• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2015 Fiscal Year Annual Research Report

Chemical structure mining for adverse reactions and early stage signal detection

Research Project

Project/Area Number 24240025
Research InstitutionKwansei Gakuin University

Principal Investigator

岡田 孝  関西学院大学, 理工学部, 理工学部研究員 (00103135)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 猪口 明博  関西学院大学, 理工学部, 准教授 (70452456)
Project Period (FY) 2012-04-01 – 2016-03-31
Keywords副作用 / データマイニング / ATC分類 / 構造アラート / 医薬品 / 分類樹説明変数
Outline of Annual Research Achievements

1.分類樹を説明変数とし,その中から特異的なノードを選択するアルゴリズムを開発した.毒性node選択のためには,(1)兄弟分類nodeと比較してROR95%信頼限界下限値が1以上であり,(2)データベース全体と比較してもROR下限値が5以上と高くかつ事例数が3以上,(3)少数の高毒性孫nodeによる影響を除くために親nodeとのBSS値が親孫node間のBSS値合計よりも大きいこと,以上の3条件を満たすものを選択した.
2.分類樹説明変数としてはATC分類体系を利用し,データベースとしては医薬品副作用症例のJADERを使って,8種の副作用を対象に上記のアルゴリズムを適用した.副作用の内容は,(1)アナフィラキシー,(2)横紋筋融解,(3)肝障害,(4)間質性肺疾患,(5)血小板減少,(6)好中球減少,(7)赤血球減少,(8)白血球減少である.
3.アナフィラキシーの解析結果からは8種の分類ノードと23種の成分ノードが特徴的な医薬品として選択された.アナフィラキシーは体質的な要因が大きいと考えられてきたが,特徴的な分類を見出すことができた.
4.さらに同一分類中でもROR指標で見て,副作用を発症しやすい医薬品とそうでないものが混在する.これらの医薬品の構造的な特徴を視察することにより,各副作用に対して構造アラートを抽出することができた.アナフィラキシーの場合,多くはセファロスポリン骨格のようなよく知られた部分構造であったが,中でも3位の側鎖にチオテトラゾールのような置換基を持つものは,特にアナフィラキシーの傾向が強いことが判明した.

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (9 results)

All 2017 2016 2015

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 1 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results)

  • [Journal Article] 人工知能,知識発見そしてデータマイニング 30年の歩みから2017

    • Author(s)
      岡田孝
    • Journal Title

      J. Comp. Aided Chem.

      Volume: 18 Pages: 印刷中

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 滑らかな変化を検出するためのグラフ系列クラスタリング2017

    • Author(s)
      長村 佳歩,奥井 颯平 ,猪口 明博
    • Journal Title

      情報処理学会論文誌

      Volume: 58 Pages: 278-287

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Hadamard Code Graph Kernels for Classifying Graphs2016

    • Author(s)
      Tetsuya Kataoka, Akihiro Inokuchi
    • Journal Title

      Proeedings of the 5th International Conference on Pattern Recognition Applications and Methods

      Volume: 2016 Pages: 24-32

    • DOI

      10.5220/0005634700240032

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] アダマール符号を用いたグラフカーネルによるグラフクラス分類2016

    • Author(s)
      片岡 哲也,猪口 明博
    • Journal Title

      情報処理学会論文誌

      Volume: 57 Pages: 2122 - 2130

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Mapping Distance Graph Kernels using Bipartite Matching2017

    • Author(s)
      Tetsuya Kataoka, Eimi Shiotsuki and Akihiro Inokuchi
    • Organizer
      6th International Conference on Pattern Recognition Applications and Methods
    • Place of Presentation
      Porto(Portgual)
    • Year and Date
      2017-02-24 – 2017-02-26
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Detecting Smooth Cluster Changes in Evolving Graphs2016

    • Author(s)
      Sohei Okui, Kaho Osamura, Akihiro Inokuchi
    • Organizer
      International Conference on Machine Learning and Applications
    • Place of Presentation
      California(USA)
    • Year and Date
      2016-12-18 – 2016-12-20
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Experimental Evaluation of Graph Classification with Hadamard Code Graph Kernels2016

    • Author(s)
      Tetsuya Kataoka and Akihiro Inokuchi
    • Organizer
      ICPRAM2016 (Revised Selected Papers)
    • Place of Presentation
      Rome(Italy)
    • Year and Date
      2016-02-24 – 2016-02-26
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 分類樹説明変数による 副作用自発報告データベースのマイニング2015

    • Author(s)
      岡田孝,大森紀人,堀川袷志,猪口明博
    • Organizer
      人工知能学会知識ベースシステム研究会
    • Place of Presentation
      関西学院大学大阪梅田キャンパス(大阪府・大阪市北区)
    • Year and Date
      2015-08-07
  • [Presentation] グラフコーディングを用いたスーパーグラフ検索の効率化2015

    • Author(s)
      猪口明博, 磯村哲
    • Organizer
      人工知能学会知識ベースシステム研究会
    • Place of Presentation
      関西学院大学大阪梅田キャンパス(大阪府・大阪市北区)
    • Year and Date
      2015-08-07

URL: 

Published: 2018-01-16  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi