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2014 Fiscal Year Annual Research Report

中性子散乱を用いたタンパク質の高次構造における動態解析法の開発

Research Project

Project/Area Number 24310068
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

杉山 正明  京都大学, 原子炉実験所, 教授 (10253395)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 加藤 晃一  名古屋市立大学, 薬学研究科(研究院), 教授 (20211849)
藤井 紀子  京都大学, 原子炉実験所, 教授 (90199290)
井上 倫太郎  京都大学, 原子炉実験所, 准教授 (80563840)
佐藤 信浩  京都大学, 原子炉実験所, 助教 (10303918)
大場 洋次郎  京都大学, 原子炉実験所, 助教 (60566793)
Project Period (FY) 2012-04-01 – 2015-03-31
KeywordsSANS / 部分重水素化 / 逆転コントラスト変調法
Outline of Annual Research Achievements

機能発現に関連してタンパク質の高次構造の動態解析は非常に重要である。この騎亜席のための測定を困難にしているのは、機能発現の場が水溶液中であり、詳細な構造解析手法である単結晶構造解析法が使えない事である。そこで本研究では小角散乱を利用した溶液散乱法に注目している。特に本研究の特徴はプローブとして中性子を用いることで散乱におけるの同位体効果の利用している点である。中性子溶液散乱における同位体効果では軽水素と重水素間の大きな散乱長の違が重要であり、本研究では「H2O/D2O混合比の変化による溶媒である水の散乱能調整」や「タンパク質自身の重水素化による標識化」などを利用した複合た生体分子の部分構造の解析法を開発してきた。
上記のコントラスト(=溶媒と溶質の散乱能の差)を変調する手法は動態に関連する部分構造を選択的に観測するためには非常に有力な手法であるが、非選択(=不可視化)とする部分構造は当然観測されないので、構造全体を観測する場合と比較して散乱強度自身は減少する。加えて、非選択のタンパク質を不可視化するために溶媒は40%D2O(=60%H2O)を用いる。この60%H2Oに含まれる軽水素は非常に強度の強く構造情報を持たない非干渉性散乱(=バックグラウンドとなる)の発生源となる。したがって、非干渉性散乱強度が弱い100%D2O溶媒中でタンパク質を不可視化(同時に注目タンパク質を選択的に可視化)することが可能になれば、より高精度な測定が可能となる。そこで、今年度は重水中で不可視化する75%重水素化(=完全に重水素化しない)タンパク質の調製を試み、このタンパク質を用いてタンパク質複合体の部分構造の測定を行った。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Causes of Carryover

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Expenditure Plan for Carryover Budget

26年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (5 results)

All 2015 2014

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (4 results) (of which Invited: 4 results)

  • [Journal Article] Conformational characterization of a protein complex involving intrinsically disordered protein by small-angle neutron scattering using the inverse contrast matching method: a case study of interaction between α-synuclein and PbaB tetramer as a model chaperone2014

    • Author(s)
      M. Sugiyama, H. Yagi, T. Yamaguchi, K. Kumoi, M. Hirai, Y. Oba, N. Sato, L. Porcar, A. Martel, and K. Kato
    • Journal Title

      Journal of Applied Crystallography

      Volume: 47 Pages: 430-435

    • DOI

      10.1107/S1600576713033475

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Biological SANS for next stage2015

    • Author(s)
      杉山正明
    • Organizer
      第3回Neutrons in Biology Japan研究会
    • Place of Presentation
      日本原子力研究所(茨城県那珂郡東海村)
    • Year and Date
      2015-03-31 – 2015-03-31
    • Invited
  • [Presentation] 中性子小角散乱の基礎と応用2015

    • Author(s)
      杉山正明
    • Organizer
      日本化学会 第95春季年会
    • Place of Presentation
      日本大学 理工学部船橋キャンパス(千葉県船橋市)
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • Invited
  • [Presentation] 中性子の中性子による中性子のための生物溶液散乱2015

    • Author(s)
      杉山正明
    • Organizer
      第6回MLFシンポジウム
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場(つくば市)
    • Year and Date
      2015-03-18 – 2015-03-18
    • Invited
  • [Presentation] コントラスト変調及び重水素化で見るタンパク質の溶液中の静的・動的構造2014

    • Author(s)
      杉山正明
    • Organizer
      第37回溶液化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      佐賀県立男女共同参画センター・佐賀県立生涯学習センター(佐賀市)
    • Year and Date
      2014-11-12 – 2014-11-14
    • Invited

URL: 

Published: 2016-06-01  

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