reassessing our view of diversity and plasticity between two chromosomes2022

    • Author(s)
      Murase Kazunori、Arakawa Eiji、Izumiya Hidemasa、Iguchi Atsushi、Takemura Taichiro、Kikuchi Taisei、Nakagawa Ichiro、Thomson Nicholas R.、Ohnishi Makoto、Morita Masatomo
    • Journal Title

      Microbial Genomics

      Volume: 8 Pages: 000860

    • DOI

      10.1099/mgen.0.000860

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Rab GTPase ネットワークが制御する細胞内膜輸送経路と細菌感染2023

    • Author(s)
      野澤 孝志,村瀬 一典,中川 一路
    • Organizer
      第96回日本細菌学会総会
    • Invited
  • [Presentation] TBC1D18 regulates exocytic and endocytic trafficking of the invading Group A Streptococcus2023

    • Author(s)
      野澤 敦子,野澤 孝志,中川 一路
    • Organizer
      第96回日本細菌学会総会
  • [Presentation] 自然免疫シグナル伝達因子 STING が制御するリソソーム分解経路の解析2023

    • Author(s)
      飯伏 純平,野澤 孝志,中川 一路
    • Organizer
      第96回日本細菌学会総会
  • [Presentation] A 群レンサ球菌の表層蛋白質の機能を阻害する抗体の探索2023

    • Author(s)
      山脇 つくし,中木戸 誠,相川 知宏,Jose Caaveiro,中川 一路,津本 浩平
    • Organizer
      第96回日本細菌学会総会
  • [Presentation] A 群レンサ球菌の金属恒常性タンパク質 AdcAII は亜鉛の獲得と病 原性に必要である2023

    • Author(s)
      相川 知宏,清水 玲秀,村瀬 一典,野澤 孝志,中川 一路
    • Organizer
      第96回日本細菌学会総会
  • [Presentation] 大腸菌由来の細胞外小胞が A 群レンサ球菌に与える生物学的影響2023

    • Author(s)
      河岸 優,村瀬 一典,中川 一路
    • Organizer
      第96回日本細菌学会総会
  • [Presentation] Genome diversity of Streptococcus dysgalactiae and the evolutional process with host switching2023

    • Author(s)
      村瀬 一典,柘植 亮佑,中川 一路
    • Organizer
      第96回日本細菌学会総会
  • [Presentation] Cytokine-induced FBXO2 directs xenophagy against Group A Streptococcus in endothelial cells2023

    • Author(s)
      Min Wu,野澤孝志,中川一路
    • Organizer
      第96回日本細菌学会総会
  • [Presentation] A hydroxamic acid derivative identified by biophysical technologies suppresses Streptococcus infections2022

    • Author(s)
      Nakagawa I., Nakakido M., Aikawa C., Shimomura T., Hoshino M., Nagatoishi S., Tsumoto K
    • Organizer
      10th Asian Biological Inorganic Chemistry Conference (AsBIC10)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] A 群レンサ球菌によるオートファゴソーム膜傷害とその修復機構2022

    • Author(s)
      中川一路
    • Organizer
      第52回レンサ球菌シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] 大腸菌が産生する細胞外小胞を介した A 群レンサ球菌の細胞分裂障害2022

    • Author(s)
      河岸優、村瀬一典、中川一路
    • Organizer
      第52回レンサ球菌シンポジウム
  • [Presentation] A 群レンサ球菌の膜孔形成毒素によるゼノファジー回避機構と宿主膜修復 機構の解析2022

    • Author(s)
      野澤孝志、中川一路
    • Organizer
      第33回日本生体防御学会学術総会
  • [Presentation] A 群レンサ球菌によるゴルジ体の断片化は宿主細胞の膜輸送経路を破綻し サイトカインの分泌を低下させる2022

    • Author(s)
      飯伏純平、野澤孝志、中川一路
    • Organizer
      第33回日本生体防御学会学術総会
  • [Presentation] 大腸菌由来の細胞外小胞がA群レンサ球菌に与える生物学的影響2022

    • Author(s)
      河岸優、村瀬一典、中川一路
    • Organizer
      第75回日本細菌学会関西支部会学術総会
  • [Presentation] MntEを介した菌体内の金属ホメオスタシスの維持はA群レンサ球菌の生育や 病原性に寄与する2022

    • Author(s)
      清水玲秀, 相川知宏, 村瀬一典, 野澤孝志, 中川一路
    • Organizer
      第75回日本細菌学会関西支部会学術総会
  • [Book] 耳鼻咽喉科 薬物治療ベッドサイドガイド2023

    • Author(s)
      藤枝重治、大森孝一
    • Total Pages
      350
    • Publisher
      中山書店
    • ISBN
      978-4-521-74955-6
  • [Book] 治療の可能性が広がる 抗体医薬2022

    • Author(s)
      津本 浩平
    • Total Pages
      231
    • Publisher
      羊土社
    • ISBN
      978-4-7581-0407-4
  • [Book] 月刊 細胞 2022年9月号 細菌の逆襲 20222022

    • Author(s)
      鈴木 仁人
    • Total Pages
      80
    • Publisher
      ニューサイエンス

URL: 

Published: 2023-12-25  

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