2013 Fiscal Year Annual Research Report
ゲノム情報に基づく乳癌内分泌療法反応性関連遺伝子の同定及びタンパク機能解析
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24300338
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| Research Institution | National Cancer Center Japan |
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Principal Investigator |
前佛 均 独立行政法人国立がん研究センター, 研究所, ユニット長 (90372820)
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| Project Period (FY) |
2012-04-01 – 2015-03-31
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| Keywords | C10orf11 / 乳がん / 内分泌治療 / 個別化医療 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
平成２４年度までに行われた２４０例の乳がんタモキシフェン治療症例のgermline DNAを用いた網羅的遺伝子多型解析の結果、１５個の遺伝子多型(SNP)がゲノムワイド有意水準を満たすレベルで、治療効果（治療後の予後）と関連を認めた。さらに追加サンプル２２２例を用いた検証実験の結果より、上記１５ SNPのうち１０番染色体上のC10orf11遺伝子については、２つの独立した乳がんサンプルセットにおいても再発のリスクと強く関連することが再現された（全検体を組み合わせた結果：log-rank P= 1.26 × 10(-10)、Hazard ratio = 4.51)。
C10orf11遺伝子は、メラノサイトの分化に関係している可能性が報告されているが、その機能はほとんど知られていない遺伝子である。正常組織における発現状況を検討したところ、副腎、肝において、比較的高い発現を認めたが、正常乳腺組織においては高い発現を認めなかった。また、同遺伝子の細胞増殖能への影響を検討するため、一過性強制発現系で同遺伝子を過剰発現し、MTT assayにて検討を行ったが、明らかな細胞増殖能への影響を認めなかった。さらにC10orf11遺伝子の発現抑制細胞を作成し、細胞増殖能の変化を検討するため、si-RNAオリゴを作成した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
ゲノムワイド関連解析の結果、有意水準を満たすSNPが複数同定され、さらに検証試験の結果、1 SNPで再現性が確認された。その結果、１遺伝子（C10orf11遺伝子）に焦点を当てて解析を進めることが可能となった。当初の予定よりeffectの強いSNPが同定され、臨床有用性の高い結果が得られる可能性が強まったため。
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| Strategy for Future Research Activity |
効果的なsi-RNAのオリゴ配列を決定し、C10orf11発現抑制系を用いて細胞増殖抑制能への影響を検討する。C10orf11タンパクの細胞内局在、タンパク定量化のため特異抗体を作成し、結合タンパクなどについても検討をすすめる。結合タンパクの機能を熟考し、たとえばリン酸化酵素などであれば、関係しうる代表的細胞内シグナルなども考慮しながら、内分泌療法反応性との関連について、そのメカニズムを解明する。
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| Causes of Carryover |
当初は平成２５年１２月までに乳がん内分泌療法反応性関連遺伝子について十分な遺伝子発現抑制効果を有するsi-RNA オリゴおよび同遺伝子産物に対する特異的抗体を作成し、平成２６年３月末までに細胞増殖抑制効果を確認し、その抗体が内在性のタンパクを認識する予定であった。しかしsi-RNAオリゴについては、上記期間までに効果的に目的遺伝子の発現を抑制しうるものがデザインできず、また特異的抗体については抗体作成に想定外の時間を要したため。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
効果的に目的遺伝子の発現を抑制するsi-RNAを設計・作成するのに約２７万円を費やし、さらに約１４０万円をかけて特異的抗体を用いた免疫細胞染色および免疫組織染色を行う計画とした。
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Research Products
(14 results)
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[Journal Article] 遺伝子解析による薬物反応性 有害事象 ゲノムワイド関連解析によるゲムシタビン副作用関連遺伝子の同定.2013
Author(s)
前佛 均, 清谷 一馬, 宇野 智子, 木村 康利, 莚田 泰誠, 光畑 直喜, 伊奈 志乃美, 鬼原 史, 山上 裕機, 平田 公一, 中村 祐輔
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Journal Title
Surgery Frontier
Volume: 20
Pages: 198-201
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[Presentation] A replication study of a GWAS identified three genetic loci associated with clinical outcomes of patients with invasive breast cancer2013
Author(s)
Goro Kutomi, Koichi Hirata, Kazuma Kiyotani, Taisei Mushiroda, Tatsuhiko Tsunoda, Fuminori Aki, Yuichi Takatsuka, Minoru Okazaki, Shozo Ohsumi, Takashi Yamakawa, Mitsunori Sasa, Yusuke Nakamura and Hitoshi Zembutsu
Organizer
第72回日本癌学会学術総会
Place of Presentation
横浜
Year and Date
2013-10-03 – 2013-10-05
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