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2012 Fiscal Year Annual Research Report

海洋性珪藻における無機炭素獲得分子動態のモデリング

Research Project

Project/Area Number 24310015
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Research InstitutionKwansei Gakuin University

Principal Investigator

松田 祐介  関西学院大学, 理工学部, 教授 (30291975)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 藤原 伸介  関西学院大学, 理工学部, 教授 (90263219)
佐藤 英俊  関西学院大学, 理工学部, 准教授 (10300873)
Project Period (FY) 2012-04-01 – 2016-03-31
Keywords海洋生態 / 環境変動 / 水圏現象 / 植物 / 海洋性珪藻
Research Abstract

海洋性珪藻類は地球全体の20%の一次生産を行う重要な独立栄養生物であるが、一次生産効率を維持する分子機構が未解明なために、変動環境下におけるこの動態予測も細胞レベルからの根拠が不足している。本研究では、海洋性珪藻が無機炭素を細胞内に取込み効果的に固定する系(無機炭素濃縮機構:CCM)が、CO_2濃度、pH、温度、鉄などの環境因子変動に応答することが一次生産性変動の重要因子であるという仮説に基づき、1.海洋性珪藻類の無機炭素取込みと蓄積を担う分子、及びその機能を同定すること、2.この分子をコードする遺伝子の環境変動下における発現動態分析による、一次生産性変動予測動態モデルの構築、を目的としている。
平成24年度における実施項目と成果を以下にあげる。1.無機炭素輸送に関わると考えられるタンパクの機能同定;solute carder(SLC)タンパク質ファミリーを中心とした候補遺伝子のクローニングを計画した。クローニングした候補の中からPtSLC4-2という新規因子を発見し、細胞膜型HCO_3^-輸送体であることを確認した。2.葉緑体内および周辺部に局在する炭酸脱水酵素(CA)、C、代謝関連酵素の機能解明;計画通りこれらの細胞内局在をほぼ決定した。さらに、ピレノイド型CA(PtCAIおよびPtCA2)の活性がチオレドキシンと分子酸素により制御されていることを発見した。3.これらタンパク質のCO_2(pH)、温度、鉄濃度に対する応答の定量的解析;計画に従い予備的実験を行う過程ですでに一部因子のCO_2、光、および鉄に対する転写応答性を確認した。4.環境変動に伴う油脂、炭化水素、クロロフィルの相対比の動態解析;計画通り基礎データの収集を行った。
特に、1.と2.では、海洋性独立栄養生物で初めて無機炭素輸送体分子を発見し、また珪藻類葉緑体の酸化還元調節機構を初めて明らかにするなど、重要な成果を得た。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

研究実績の概要に記した実施項目1.と2.で、すでに海洋性独立栄養生物で初めて無機炭素輸送体分子を発見し、また珪藻類葉緑体の酸化還元調節機構を初めて明らかにするなど、重要な成果を得た。これらの成果を平成24年度に、J. Biol ChemやProc Natl Acad Sci USAなどの国際学術誌にも発表しており、当初の計画よりも進んでいると判断した。

Strategy for Future Research Activity

当初の計画通りに遂行する。特にH25年度は無機炭素輸送体や細胞内炭素流路調節因子の機能決定において成果を出すことを目指し、次に控える動態予測とモデル化のための因子を充実させる。

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

平成24年度に重要な実験が予定よりも順調に推移したため、試薬代として計上していた金額に余分が発生した。また、実験の進行上、準備的実験として位置付けていたペプチド抗体の作製はあまり進まなかったため、これも余分発生の原因となった。これを通常の抗体作製に切り替え、減額してH25年度に計上しなおすこととした。

  • Research Products

    (49 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results) Presentation (37 results) Book (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (3 results)

  • [Journal Article] SLC4 family transporters in a marine diatom directly pump bicarbonate from seawater.2013

    • Author(s)
      中島健介,松田祐介
    • Journal Title

      Proceedings of National Academy of ScienceUSA,

      Volume: 110(5) Pages: 1767-1772

    • DOI

      10.1073/pnas.1216234110

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Redox regulation of carbonic anhydrases via thioredox in the chloroplast of the marine diatom Phaeodactylum tricornutum.2012

    • Author(s)
      菊谷早絵,松田祐介
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 287(24) Pages: 20689-20700

    • DOI

      10.1074/jbc.M111.322743

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] C0_2-cAMP responsive cis-elements targeted by a transcription factor with CREB/ATF-like basic zipper domain in the marine diatom Phaeodactylum tricornutum.2012

    • Author(s)
      大野直樹,松田祐介
    • Journal Title

      Plant Physiology

      Volume: 158 Pages: 499-513

    • DOI

      10.1104/pp.111.190249

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 細胞工学による海洋性珪藻無機炭素獲得系およびC0_2感知系の研究2012

    • Author(s)
      松田祐介
    • Journal Title

      光合成研究

      Volume: 22(3) Pages: 185-192

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Indole-3-glycerol-phosphate synthase is recognized by a cold-inducible group II chaperonin in Thermococcus kodakarensis.2012

    • Author(s)
      高 楽、藤原 伸介
    • Journal Title

      Appl. Environ. Microbiol.

      Volume: 78 Pages: 3806-3815

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Kinetic analysis of reverse transcriptase activity of bacterial family A DNA polymerases.2012

    • Author(s)
      保川 清、藤原 伸介
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res.Commun.

      Volume: 427 Pages: 654-658

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 酢酸菌 Gluconacetobacter europaeusによる分岐鎖アミノ酸の生産2012

    • Author(s)
      赤坂 直紀、藤原 伸介
    • Journal Title

      日本生物工学会誌

      Volume: 90 Pages: 374-380

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A genetic examination of initial amino acid oxidation and glutamate catabolism in the hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakarensis

    • Author(s)
      横大路 裕介、藤原 伸介
    • Journal Title

      J.Bacterial.

      Volume: (印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 好熱菌分岐鎖ポリアミンの生合成、および高温下での翻訳の効率化2013

    • Author(s)
      藤原 伸介
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      東北大学、仙台市
    • Year and Date
      2013-03-27
  • [Presentation] 耐熱性Protein Disulfide Isomeraseを利用した効率的なBPAの回収2013

    • Author(s)
      ALSHEHRI AMIRA、藤原 伸介, ら
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      東北大学、仙台市
    • Year and Date
      2013-03-26
  • [Presentation] 超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisの新規アミノプロピル基転移酵素の同定2013

    • Author(s)
      岡田 和真、藤原 伸介, ら
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      東北大学、仙台市
    • Year and Date
      2013-03-26
  • [Presentation] 酢酸菌Gluconacetobacter europaeusにおける遺伝子破壊系の構築2013

    • Author(s)
      赤坂 直紀、藤原 伸介, ら
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      東北大学、仙台市
    • Year and Date
      2013-03-26
  • [Presentation] 超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis由来システインデスルフラーゼに依存する含硫化合物の探索2013

    • Author(s)
      秀瀬 涼太、藤原 伸介, ら
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      東北大学、仙台市
    • Year and Date
      2013-03-26
  • [Presentation] 超好熱菌Thermococcus kodakarensisの水素・硫化水素発生に関わる転写因子Tk-SurRの転写制御機構2013

    • Author(s)
      川妻 孝平、藤原 伸介, ら
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      東北大学、仙台市
    • Year and Date
      2013-03-25
  • [Presentation] 超好熱始原菌Thermococcus kodakarensisの二つのTranscription factor Bの異なる役割2013

    • Author(s)
      西川 諒、藤原 伸介, ら
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      東北大学、仙台市
    • Year and Date
      2013-03-25
  • [Presentation] 超好熱始原菌Thermococcus kodakarensisの低温誘導型RNAヘリカーゼの機能解析2013

    • Author(s)
      Sahara Tatit Novi、藤原 伸介, ら
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      東北大学、仙台市
    • Year and Date
      2013-03-25
  • [Presentation] 超好熱性アーキアのリボソーム画分に存在する熱ショックタンパク質の機能解析2013

    • Author(s)
      井上 貴央、藤原 伸介, ら
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      東北大学、仙台市
    • Year and Date
      2013-03-25
  • [Presentation] 海洋性珪藻Thalassiosira pseudonanaにおけるカーボニックアンヒドラーゼの局在解析2013

    • Author(s)
      寒川美央,松田祐介
    • Organizer
      第54回日本植物生理学会2012年度大会
    • Place of Presentation
      岡山大学,岡山市
    • Year and Date
      2013-03-23
  • [Presentation] 海洋性珪藻の鉄応答転写機構の解析2013

    • Author(s)
      吉永亮,松田祐介
    • Organizer
      第54回日本植物生理学会2012年度大会
    • Place of Presentation
      岡山大学,岡山市
    • Year and Date
      2013-03-23
  • [Presentation] 海洋性珪藻におけるLCBIホモログの局在および機能2013

    • Author(s)
      菊谷早絵,松田祐介
    • Organizer
      第54回日本植物生理学会2012年度大会
    • Place of Presentation
      岡山大学,岡山市
    • Year and Date
      2013-03-23
  • [Presentation] 海洋性珪藻プラスチド代謝のレドックス制御2013

    • Author(s)
      松田祐介
    • Organizer
      第54回日本植物生理学会2012年度大会
    • Place of Presentation
      岡山大学,岡山市(招待講演)
    • Year and Date
      2013-03-21
  • [Presentation] Thermococcus属のPOI1領域に存在するインテインの役割2012

    • Author(s)
      大西 優介、藤原 伸介, ら
    • Organizer
      日本生化学会
    • Place of Presentation
      マリンメッセ福岡、福岡市
    • Year and Date
      20121215-20121216
  • [Presentation] 超好熱菌Thermococcus kodakarensisの低温誘導型RNAヘリガーゼの誘導機構2012

    • Author(s)
      長岡 英里子、藤原 伸介, ら
    • Organizer
      日本生化学会
    • Place of Presentation
      マリンメッセ福岡、福岡市
    • Year and Date
      2012-12-16
  • [Presentation] 超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis由来システインデスルフラーゼの生理的意義2012

    • Author(s)
      秀瀬 涼太、藤原 伸介, ら
    • Organizer
      日本生化学会
    • Place of Presentation
      マリンメッセ福岡、福岡市
    • Year and Date
      2012-12-16
  • [Presentation] 耐熱性の異なるTrpCが超好熱菌の生育に及ぼす影響2012

    • Author(s)
      藤原 綾子、藤原 仲介, ら
    • Organizer
      日本生化学会
    • Place of Presentation
      マリンメッセ福岡、福岡市
    • Year and Date
      2012-12-16
  • [Presentation] 超好熱性アーキアのリボソーム画分に存在する熱ショックタンパク質の機能解析2012

    • Author(s)
      井上 貴央、藤原 仲介, ら
    • Organizer
      日本生化学会
    • Place of Presentation
      マリンメッセ福岡、福岡市
    • Year and Date
      2012-12-15
  • [Presentation] Raman Studies on Progression of Tumor in Live Mouse Models and Cells2012

    • Author(s)
      佐藤 英俊
    • Organizer
      SPEC2012
    • Place of Presentation
      チェンマイ市、タイ(招待講演)
    • Year and Date
      2012-11-12
  • [Presentation] 酢酸菌Gluconacetobacter europaeusによる分岐鎖アミノ酸の生産2012

    • Author(s)
      赤坂 直紀、藤原 伸介, ら
    • Organizer
      日本生物工学会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場、神戸市
    • Year and Date
      2012-10-26
  • [Presentation] Thermococcus kodakarensisを宿主とした低温誘導発現系の開発2012

    • Author(s)
      秀瀬 良太、藤原 伸介, ら
    • Organizer
      日本生物工学会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場、神戸市
    • Year and Date
      2012-10-25
  • [Presentation] 制限酵素PI-TkoII のDNA転移現象における役割2012

    • Author(s)
      大西 優介、藤原 伸介, ら
    • Organizer
      日本生物工学会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場、神戸市
    • Year and Date
      2012-10-24
  • [Presentation] Raman Study of Colorectal Cancer in Live Mouse Model and Cells2012

    • Author(s)
      佐藤 英俊
    • Organizer
      FACSS-Scix2012
    • Place of Presentation
      カンザス市、アメリカ(招待講演)
    • Year and Date
      2012-10-02
  • [Presentation] 海洋性珪藻のC0_2/光応答性プロモーターの比較解析2012

    • Author(s)
      田中敦士,松田祐介
    • Organizer
      日本植物学会第76回大会
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学,姫路市
    • Year and Date
      2012-09-15
  • [Presentation] 海洋性珪藻の鉄応答転写制御機構の解明2012

    • Author(s)
      松井啓晃,松田祐介
    • Organizer
      日本植物学会第76回大会
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学,姫路市
    • Year and Date
      2012-09-15
  • [Presentation] Mutations to create thermostable reverse transcriptase with bacterial family A DNA polymerase from Thermotoga petrophilla K4. 9^<th> international congress on extremophiles2012

    • Author(s)
      藤原 伸介, ら
    • Organizer
      9^<th> international congress on extremophiles
    • Place of Presentation
      セビリア市,スペイン
    • Year and Date
      2012-09-11
  • [Presentation] Anaysis of the DNA Polymerase B disruptant of hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakarensis. 9^<th> international congress on extremophiles2012

    • Author(s)
      Takashi Kushida, 藤原 伸介, ら
    • Organizer
      9^<th> international congress on extremophiles
    • Place of Presentation
      セビリア市,スペイン
    • Year and Date
      2012-09-11
  • [Presentation] Redox regulation of plastid metabolism by thioredoxin in the marine diatom Phaeodactylum tricornutum.2012

    • Author(s)
      松田祐介
    • Organizer
      第22回 国際珪藻シンポジウム
    • Place of Presentation
      ゲント市.ベルギー
    • Year and Date
      2012-08-28
  • [Presentation] 超好熱菌Thermococcus kodakarensisの二つの転写開始因子TFB1とTFB2の生理機能解析2012

    • Author(s)
      秀瀬 良太、藤原 伸介, ら
    • Organizer
      日本Archaea研究会
    • Place of Presentation
      関西学院会館,西宮市
    • Year and Date
      2012-07-21
  • [Presentation] Thermococcus属におけるPoll領域介在配列の転移性2012

    • Author(s)
      大西 優介、藤原 伸介, ら
    • Organizer
      日本Archaea研究会
    • Place of Presentation
      関西学院会館,西宮市
    • Year and Date
      2012-07-20
  • [Presentation] 超好熱菌Thermococcus kodakarensisの低温誘導型RNAヘリカーゼの誘導機構2012

    • Author(s)
      長岡 英里子、藤原 伸介, ら
    • Organizer
      日本Archaea研究会
    • Place of Presentation
      関西学院会館,西宮市
    • Year and Date
      2012-07-20
  • [Presentation] Localization of Carbonic Anhydrases in the Marine Diatom, Thalassiosir a pseudonana.2012

    • Author(s)
      寒川美央,松田祐介
    • Organizer
      第9回アジアパシフィックマリンバイオテクノロジー学会
    • Place of Presentation
      高知市文化プラザ,高知市
    • Year and Date
      2012-07-14
  • [Presentation] Localization of two carbonic anhydrases, CAIX and CA-X, in the marine diatoms, Phaeodactylum tricornutum.2012

    • Author(s)
      Hermanus Nawaly, 松田祐介
    • Organizer
      第9回アジアパシフィックマリンバイオテクノロジー学会
    • Place of Presentation
      高知市文化プラザ,高知市
    • Year and Date
      2012-07-14
  • [Presentation] Development of a New Screening System Using Pyrimidine Auxotrophy in a Marine Diatom2012

    • Author(s)
      坂口俊郎,松田祐介
    • Organizer
      第9回アジアパシフィックマリンバイオテクノロジー学会
    • Place of Presentation
      高知市文化プラザ,高知市
    • Year and Date
      2012-07-13
  • [Presentation] The structure of iron responsive promoters in two model marine diatoms, Phaeodactylum tricornutum and Thalassiosira pseudonana.2012

    • Author(s)
      吉永亮,松田祐介
    • Organizer
      第9回アジアパシフィックマリンバイオテクノロジー学会
    • Place of Presentation
      高知市文化プラザ,高知市
    • Year and Date
      2012-07-13
  • [Presentation] Prospect of Raman Spectroscopy for Biomedical Application2012

    • Author(s)
      佐藤 英俊
    • Organizer
      HIBES2012
    • Place of Presentation
      バンドン市、インドネシア
    • Year and Date
      2012-06-30
  • [Presentation] 珪藻エンジニアリングによるC02固定研究2012

    • Author(s)
      松田祐介
    • Organizer
      第3回 日本光合成学会
    • Place of Presentation
      東京工業大学すずかけ台キャンパス、東京都(招待講演)
    • Year and Date
      2012-06-01
  • [Book] 遺伝子工学の原理2012

    • Author(s)
      藤原伸介、松田祐介
    • Total Pages
      201
    • Publisher
      三共出版
  • [Patent(Industrial Property Rights)] ビスフェノールA吸着剤及びその利用2013

    • Inventor(s)
      藤原伸介, 今岡進
    • Industrial Property Rights Holder
      学校法人関西学院
    • Industrial Property Number
      特願2013-042324
    • Filing Date
      2013-03-04
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 改変された酢酸菌及びその利用2013

    • Inventor(s)
      藤原伸介
    • Industrial Property Rights Holder
      学校法人関西学院,マルカン酢株式会社
    • Industrial Property Number
      特願2013-041281
    • Filing Date
      2013-03-04
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 目的遺伝子を欠損した酢酸菌の製造方法及びその利用2013

    • Inventor(s)
      藤原伸介
    • Industrial Property Rights Holder
      学校法人関西学院,マルカン酢株式会社
    • Industrial Property Number
      特願2013-041280
    • Filing Date
      2013-03-04

URL: 

Published: 2014-07-16  

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