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2013 Fiscal Year Annual Research Report

酸素発生反応を安定化させる光化学系ΙΙ表在性タンパク質の構造・機能・進化

Research Project

Project/Area Number 24370025
Research InstitutionTokyo University of Science

Principal Investigator

鞆 達也  東京理科大学, 理学部, 准教授 (60300886)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 野口 巧  名古屋大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (60241246)
三野 広幸  名古屋大学, 理学(系)研究科(研究院), 准教授 (70300902)
Project Period (FY) 2012-04-01 – 2015-03-31
Keywords光合成 / 光化学系 / 酸素発生 / 表在性タンパク質
Research Abstract

酸素は従属生物にとって必須の分子であり、光合成光化学系II複合体は水を分解し酸素を供給することに特徴を持つ。この反応は光化学系II表在性タンパク質によって安定化されており、表在性タンパク質が遊離すると酸素発生活性は劇的に減少する。また、表在性タンパク質はPsbOを除いて生物種ごとに多様性に富んでおり、シアノバクテリア以外では局在位置すら明らかになっていない。表在性タンパク質の機能・構造を解き明かすことが酸素の供給のみならず、光合成の進化の解明につながる。
本年度は、二次共生藻である珪藻・渦鞭毛藻等に特異的に存在する表在性タンパク質であるPsb31の結晶構造を報告した。このタンパク質は4本のヘリックスを持ち、単独で光化学系IIに結合しても酸素発生を回復することから表在性タンパク質の構造・機能・相関において重要な知見を与えた。また、Thermosynechococcus elongatus BP-1の光化学系IIに種々の組み合わせで表在性タンパク質を結合させ、光誘起差FT-IRの手法を用いて水分解中心であるMn4CaO5クラスターのS1→S2状態の遷移に関する寄与を調べたところ、PsbOとPsbVがタンパク質の二次構造に重要な影響を与えることを明らかにした。また、紅藻以降の二次共生生物に特異的に存在するPsbQ′タンパク質をPsbQ′を持たないシアノバクテリアに化学量論的に結合させることに成功した。この標品を用いて、閃光照射後の電荷再結合で観測される酸化側と還元側の変化が解析可能な熱発光の手法を用いて実験を行った結果、電子受容体QAの電位が正方向にシフトしている結論が得られた。これは、紅藻が新たに獲得したPsbQ′が過剰な光に対する電子伝達逆反応において保護作用として働いていると示唆された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

大腸菌による、光化学系II表在性タンパク質の大量発現、および精製系を確立した。
珪藻に存在する光化学系II表在性タンパク質Psb31の構造を明らかにし、またPsbO, PsbV, PsbQ'機能を光差誘起差赤外分光法や熱発光、酸化還元滴定法等の種々の物理化学的測定によって明らかにした。
当初の研究計画に従って、さらなる追加実験を行っている。本研究により光化学系II酸素発生反応を安定化する、表在性タンパク質の機能・構造相関解明に繋がる。

Strategy for Future Research Activity

研究分担者と物理化学的測定において引き続き協力をすすめ、生物の多様性を利用した光合成水分解系の解析を進める。また、当研究室で開発した、光化学系II表在性タンパク質の再構成手法により、光合成生物の酸素発生反応と環境応答を明らかにし、生物による環境の多様性の維持を科学的に明らかにする。

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

当初計画していた備品の購入を科学技術振興機構で得た追加予算で購入したため、未使用分が生じた。
本年度は、未使用分と併せて全額予算消化を行う。

  • Research Products

    (19 results)

All 2014 2013 Other

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results) Presentation (10 results) (of which Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Structural Coupling of Extrinsic Proteins with the Oxygen-Evolving Center in Red Algal Photosystem II As Revealed by Light-Induced FTIR Difference Spectroscopy2013

    • Author(s)
      Chihiro Uno, Ryo Nagao, Hiroyuki Suzuki, Tatsuya Tomo, Takumi Noguchi
    • Journal Title

      BIOCHEMISTRY

      Volume: 52 Pages: 5705-5707

    • DOI

      10.1021/bi4009787

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal Structure of Psb31, a Novel Extrinsic Protein of Photosystem II from a Marine Centric Diatom and Implications for Its Binding2013

    • Author(s)
      Ryo Nagao, Michihiro Suga, Ayako Niikura, Akinori Okumura, Faisal Hammad Mekky Koua, Takehiro Suzuki, Tatsuya Tomo,Isao Enami, Jian-Ren Shen
    • Journal Title

      BIOCHEMISTRY

      Volume: 52 Pages: 6646-6652

    • DOI

      10.1021/bi400770d

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Comparison of oligomeric states and polypeptide compositions of fucoxanthin chlorophyll a/c-binding protein complexes among various diatom species2013

    • Author(s)
      Ryo Nagao, Shuji Takahashi, Takehiro Suzuki, Naoshi Dohmae, Katsuyoshi Nakazato, Tatsuya Tomo
    • Journal Title

      PHOTOSYNTHESIS RESEARCH

      Volume: 117 Pages: 281-288

    • DOI

      10.1007/s11120-013-9903-5

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Light-independent biosynthesis and assembly of the photosystem II complex in the diatom Chaetoceros gracilis2013

    • Author(s)
      Ryo Nagao, Tatsuya Tomo, Rei Narikawa, Isao Enami, Masahiko Ikeuchi
    • Journal Title

      FEBS LETTERS

      Volume: 587 Pages: 1340-1345

    • DOI

      10.1016/j.febslet.2013.02.050

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] High Excitation Energy Quenching in Fucoxanthin Chlorophyll a/c-Binding Protein Complexes from the Diatom Chaetoceros gracilis2013

    • Author(s)
      Ryo Nagao, Makio Yokono, Seiji Akimoto and Tatsuya Tomo
    • Journal Title

      Ryo Nagao, Makio Yokono, Seiji Akimoto and Tatsuya Tomo

      Volume: 117 Pages: 6888-6895

    • DOI

      10.1021/jp403923q

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Functional roles of D2-Lys317 and the interacting chloride ion in the water oxidation reaction of photosystem II as revealed by Fourier transform infrared analysis2013

    • Author(s)
      H. Suzuki, J. Yu, T. Kobayashi, H. Nakanishi, P. Nixon, T. Noguchi
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 52 Pages: 4748-4757

    • DOI

      10.1021/bi301699h

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Monitoring the reactions of photosynthetic water oxidation using infrared spectroscopy2013

    • Author(s)
      T. Noguchi
    • Journal Title

      Biomedical Spectroscopy and Imaging

      Volume: 2 Pages: 115-128

    • DOI

      10.3233/BSI-130040

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Electronic structure of S2 state of the oxygen-evolving complex of photosystem II studied by PELDOR2013

    • Author(s)
      M. Asada, H. Nagashima, F. H. M. Koua, J.-R. Shen, A. Kawamori, and H. Mino
    • Journal Title

      Biochim. Biophys. Acta

      Volume: 1827 Pages: 438-445

    • DOI

      10.1007/BF03161886

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] シアノバクテリアの光化学系II における表在性蛋白質と水分解中心との相互作用2014

    • Author(s)
      長尾遼,中西華代,鞆達也,野口巧
    • Organizer
      第55回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      富山市・富山大学五福キャンパス
    • Year and Date
      20140318-20140320
  • [Presentation] クロロフィルfを持つシアノバクテリアのエネルギー移動機構の解析2014

    • Author(s)
      篠田稔行,秋本誠志,Min Chen,Suleyman I. Allakverdiev,鞆達也
    • Organizer
      第55回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      富山市・富山大学五福キャンパス
    • Year and Date
      20140318-20140320
  • [Presentation] 共生藻Symbiodinium spp. OAH-1 の光化学系I 標品の単離とその性質2014

    • Author(s)
      清水信介,松尾高稔,春原沙季,長尾遼,鈴木健裕,堂前直,高橋俊一,鞆達也
    • Organizer
      第55回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      富山市・富山大学五福キャンパス
    • Year and Date
      20140318-20140320
  • [Presentation] ホスファチジルグリセロール結合部位の改変が光化学系II に及ぼす影響2014

    • Author(s)
      遠藤嘉一郎,水澤直樹,沈建仁,山田聖人,鞆達也,小林康一,和田元
    • Organizer
      第55回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      富山市・富山大学五福キャンパス
    • Year and Date
      20140318-20140320
  • [Presentation] 光化学系II水分解中心と表在性蛋白質との相互作用:FTIR法による解析2014

    • Author(s)
      長尾遼、中西華代、鞆達也、野口巧
    • Organizer
      平成25年度生物物理学会中部支部講演会
    • Place of Presentation
      岡崎市・岡崎コンファレンスセンター
    • Year and Date
      20140306-20140306
  • [Presentation] FTIR study on the functions of the extrinsic proteins in cyanobacterial photosystem II: Evolutionary aspect of extrinsic proteins2013

    • Author(s)
      Ryo Nagao, Hanayo Ueoka-Nakanishi, Chihiro Uno, Tatsuya Tomo, Takumi Noguchi
    • Organizer
      第51回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      京都・国立京都国際会館
    • Year and Date
      20131028-20131030
  • [Presentation] Low photon-energy utilization by cyanobacteria2013

    • Author(s)
      Tatsuya Tomo
    • Organizer
      1st Korea-Japan Microalgae Symposium
    • Place of Presentation
      Korea Advanced Institute of Science and Technology,Daejeon, Korea
    • Year and Date
      20131010-20131012
    • Invited
  • [Presentation] FTIR study on the interactions of the extrinsic proteins with the water-oxidizing center in cyanobacterial photosystem II: Evolutionary aspect of the functions of the extrinsic proteins2013

    • Author(s)
      Ryo Nagao, Hanayo Ueoka-Nakanishi, Chihiro Uno, Tatsuya Tomo, Takumi Noguchi
    • Organizer
      16th International Congress on Photosynthesis Research
    • Place of Presentation
      St. Louis, Hyatt Reagency at the Arch
    • Year and Date
      20130811-20130816
  • [Presentation] 1st Awaji International Workshop on “Electron Spin Science & Technology: Biological and Materials Science Oriented Applications2013

    • Author(s)
      Hiroyuki Mino, Mizue Asada, Hiroki Nagashima, Tatsuya Tomo, Ryosuke Tajika, Risa Mutoh, Masahiro Ishiura
    • Organizer
      1st Awaji International Workshop on “Electron Spin Science & Technology: Biological and Materials Science Oriented Applications
    • Place of Presentation
      Awaji, Hyogo
    • Year and Date
      20130616-20130618
  • [Presentation] Redox regulation of photosystem II with a focus on new chlorophyll2013

    • Author(s)
      T. Tomo, T. Tsuchiya, K. Watabe, M. Araki, S. Akimoto, S.I. Allakhverdiev
    • Organizer
      International meeting"Photosynthesis Research for Sustainability - 2013"
    • Place of Presentation
      Baku, Azerbaijan
    • Year and Date
      20130605-20130609
    • Invited
  • [Remarks] 鞆研ウエブサイト

    • URL

      http://www.rs.tus.ac.jp/tomo/

URL: 

Published: 2015-05-28  

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