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2015 Fiscal Year Annual Research Report

葉緑体のレドックス代謝を駆動する蛋白質群の弱い分子間相互作用の包括的解析

Research Project

Project/Area Number 24370021
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

長谷 俊治  大阪大学, たんぱく質研究所, 教授 (00127276)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 池上 貴久  横浜市立大学, 生命医学研究科, 教授 (20283939)
Project Period (FY) 2012-04-01 – 2016-03-31
Keywords葉緑体 / レドックス代謝 / フェレドキシン / 酸化還元酵素 / 分子間相互作用
Outline of Annual Research Achievements

フェレドキシン(Fd)は、[2Fe-2S]クラスターをもつ電子キャリアータンパク質であり、葉緑体の還元同化反応を司る多様な酵素群への電子供与体として働いている。Fdとこれらの酵素群との間では効率的な電子の授受が行なわれており、これは両者が電子伝達複合体を形成して分子間の電子移動に適した分子環境を作り出しているためである。これまでFd:NADPH酸化還元酵素(FNR)及び亜硫酸還元酵素(SiR)とFdとの2種の電子伝達複合体の立体構造を決定したので、最終年度は酵素活性や複合体形成の物理化学的特性を包括的な理解に注力した。結果を以下に記す。
1)複合体中ではFdの[2Fe-2S]クラスターは、FNRのフラビンおよびSiRの[4Fe-4S]クラスターとの距離が6から10オングストローム程度に近接しおり、電子移動の媒体になるような構造は認められないので、トンネル効果による電子移動が主要であると結論した。
2)FdとFd-依存性酵素との分子間相互作用に着目して、部位特異的変異体の生化学的解析を行った。Fd側の酸性残基群と酵素側の塩基性残基群の網羅的改変により静電力の寄与の重要性を確認し、特に酵素側の改変が電子授受の大きな低下を引き起こすことが判明した。
3)Fdと酵素の接触部位に存在する非荷電性残基や疎水性残基の改変では、一律的な酵素反応の変化や複合体の親和力の低下は認められず、非静電的な相互作用力は複合体の最適構造の形成に寄与する微調整の役割を果たしていることが示唆された。
4)等温滴定熱測定法で複合体形成の熱力学的パラメーターを求めたところ、Fd/FNRとFd/SiRいずれの場合も自由エネルギーが減少するが、前者は吸熱反応後者は発熱反応であり、複合体形成の熱力学特性に違いがあることが判明した。複合体形成時にFNRの場合は構造変化が誘起され、一方SiRの場合は大きな変化はないことが、この観察と関連するものと現時点では推察できる。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Causes of Carryover

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Expenditure Plan for Carryover Budget

27年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (9 results)

All 2016 2015 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 1 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 3 results)

  • [Int'l Joint Research] 国立農業研究所(フランス)

    • Country Name
      FRANCE
    • Counterpart Institution
      国立農業研究所
  • [Int'l Joint Research] ボッフム大学(ドイツ)

    • Country Name
      GERMANY
    • Counterpart Institution
      ボッフム大学
  • [Journal Article] Impact of the disruption of ASN3 encoding asparagine synthetase on Arabidopsis development.2016

    • Author(s)
      1.Gaufichon L., Marmagne A.,Yoneyama T., Hase T., Clément G., Trassaert M., Xu X., Shakiebaei M., Najihi A., and Suzuki A
    • Journal Title

      Agronomy

      Volume: 6 Pages: 12

    • DOI

      10.3390/agronomy6010012

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Structural and mutational studies of an electron transfer complex of maize sulfite reductase and ferredoxin2016

    • Author(s)
      Kim J.Y., Nakayama M., Toyota H., Kurisu G., and Hase T
    • Journal Title

      J. Biochemistry

      Volume: in press Pages: XXX

    • DOI

      10.1093/jb/mvw016

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Purification and characterization of recombinant sugarcane sucrose phosphate synthase expressed in E. coli and insect Sf9 cells: An importance of the N-terminal domain for an allosteric regulatory property2016

    • Author(s)
      Sawitri W.D., Narita H., Ishizaka-Ikeda E., Sugiharto B., Hase T., and Nakagawa A
    • Journal Title

      J. Biochemistry

      Volume: in press Pages: XXX

    • DOI

      10.1093/jb/mvw004

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] X-ray structure and nuclear magnetic resonance analysis of the interaction sites of the Ga-substituted cyanobacterial ferredoxin.2015

    • Author(s)
      Mutoh R., Muraki N., Shinmura K., Kubota-Kawai H., Lee YH., Nowaczyk MM., Rögner M., Hase T., Ikegami T., and Kurisu G.
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 54 Pages: 6052-6061

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.5b00601

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 植物FdとFd依存性酵素群の複合体構造からみた鉄硫黄蛋白質の電子伝達特性2015

    • Author(s)
      長谷俊治、金宙妍、筑摩悠太郎、有賀(木股)洋子
    • Organizer
      BMB2051
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-05
    • Invited
  • [Presentation] Modulation of protein-protein interaction of Fd and Fd-dependent enzymes2015

    • Author(s)
      Toshiharu Hase, Ju Yaen Kim, Yutaro Chikuma and Yoko Ariga
    • Organizer
      第68回山田コンファレンス
    • Place of Presentation
      奈良市、公会堂
    • Year and Date
      2015-10-29 – 2015-10-31
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Our understanding of molecular mechanism of protein-protein interaction between Fd and redox enzymes in plant photosyntdhesis2015

    • Author(s)
      Toshiharu Hase
    • Organizer
      Molecular and Cellular Life Sciences: Infectious deseases, biochemistry and structrual biology, MCLS2015
    • Place of Presentation
      Surabaya, Indonesia
    • Year and Date
      2015-05-07 – 2015-05-08
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2017-01-06  

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