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2023 Fiscal Year Annual Research Report

Developments of structure determination techniques with nanofocused X-ray free-electron laser pulses

Research Project

Project/Area Number 22H03877
Allocation TypeSingle-year Grants
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

井上 伊知郎  国立研究開発法人理化学研究所, 放射光科学研究センター, 研究員 (30783401)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 稲葉 理美  大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 研究員 (70785493)
Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
KeywordsX線自由電子レーザー / Advanced KBミラー / X線構造解析 / ナノ集光
Outline of Annual Research Achievements

X線を用いたタンパク質の構造解析では、これまで数10マイクロメートル程度の大型で良質な結晶を作ることが不可欠であった。本研究では、X線自由電子レーザーをナノメートル(nm)サイズにまで極限的に集光した超高強度X線パルスを利用することでnmサイズの極微小タンパク質結晶試料の構造解析を実現する。具体的には、(i) X線自由電子レーザーから出射された波長 1 AのX線をナノ集光する光学系(Advanced KBミラー)の開発、および(ii) ダメージの影響を組み込んだX線構造解析法の開発とタンパク質のナノ結晶への応用、を行う。超高強度X線を利用した新しい構造解析技術を確立することで、将来のX線1分子構造解析への第一歩を踏み出す。
2023年度は、X線集光ミラー作製の最終仕上げとしてミラーのコーティングを行った。完成したミラーの性能をX線自由電子レーザー施設SACLAにおいて確認し、100 nm x 200 nmの微小スポットにX線を集光できていることが確認できた。
また、ミラーの作製と並行して、高強度X線照射下における物質の原子散乱因子の変化を実験及び理論によって検証した。その結果、X線照射中に電子励起によって原子散乱因子が減少することや、その現象の程度が理論の予測とよく一致することが確認できた。この結果は、X線自由電子レーザーのような強いX線を用いた場合にはダメージの影響を組み込んだX線構造解析法の開発が必要であることを意味している。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

2023年度は、X線集光ミラー作製の最終仕上げとしてミラーのコーティングを行った。完成したミラーの性能をX線自由電子レーザー施設SACLAにおいて確認し、100 nm x 200 nmの微小スポットにX線を集光できていることが確認できた。また、高強度X線自由電子レーザーを照射下の物質の原子散乱因子の変化についての実験と理論研究を行い、論文化に結びつけることができた。

Strategy for Future Research Activity

2024年度は、完成したミラーを用いてナノ結晶の回折実験を行う。得られた実験データをダメージを考慮した解析法によって解釈する。また、完成したミラーを用いて外国のXFEL施設(ドイツEuropeanXFELや米国LCLS)においてアト秒X線自由電子レーザーのナノ集光実験も行う予定である。

  • Research Products

    (14 results)

All 2024 2023 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 3 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 3 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] SLAC National Accelerator Laboratory/University of Wisconsin-Madision/Lawrence Berkeley National Laboratory(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      SLAC National Accelerator Laboratory/University of Wisconsin-Madision/Lawrence Berkeley National Laboratory
    • # of Other Institutions
      2
  • [Int'l Joint Research] University of Hamburg/Deutsches Elektronen-Synchrotron/European XFEL(ドイツ)

    • Country Name
      GERMANY
    • Counterpart Institution
      University of Hamburg/Deutsches Elektronen-Synchrotron/European XFEL
  • [Int'l Joint Research] Adam Mickiewicz University in Poznan/Polish Academy of Sciences(ポーランド)

    • Country Name
      POLAND
    • Counterpart Institution
      Adam Mickiewicz University in Poznan/Polish Academy of Sciences
  • [Journal Article] Extreme focusing of hard X-ray free-electron laser pulses enables 7 nm focus width and 1022 W cm2 intensity2024

    • Author(s)
      Yamada Jumpei、Matsuyama Satoshi、Inoue Ichiro、Osaka Taito、Inoue Takato、Nakamura Nami、Tanaka Yuto、Inubushi Yuichi、Yabuuchi Toshinori、Tono Kensuke、Tamasaku Kenji、Yumoto Hirokatsu、Koyama Takahisa、Ohashi Haruhiko、Yabashi Makina、Yamauchi Kazuto
    • Journal Title

      Nature Photonics

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41566-024-01411-4

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Comprehensive Application of XFEL Microcrystallography for Challenging Targets in Various Organic Compounds2024

    • Author(s)
      Takaba Kiyofumi、Maki-Yonekura Saori、Inoue Ichiro、Tono Kensuke、Fukuda Yasuhiro、Shiratori Yota、Peng Yiying、Morimoto Jumpei、Inoue Satoru、Higashino Toshiki、Sando Shinsuke、Hasegawa Tatsuo、Yabashi Makina、Yonekura Koji
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 146 Pages: 5872~5882

    • DOI

      10.1021/jacs.3c11523

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Femtosecond Reduction of Atomic Scattering Factors Triggered by Intense X-Ray Pulse2023

    • Author(s)
      Inoue Ichiro、Yamada Jumpei、Kapcia Konrad J.、Stransky Michal、Tkachenko Victor、Jurek Zoltan、Inoue Takato、Osaka Taito、Inubushi Yuichi、Ito Atsuki、Tanaka Yuto、Matsuyama Satoshi、Yamauchi Kazuto、Yabashi Makina、Ziaja Beata
    • Journal Title

      Physical Review Letters

      Volume: 131 Pages: -

    • DOI

      10.1103/PhysRevLett.131.163201

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Seeded stimulated X-ray emission at 5.9 keV2023

    • Author(s)
      Doyle Margaret D.、Halavanau Aliaksei、Zhang Yu、Michine Yurina、Everts Joshua、Fuller Franklin、Alonso-Mori Roberto、Yabashi Makina、Inoue Ichiro et al.
    • Journal Title

      Optica

      Volume: 10 Pages: 513~513

    • DOI

      10.1364/OPTICA.485989

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Pair Distribution Function from Liquid Jet Nanoparticle Suspension using Femtosecond X‐ray Pulses2023

    • Author(s)
      Stockler Lise Joost、Christensen Rasmus Stubkjar、Klove Magnus、Bertelsen Andreas Dueholm、Borup Anders、Krause Lennard、Takahashi Seiya、Fujita Tomoki、Kasai Hidetaka、Inoue Ichiro、Nishibori Eiji、Iversen Bo Brummerstedt
    • Journal Title

      ChemPhysChem

      Volume: 24 Pages: -

    • DOI

      10.1002/cphc.202300407

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Non-thermal structural transformation of diamond driven by x-rays2023

    • Author(s)
      Heimann Philip、Hartley Nicholas J.、Inoue Ichiro et al.
    • Journal Title

      Structural Dynamics

      Volume: 10 Pages: -

    • DOI

      10.1063/4.0000193

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Nonlinearity in X-ray scattering at high intensity2023

    • Author(s)
      Ichiro Inoue
    • Organizer
      Gordon Research Conference in X-ray science
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Enhancing capabilities of XFEL scattering techniques by short-wavelength radiation2023

    • Author(s)
      Ichiro Inoue
    • Organizer
      European XFEL users’ meeting
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Measurement and applications of ultrafast X-ray interactions with matter2023

    • Author(s)
      Ichiro Inoue
    • Organizer
      Warm Dense Matter conference 2023
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Remarks] RIKEN research

    • URL

      https://www.riken.jp/en/news_pubs/research_news/rr/20240319_2/index.html

  • [Remarks] X線回折に潜む非線形性の発見

    • URL

      https://www.riken.jp/press/2023/20231018_1/index.html

URL: 

Published: 2024-12-25  

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