• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2023 Fiscal Year Annual Research Report

ヒ素を還元する発酵細菌:地下水ヒ素汚染の知られざる原因微生物の発見

Research Project

Project/Area Number 23H02120
Allocation TypeSingle-year Grants
Research InstitutionChiba University

Principal Investigator

天知 誠吾  千葉大学, 大学院園芸学研究院, 教授 (80323393)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 山村 茂樹  国立研究開発法人国立環境研究所, 地域環境保全領域, 室長 (90414391)
黒田 真史  常葉大学, 社会環境学部, 准教授 (20511786)
Project Period (FY) 2023-04-01 – 2026-03-31
Keywordsヒ素 / ヒ酸還元 / 発酵細菌 / Pelosinus / プロピオン酸発酵
Outline of Annual Research Achievements

乳酸をプロピオン酸に発酵代謝する嫌気性細菌Pelosinus sp. IPA-1株は、培地中のヒ酸[As(V)]の量に依存して生育が上昇し、この時As(V)はすべて亜ヒ酸[As(III)]に還元される。また、メチルビオロゲン(MV)を電子供与体としたヒ酸還元酵素(FarA)活性測定において、ヒ酸存在下では本活性が約50倍上昇する。本年度はまず、FarAの局在性について検討を行った。リゾチーム処理によりスフェロプラストとペリプラズム画分を調製し、スフェロプラストを破砕後、超遠心分離により膜画分と細胞質画分に分画した。これら3つの画分におけるFarA活性を比較したところ、約90%が細胞質画分に検出された。そこで、IPA-1株の無細胞抽出液をNative-PAGEに供し、嫌気的に活性染色を行った。切り出した活性バンドをSDS-PAGEに供し、バンドを再度切り出してトリプシン処理しLC-MS/MS解析に供した。その結果、活性バンドにはDMSO reductase familyタンパクの一種であるテトラチオン酸還元酵素(Tetrathionate reductase: TtrA)が高いカバレージ(39%)で含まれることがわかった。転写解析の結果、TtrAをコードする遺伝子(ttrA)はヒ酸存在下で発現量が約96倍上昇することも明らかとなった。さらに、活性中心にモリブデンを有するTtrAを阻害するため、モリブデンのアナログであるタングステンを添加して培養実験を行った。その結果、IPA-1株の生育はヒ酸非存在下ではタングステンに影響を受けなかったが、ヒ酸存在下ではヒ酸非存在下での生育と同等レベルにまで低下した。またタングステン存在下では、IPA-1株のヒ酸還元が50%程度阻害された。以上の結果より、IPA-1株のヒ酸還元酵素の本体はTtrAであることが強く示唆された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

FarAの活性バンドの可視化に成功し、LC-MS/MS解析によりDMSO reductase familyタンパクの一種TtrAの同定に成功した。また、ttrA遺伝子がヒ酸存在下で顕著に発現上昇することが明らかとなり、モリブデンのアナログであるタングステンによってIPA-1株の生育とヒ酸還元が顕著に阻害されることもわかった。一方、当該タンパクはペリプラズムに局在すると予想していたが、案に相違して細胞質に局在した。以上の結果より、おおむね順調に進展していると判断した。

Strategy for Future Research Activity

次年度はIPA-1株をヒ素存在下と非存在下で生育させ、タンパク質を抽出した後、網羅的な比較プロテオーム解析に供する。本解析はすでに一部遂行済であるが、より詳細な統計的解析を行う。TtrAやヒ素耐性タンパク以外に、乳酸の発酵代謝経路やプロピオン酸発酵経路(メチルマロニルCoA経路)など中枢代謝経路のタンパク質群の発現上昇/減少を解析する。また、NADH脱水素酵素複合体やフェレドキシン-NAD+酸化還元酵素複合体(Rnf)など、エネルギー代謝に関わる酵素群の発現も解析する。さらに、プロトノフォアやイオノフォアを用いた生育実験等により、IPA-1株のヒ酸存在下での生育が発酵と呼吸のいずれかを明らかにする。

  • Research Products

    (3 results)

All 2024 2023

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Draft genome sequence of Pelosinus sp. IPA-1, a bacterium isolated from arsenic-contaminated soil in Japan2023

    • Author(s)
      M. Kuroda, S. Yamamura, N. Nakajima, S. Amachi
    • Journal Title

      Microbiology Resource Announcements

      Volume: 12 Pages: e00323-23

    • DOI

      10.1128/MRA.00323-23

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 発酵細菌Pelosinus sp. IPA-1株がヒ素存在下で発現するタンパクの網羅的解析2024

    • Author(s)
      松尾晏佳、山村茂樹、黒田真史、天知誠吾
    • Organizer
      日本農芸化学会2024年度大会
  • [Presentation] 発酵細菌Pelosinus sp. IPA-1株がヒ素存在下で発現するタンパクの網羅的解析2023

    • Author(s)
      松尾晏佳、山村茂樹、黒田真史、天知誠吾
    • Organizer
      日本微生物生態学会第36回大会

URL: 

Published: 2024-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi