2014 Fiscal Year Annual Research Report
マウス細胞内に存在する低分子ＲＮＡの高次構造に基づく網羅的解析
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24310147
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| Research Institution | Chiba Institute of Technology |
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Principal Investigator |
河合 剛太 千葉工業大学, 工学部, 教授 (70211860)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
清澤 秀孔 高知大学, 医学部, 准教授 (30295422)
牛田 千里 弘前大学, 農学生命科学部, 准教授 (50250593)
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| Project Period (FY) |
2012-04-01 – 2015-03-31
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| Keywords | 機能性RNA / NMR / 立体構造解析 / トランスクリプト―ム |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究計画では，遺伝学的，生化学的，および構造生物学的アプローチを駆使して，マウス由来の新規低分子RNAの解析を進めている．平成26年度における研究成果は次の通りである．
1) 低分子RNA候補の二次構造解析とクラスタリング：マウスの脳に由来するRNAの解析の結果，16種類の新規RNA候補を見出した．これらをMsncR（mouse structured non-coding RNAに由来）と呼ぶこととした．この成果をまとめ，論文として発表した（雑誌論文1）．
2) 低分子RNA候補の立体構造スクリーニング：新規スクリーニング手法としてINTT法（in NMR tube transcriptionに由来）を開発し，論文として発表した（雑誌論文2）．
3) ノーザン解析：16種類の新規RNA候補の発現を確認するため，得られたcDNA配列をもとにプローブを作製し，ノーザンハイブリダイゼーションを行った。このうち，明確なシグナルが得られたものは1種類であったが，その大きさに関してはcDNA配列と矛盾する点があった。継続して解析を行っている。
4) 低分子RNA候補の立体構造解析：MsncR-11に着目し，立体構造解析を進めた．MsncR-11は，ミトコンドリアtRNA遺伝子の裏鎖に相当するRNAであり，ミトコンドリアmRNAのプロセシングに関与している可能性がある．NMR法による解析を行ったところ，MsncR-11は，tRNAのアクセプタステムとTステムに相当する二次構造を形成していることが示唆され，現在論文作成中である．
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| Research Progress Status |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Causes of Carryover |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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