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2014 Fiscal Year Annual Research Report

核・葉緑体制御ループによる葉緑体ゲノム機能の統御機構

Research Project

Project/Area Number 24248061
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

田中 寛  東京工業大学, 資源化学研究所, 教授 (60222113)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2015-03-31
Keywords真核細胞 / 細胞核 / 葉緑体 / シグマ因子 / テトラピロール / レトログレードシグナル / シグナル伝達 / シゾン
Outline of Annual Research Achievements

1)シゾン葉緑体ゲノム転写におけるシグマ因子の特異性に関して、SIG4がycf17 (一回膜貫通型クロロフィル結合タンパク質)およびpsbA遺伝子の転写を直接活性化することを示し、SIG1:リボゾームRNA遺伝子、SIG2:フィコビリゾーム遺伝子、と併せ特定遺伝子の活性化に関わるシグマ因子特異性の全貌を明らかにした。SIG3は広く恒常的な転写活性化に対応すると考えられることから、シグマ因子による葉緑体転写制御の全体像を示すことに成功した(Fujii et al., 2015)。
2)SIG2タンパク質の安定性が活性酸素種を介したRedox制御を受け、葉緑体フィコビリゾーム遺伝子発現を葉緑体自律的に制御する仕組みを明らかにした。
3)Tiling arrayを用いることでシゾンの20染色体上にCENP-A結合領域を同定し、それぞれ一カ所のRegional-typeのセントロメアを同定した(Kanesaki et al., 2015)。
4)シゾンが塩ストレスを受けた際に葉緑体で合成されるアブシジン酸(ABA)は、細胞周期をG1期に停止させる効果をもつ。細胞周期がG1/S期のチェックポイントを通過するには、葉緑体機能が正常であることを示すMgProtoがシグナルとして必要であり、このMgProtoシグナルの放出には葉緑体DNA合成が必要であることが判明している。葉緑体DNA合成には葉緑体明反応の活性化に加え、ミトコンドリア由来のヘムシグナルが必須であるが、ABA存在下で発現誘導されるTSPO(ヘムスカベンジャータンパク質)により細胞内のヘムシグナルがクエンチされることで、ABAによる細胞周期停止が起こることを明らかにした。ABAによるTSPO遺伝子の発現誘導について、高等植物と同様にPP2C/SnRK2によるシグナル伝達系が関与しているかどうか現在検証を行っている。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (21 results)

All 2015 2014

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 3 results) Presentation (15 results) (of which Invited: 3 results)

  • [Journal Article] Complete genome sequence of cyanobacterium Geminocystis sp. NIES-3709 that harbors phycoerythrin-rich phycobilisome2015

    • Author(s)
      Yuu Hirose, Mitsunori Katayama, Yoshiyuki Ohtsubo, Naomi Misawa, Erica Iioka, Wataru Suda, Kenshiro Oshima, Mitsumasa Hanaoka, Kan Tanaka, Toshihiko Eki, Masahiko Ikeuchi, Yo Kikuchi, Makoto Ishida, and Masahira Hattori
    • Journal Title

      Genome Announcement

      Volume: 3 Pages: e00385-15

    • DOI

      10.1128/genomeA.00385-15

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Complete genome sequence of cyanobacterium Geminocystis sp. NIES-3708, which performs type II complementary chromatic acclimation2015

    • Author(s)
      Yuu Hirose, Mitsunori Katayama, Yoshiyuki Ohtsubo, Naomi Misawa, Erica Iioka, Wataru Suda, Kenshiro Oshima, Mitsumasa Hanaoka, Kan Tanaka, Toshihiko Eki, Masahiko Ikeuchi, Yo Kikuchi, Makoto Ishida, and Masahira Hattori
    • Journal Title

      Genome Announcement

      Volume: 3 Pages: e00357-15

    • DOI

      10.1128/genomeA.00357-15

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification of centromere regions in chromosomes of a unicellular red alga, Cyanidioschyzon merolae2015

    • Author(s)
      Yu Kanesaki, Sousuke Imamura, Motomichi Matsuzaki, and Kan Tanaka
    • Journal Title

      FEBS Lett.

      Volume: 589 Pages: 1219-1224

    • DOI

      10.1016/j.febslet.2015.04.009

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] The nuclear-encoded sigma factor SIG4 directly activates transcription of chloroplast psbA and ycf17 genes in the unicellular red alga Cyanidioschyzon merolae2015

    • Author(s)
      Gaku Fujii, Sousuke Imamura, Atsuko Era, Shin-ya Miyagishima, Mitsumasa Hanaoka, and Kan Tanaka
    • Journal Title

      FEMS Microbiol. Lett.

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1093/femsle/fnv063

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Optimization of polyethylene glycol (PEG)-mediated DNA introduction conditions for transient gene expression in the unicellular red alga Cyanidioschyzon merolae2014

    • Author(s)
      Mio Ohnuma, Takashi Yokoyama, Takayuki Inouye, Yasuhiko Sekine, Tsuneyoshi Kuroiwa and Kan Tanaka
    • Journal Title

      J. Gen. Appl. Microbiol.

      Volume: 60 Pages: 156-159

    • DOI

      10.10.2323/jgam.60.156

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Metabolomic analysis reveals rewiring of Synechocystis sp. PCC 6803 primary metabolism by ntcA-overexpression.2014

    • Author(s)
      Takashi Osanai, Akira Oikawa, Hiroko Iijima, Ayuko Kuwahara, Munehiko Asayama, Kan Tanaka, Masahiko Ikeuchi, Kazuki Saito and Masami Yokota Hirai
    • Journal Title

      Environ. Microbiol.

      Volume: 16 Pages: 3304-3317

    • DOI

      10.1111/1462-2920.12554

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 大腸菌におけるメタボリックスイッチ制御機構の解明2015

    • Author(s)
      ◯島田友裕、田中寛
    • Organizer
      日本農芸化学会平成27年度大会
    • Place of Presentation
      岡山大学
    • Year and Date
      2015-03-27 – 2015-03-27
  • [Presentation] Functional analysis of uncharacterized conserved response regulator Rre1 in Synechococcus elongatus PCC 79422015

    • Author(s)
      ◯Ikki Kobayashi、Tomohiro Shimada、Kan Tanaka
    • Organizer
      The German-Japanese Binational Seminar 2015、Harvesting Light: From light to biotechnological products
    • Place of Presentation
      Atami, Japan
    • Year and Date
      2015-03-24 – 2015-03-24
  • [Presentation] Roles of the conserved response regulator Rre1 in stress-responsive transcription in cyanobacteria2015

    • Author(s)
      Ikki Kobayashi、Tomohiro Shimada、◯Kan Tanaka
    • Organizer
      The German-Japanese Binational Seminar 2015、Harvesting Light: From light to biotechnological products
    • Place of Presentation
      Atami, Japan
    • Year and Date
      2015-03-22 – 2015-03-22
    • Invited
  • [Presentation] 単細胞紅藻 Cyanidioschyzon merolae におけるTOR (target of rapamycin)の機能解析2015

    • Author(s)
      ◯今村壮輔、田中寛
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学
    • Year and Date
      2015-03-17 – 2015-03-17
  • [Presentation] 紅藻シゾンにおける窒素欠乏応答転写因子MYB1の機能解析2015

    • Author(s)
      ◯神崎 陸、今村壮輔、田中寛
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学
    • Year and Date
      2015-03-17 – 2015-03-17
  • [Presentation] Functional analysis of ABA in red algae2015

    • Author(s)
      ◯Yuki Kobayashi、Hiroyuki Ando、Mitsumasa Hanaoka、Kan Tanaka
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-16
  • [Presentation] 紅藻 Cyanidioschyzon merolae の細胞周期制御に関わるMAPKの同定2015

    • Author(s)
      ◯鈴木紀之、小林勇気、田中寛
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-16
  • [Presentation] Synechococcus elongatus PCC 7942における保存された機能未知レスポンスレギュレーターRre1の機能解析2015

    • Author(s)
      ◯小林一幾、島田友裕、田中寛
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-16
  • [Presentation] 単細胞紅藻シゾンにおける葉緑体に依存した核遺伝子の光誘導転写制御2015

    • Author(s)
      ◯大原ひかる、安藤洸幸、小倉駿佑、藤井岳、今村壮輔、田中寛、恵良厚子、宮城島進也、五十嵐雅之、内海龍太郎、華岡光正
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-16
  • [Presentation] 同一淡水湖由来の2種のGeminocystis属シアノバクテリアの補色応答の違い2015

    • Author(s)
      ◯広瀬侑、片山光徳、大坪嘉之、三澤直美、飯岡恵里香、須田亙、大島健志朗、華岡光正、田中寛、浴俊彦、池内昌彦、服部正平
    • Organizer
      第9回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸大学
    • Year and Date
      2015-03-07 – 2015-03-07
  • [Presentation] 単細胞紅藻シゾンにおけるプラスチドシグナルを介した核遺伝子の転写制御2014

    • Author(s)
      安藤洸幸、大原ひかる、小倉駿佑、藤井岳、今村壮輔、田中寛、恵良厚子、宮城島進也、五十嵐雅之、内海龍太郎、◯華岡光正
    • Organizer
      第37回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2014-11-25 – 2014-11-27
  • [Presentation] Abscisic acid signaling in a unicellular red alga2014

    • Author(s)
      Yuki Kobayashi、◯Kan Tanaka
    • Organizer
      Japan-Finland Binational Seminar
    • Place of Presentation
      Sapporo, Japan
    • Year and Date
      2014-10-13 – 2014-10-13
    • Invited
  • [Presentation] Functional analysis of group 2 sigma factors in Synechococcus elongatus PCC 79422014

    • Author(s)
      ◯Rumi Suzuki、Taina Tyystjarvi、Kan Tanaka
    • Organizer
      Japan-Finland Binational Seminar
    • Place of Presentation
      Sapporo, Japan
    • Year and Date
      2014-10-11 – 2014-10-11
  • [Presentation] 単細胞紅藻シゾンにおける葉緑体に依存した光応答転写制御2014

    • Author(s)
      安藤洸幸、小倉駿佑、大原ひかる、藤井岳、今村壮輔、田中 寛、五十嵐雅之、内海龍太郎、◯華岡光正
    • Organizer
      日本植物学会第78回大会
    • Place of Presentation
      明治大学(生田)
    • Year and Date
      2014-09-12 – 2014-09-14
  • [Presentation] Bacteria made Organelles made Eukaryotic Cells2014

    • Author(s)
      ◯田中 寛
    • Organizer
      極限環境生物学会シンポジウム(「地球生命の誕生と進化」極限環境生物学の挑戦、そしてその先へ)
    • Place of Presentation
      東京工業大学(大岡山)
    • Year and Date
      2014-06-07 – 2014-06-07
    • Invited

URL: 

Published: 2016-06-01  

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