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2015 Fiscal Year Annual Research Report

海洋性珪藻における無機炭素獲得分子動態のモデリング

Research Project

Project/Area Number 24310015
Research InstitutionKwansei Gakuin University

Principal Investigator

松田 祐介  関西学院大学, 理工学部, 教授 (30291975)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 佐藤 英俊  関西学院大学, 理工学部, 教授 (10300873)
藤原 伸介  関西学院大学, 理工学部, 教授 (90263219)
Project Period (FY) 2012-04-01 – 2016-03-31
Keywords海洋生態 / 環境変動 / 水圏現象 / 植物 / 海洋性珪藻
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、海洋性珪藻が無機炭素を細胞内に取り込み、効果的に固定する系(CO2濃縮機構:CCM)と、その系がCO2濃度、pH、温度、および鉄などの環境因子へ応答する仕組みが、海洋一次生産変動の受容因子であるという仮説に基づき、1.海洋性珪藻類の無機炭素取り込みと蓄積を担う分子機構を同定すること、2.この分子機構を担う遺伝子の環境変動下における発現動態分析、及びこれに基づく一次生産性変動予測動態モデルの構築を目的としている。
平成27年度における実施項目と成果の概要を以下にあげる。1.無機炭素輸送に関わる蛋白質候補の機能同定:H26年度に積み残していたSolute Carrier (SLC)タンパク質、アクアポーリンなどの因子の取得を完了し、これらの緑色蛍光タンパク質(GFP)融合体を、海洋性珪藻Phaeodactylum tricornutumおよびThalassiosira pseudonanaに強制発現し、これらの局在同定を完了した。SLCタンパク質については一部の葉緑体包膜局在が確認された。形質膜局在が確認されたもの全てがNa依存型重炭酸イオン輸送体であることが判明している。一方、アクアポーリンについても両珪藻で全ての局在決定を完了した。これらのうち、形質膜と葉緑体包膜に局在するものがCO2とアンモニアチャンネルであることを確認した。2.葉緑体内および周辺部に局在する炭酸脱水酵素(CA)、C4関連酵素の機能解析:特に葉緑体内のピレノイドに局在するCAの機能解析に大きな進展が有り、海洋性珪藻CCMの本質的なメカニズム解明に大きな突破口が開けた。即ち、ピレノイド局在型のCAのRNA干渉によるサイレンシグによって、このCCMに対する重要な役割が証明できた。また、チラコイドに特異的に局在する因子がCCMに必須の役割を負っていることが分かった。こちらの実験に多くの時間を使った。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Causes of Carryover

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Expenditure Plan for Carryover Budget

27年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (37 results)

All 2016 2015 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (10 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 3 results) Presentation (23 results) (of which Int'l Joint Research: 10 results,  Invited: 4 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Int'l Joint Research] J Craig Venter Institute/University of Georgia(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      J Craig Venter Institute/University of Georgia
  • [Int'l Joint Research] University of Konstanz(ドイツ)

    • Country Name
      GERMANY
    • Counterpart Institution
      University of Konstanz
  • [Int'l Joint Research] University of Hebrew(イスラエル)

    • Country Name
      ISRAEL
    • Counterpart Institution
      University of Hebrew
  • [Journal Article] Light and CO2/cAMP signal crosstalk on the promoter elements of chloroplastic β-carbonic anhydrase genes in the marine diatom Phaeodactylum tricornutum.2016

    • Author(s)
      Tanaka A, Ohno N, Nakajima K, Matsuda Y
    • Journal Title

      Plant Physiol

      Volume: 170 Pages: 1105-1116

    • DOI

      http://dx.doi.org/10.1104/pp.15.01738

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] The physiology and genetics of CO2 concentrating mechanisms in model diatoms.2016

    • Author(s)
      Hopkinson BM, Dupont CL, Matsuda Y
    • Journal Title

      Current Opinion in Plant Biology

      Volume: 31 Pages: 51-67

    • DOI

      http://dx.doi.org/10.1016/j.pbi.2016.03.013

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Enzyme characteristics of an euryarchaeota specific helicase from Thermococcus kodakarensis and its application for noise reduction in PCR.2016

    • Author(s)
      Fujiwara A, Kawato K, Kato S, Yasukawa K, Hides R, Fujiwara S
    • Journal Title

      Appl Environ Microbiol

      Volume: in press Pages: 04116-15

    • DOI

      10.1128/AEM.04116-15.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Diagnosis of early-stage esophageal cancer by Rama spectroscopy and chemometric techniques.2016

    • Author(s)
      Ishigaki M, Maeda Y, Taketani A, Andriana BB, Ishihara R, Wongravee K, Ozaki Y, Sato H
    • Journal Title

      Analyst

      Volume: 141 Pages: 1027-1033

    • DOI

      10.1039/C5AN01323B

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A mutant chaperonin that is functional at lower temperatures enables hyperthermophilic archaea to grow under cold-stress conditions.2015

    • Author(s)
      Gao L, Imanaka T, Fujiwara S
    • Journal Title

      J Bacteriol

      Volume: 197(16) Pages: 2642-2652

    • DOI

      10.1128/JB.00279-15

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 好熱菌の低温ストレス耐性2015

    • Author(s)
      秀瀬涼太、藤原伸介
    • Journal Title

      日本生物工学会誌

      Volume: 93(8) Pages: 464-467

  • [Journal Article] 超好熱菌の低温ストレス応答2015

    • Author(s)
      藤原伸介
    • Journal Title

      極限環境生物学会誌

      Volume: 14(2) Pages: 63-69

  • [Journal Article] In vivo study of lipid accumulation in the microalgae marine diatom Thalassiosira pseudonana using Raman spectroscopy2015

    • Author(s)
      Meksiarun P, Spegazzini N, Matsui H, Nakajima K, Matsuda Y Sato H
    • Journal Title

      Appl Spectrosc

      Volume: 69 Pages: 45-51

    • DOI

      http://dx.doi.org/10.1366/14-07598

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Analysis of the developing neural system using an in vitro model by Raman spectroscopy2015

    • Author(s)
      Hashimoto K, Kudoh SN Sato H
    • Journal Title

      Analyst

      Volume: 140 Pages: 2344-2349

    • DOI

      10.1039/C4AN01961J

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Analysis of the effects of dietary fat on body and skin lipids of hamsters by Raman spectroscopy2015

    • Author(s)
      Meksiarun P, Maeda Y, Hiroi T, Andriana BB, Sato H
    • Journal Title

      Analyst

      Volume: 140 Pages: 4238-4244

    • DOI

      10.1039/C5AN00076A

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 海洋性珪藻リン酸輸送体候補タンパク質2016

    • Author(s)
      福地庸平、杉山俊樹、木村奈々恵、中島健介、松田祐介
    • Organizer
      日本植物生理学会第57回年会
    • Place of Presentation
      岩手大学農学部(岩手県、盛岡市)
    • Year and Date
      2016-03-18
  • [Presentation] Isolation of novel pyrenoidal component from the marine diatom, Phaeodactylum tricornutum.2016

    • Author(s)
      森島菜摘、菊谷早絵、松田祐介
    • Organizer
      日本植物生理学会第57回年会
    • Place of Presentation
      岩手大学農学部(岩手県、盛岡市)
    • Year and Date
      2016-03-18
  • [Presentation] 海洋性珪藻における無機炭素獲得モードの比較解析2016

    • Author(s)
      辻敬典、Anggara Mahardika 松田祐介
    • Organizer
      日本植物生理学会第57回年会
    • Place of Presentation
      岩手大学農学部(岩手県、盛岡市)
    • Year and Date
      2016-03-18
  • [Presentation] Light and CO2/cAMP signal crosstalk on the promoter elements of two chloroplastic β-carbonic anhydrase genes in the marine diatom Phaeodactylum tricornutum.2016

    • Author(s)
      Matsuda Y
    • Organizer
      EMBP/EMBL Symposium: A new Age of discovery for Aquatic Microeukaryotes.
    • Place of Presentation
      Heidelberg (Germany)
    • Year and Date
      2016-01-27
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Rama spectroscopy for live cells and tissues.2015

    • Author(s)
      Sato H, Moor K, Meksiarun P, Ishigaki M, Maeda Y
    • Organizer
      Pacifichem 2015
    • Place of Presentation
      Honolulu (USA)
    • Year and Date
      2015-12-18
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Cold-stress response and adaptation in hyperthermophilic archaea2015

    • Author(s)
      Fujiwara S
    • Organizer
      PACIFICHEM2015
    • Place of Presentation
      Honolulu (USA)
    • Year and Date
      2015-12-16
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 超好熱性アーキアの低温誘導型分子シャペロニンの役割2015

    • Author(s)
      高楽,藤原伸介
    • Organizer
      第38回分子生物学会年会 第88回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県、神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-03
  • [Presentation] 好熱菌(耐熱性酵素)の低温適応機構2015

    • Author(s)
      藤原伸介
    • Organizer
      第38回分子生物学会年会 第88回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県、神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01
  • [Presentation] 耐熱性ヘリカーゼを利用した高精度核酸検出技術の開発2015

    • Author(s)
      藤原 綾子,保川 清,秀瀬 涼太,藤原伸介
    • Organizer
      第67回日本生物工学会
    • Place of Presentation
      城山観光ホテル(鹿児島県、鹿児島市)
    • Year and Date
      2015-10-26
  • [Presentation] Raman Spectroscopy for Practical Application in Medicine and Biology2015

    • Author(s)
      Sato H, Andriana BB, Matsuyoshi H
    • Organizer
      ACOVS11 and ASC5
    • Place of Presentation
      Sydney (Australia)
    • Year and Date
      2015-09-30
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 藻類の高効率光合成に関わる新規チラコイド因子2015

    • Author(s)
      菊谷早絵、宮武愛、長里千香子、松田祐介
    • Organizer
      日本植物学会第79回大会
    • Place of Presentation
      鷺メッセ・新潟コンベンションセンター(新潟県、新潟市)
    • Year and Date
      2015-09-08
  • [Presentation] 海洋性珪藻Phaeodactylum tricornutumにおけるPtSLC4-1の機能解析2015

    • Author(s)
      大橋弘章、中島健介、松田祐介
    • Organizer
      日本植物学会第79回大会
    • Place of Presentation
      鷺メッセ・新潟コンベンションセンター(新潟県、新潟市)
    • Year and Date
      2015-09-08
  • [Presentation] 海洋性珪藻における二酸化炭素センサー候補因子2015

    • Author(s)
      斉藤健人、松田祐介、中島健介、遠藤慧、伊藤香奈里
    • Organizer
      日本植物学会第79回大会
    • Place of Presentation
      鷺メッセ・新潟コンベンションセンター(新潟県、新潟市)
    • Year and Date
      2015-09-07
  • [Presentation] 海洋性珪藻における葉緑体CAの役割2015

    • Author(s)
      田尾尚大、菊谷早絵、松田祐介
    • Organizer
      日本植物学会第79回大会
    • Place of Presentation
      鷺メッセ・新潟コンベンションセンター(新潟県、新潟市)
    • Year and Date
      2015-09-07
  • [Presentation] Landscape of Raman Spectroscopy for biological and medical applications.2015

    • Author(s)
      Sato H
    • Organizer
      IUPA-2015
    • Place of Presentation
      Busan (Korea)
    • Year and Date
      2015-08-10
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Value added Fermentation Products by Metabolically Modified Acetic Acid Bacteria.2015

    • Author(s)
      FujiwaraS
    • Organizer
      The 6th International conference on Fermentation Technology for Value
    • Place of Presentation
      Khon Kaen (Thailand)
    • Year and Date
      2015-07-29
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Biosynthesis Pathway and Unique Functions of Branched Chain Polyamine from Thermophilic Microbes.2015

    • Author(s)
      Fujiwara S
    • Organizer
      Gordon Research Conferences
    • Place of Presentation
      Waterville Valley (USA)
    • Year and Date
      2015-06-15
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Detection of meiosis and the allelic recombination by molecular marker in Phaeodactylum tricornutum.2015

    • Author(s)
      Oi T, Mizutani S, Matsuda Y
    • Organizer
      The 3rd Molecular Life of Diatoms
    • Place of Presentation
      Seattle (USA)
    • Year and Date
      2015-06-08
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Aquaporins in two marine diatoms, Phaeodactylum tricornutum and Thalassiosira pseudonana.2015

    • Author(s)
      Matsui H, Matsuda Y
    • Organizer
      The 3rd Molecular Life of Diatoms
    • Place of Presentation
      Seattle (USA)
    • Year and Date
      2015-06-08
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] The novel protein localized in pyrenoid-penetrating thylakoid in a marine diatom, Phaeodactylum tricornutum.2015

    • Author(s)
      Kikutani S, Yamazaki Y, Matsuda Y
    • Organizer
      The 3rd Molecular Life of Diatoms
    • Place of Presentation
      Seattle (USA)
    • Year and Date
      2015-06-08
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 海洋性珪藻におけるピレノイド及びCCM因子の環境応答解析2015

    • Author(s)
      宮武愛、松田祐介
    • Organizer
      第6回 日本光合成学会年会
    • Place of Presentation
      岡山国際交流センター(岡山県、岡山市)
    • Year and Date
      2015-05-22
  • [Presentation] 海洋性珪藻における新規葉緑体因子の局在と機能解析2015

    • Author(s)
      仁川舞、菊谷早絵、宮武愛、長里千香子、松田祐介
    • Organizer
      第6回 日本光合成学会年会
    • Place of Presentation
      岡山国際交流センター(岡山県、岡山市)
    • Year and Date
      2015-05-22
  • [Presentation] 海洋性珪藻Phaeodactylum tricornutumにおけるPtSLC4-1の機能解析2015

    • Author(s)
      大橋弘章、中島健介、松田祐介
    • Organizer
      第6回 日本光合成学会年会
    • Place of Presentation
      岡山国際交流センター(岡山県、岡山市)
    • Year and Date
      2015-05-22
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 新規cDNA合成法2015

    • Inventor(s)
      保川清、岡野啓志、藤原伸介、藤原綾子、柳原格、名倉由起子、林司
    • Industrial Property Rights Holder
      保川清、岡野啓志、藤原伸介、藤原綾子、柳原格、名倉由起子、林司
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2015-232383
    • Filing Date
      2015-11-27

URL: 

Published: 2017-01-06   Modified: 2022-01-27  

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