2023 Fiscal Year Annual Research Report
Identifying Novel Pathophysiology-related Sepsis Endotypes: Exploratory Research
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23H03005
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Research Institution | Tohoku University |
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Principal Investigator |
工藤 大介 東北大学, 医学系研究科, 准教授 (30455844)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
田宮 元 東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 教授 (10317745)
早川 峰司 北海道大学, 大学病院, 准教授 (10374282)
菱沼 英史 東北大学, 未来型医療創成センター, 助教 (10824609)
久志本 成樹 東北大学, 医学系研究科, 教授 (50195434)
成田 暁 東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 助教 (50459468)
山川 一馬 大阪医科薬科大学, 医学部, 准教授 (50597507)
佐藤 哲哉 東北大学, 大学病院, 助教 (50830197)
小柴 生造 東北大学, 未来型医療創成センター, 教授 (70332301)
後藤 匡啓 東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 客員研究員 (80622894)
湯本 哲也 岡山大学, 医歯薬学域, 講師 (80535790)
近藤 豊 順天堂大学, 大学院医学研究科, 先任准教授 (90642091)
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| Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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| Keywords | 敗血症 / サブクラス分類 / ゲノム関連解析 / メタボローム関連解析 / 治療反応性 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究の目的は、①敗血症患者の病態と関連が強いサブクラスを同定すること、各サブクラスにおける重要転帰や複数の治療法の効果の違いを検証した上で、②日常診療上で取得容易なデータから、患者個人の敗血症サブクラスを推定するモデルを開発することである。
2023年度研究計画（目的を達するための第1段階）：データ収集・解析を主に行う。研究参加施設である東北大学病院、北海道大学病院、大阪医科薬科大学病院に入院した敗血症患者を対象とする。対象患者あるいはその代諾者から研究参加の同意を得た後に、2種類（遺伝子解析目的の血液試料、代謝物質解析（メタボローム）目的の血液試料）の血液検体を採取し、分析を行う。
遺伝子解析目的の血液試料と分析：研究参入後、退院までの間にPAXgene採血管に8.5mL採血して、全血のまま冷蔵保存し、東北大学東北メディカル・メガバンク機構ゲノム解析部門ゲノム遺伝統計学分野に輸送する。血液検体からゲノム抽出後、GWASセンターに試料を送付し、エクソームシークエンシングを行う。
実績：研究参加施設のリクルートを行い、当初の3施設から6施設を加えて、全9施設まで増やすことができた。全10施設から、1年間で115例の患者登録が行われ、Electronic data capture(EDC)システムに臨床情報を登録している。遺伝子解析目的の血液検体は115、メタボローム解析用の検体は55症例分を収集した。遺伝子解析目的の検体については、上記記載の方法で適宜解析を行っている。臨床データやメタボロームデータを統合した本解析は全ての症例登録を終了後に行う。
また年度途中から、研究分担施設の広島大学において、脂質の網羅的解析(Lipidome)解析も行うこととして、変更倫理申請を行い、承諾された。承諾後から、Lipidome解析用の血漿検体の収集も追加した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
参加施設を増やすことができ、予定通りの症例を登録でき、検体も収集できている。
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| Strategy for Future Research Activity |
2024年度も参加施設を増やすべくリクルートを行い、症例登録のペースを上げていく。
引き続き、EDCへの患者登録および検体収集と解析を行う。
臨床データやメタボロームデータを統合した本解析は全ての症例登録終了後に行う。
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