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2015 Fiscal Year Annual Research Report

無脊椎動物の視覚情報変換・伝達の構造基盤

Research Project

Project/Area Number 24370043
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

村上 緑  名古屋大学, 理学(系)研究科(研究院), 助教 (20324387)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 神山 勉  名古屋大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (30170210)
Project Period (FY) 2012-04-01 – 2016-03-31
Keywords光受容 / ロドプシン
Outline of Annual Research Achievements

これまでに暗順応状態のイカロドプシンの結晶に対し光反応を惹起させ低温下で反応中間体を捕捉し、バソ中間体、イソロドプシン、ルミ中間体の構造を求めた。昨年度までに本研究課題において LM 中間体の構造解析を行い現在論文投稿準備中である。
さらなる後期中間体の構造を求めるに当たり、暗順応状態の結晶に 4℃で光照射すると光活性型へと変換されたが結晶性が著しく劣化し回折データの取得は困難であった。本研究課題では新たに結晶化条件を検討し、今年度までにいくつかの新奇結晶を得ることができた。
イカ網膜から微絨毛膜を純度よく単離し、暗順応状態のロドプシンを含む微絨毛膜標品に対し4℃で青色光を照射し、 pH 依存的な光産物の平衡状態を形成させた。この膜標品を界面活性剤オクチルグルコシドを用いて可溶化し広い pH 範囲で結晶化を試みたところ、赤橙色の六方晶の結晶が得られた。結晶が生成された pH は溶液系では酸性型の形成率が100%であるので、この結晶はアシッドメタ状態の結晶であると考えられる。回折実験を行い 3A を超える回折斑点が確認され現在解析中である。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (5 results)

All 2015

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results)

  • [Journal Article] Structural comparison between the open and closed forms of citrate synthase from Thermus thermophilus HB82015

    • Author(s)
      E Kanamori E, Kawaguchi S, Kuramitsu S, Kouyama T, Murakami M
    • Journal Title

      Biophys. Physicobiol.

      Volume: 12 Pages: 47-56

    • DOI

      10.2142/biophysico.12.0_47

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Crystallographic Study of the LUMI Intermediate of Squid Rhodopsin2015

    • Author(s)
      Murakami M, Kouyama T
    • Journal Title

      PloS one

      Volume: 10 Pages: e0126970

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0126970

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Crystal structures of the L1, L2, N, and O states of pharaonis halorhodopsin2015

    • Author(s)
      Kouyama T, Kawaguchi H, Nakanishi T, Kubo H, Murakami M
    • Journal Title

      Biophys. J.

      Volume: 108 Pages: 2680-2690

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2015.04.027

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Structural changes of squid rhodopsin during the thermal relaxation process in the P62 crystal2015

    • Author(s)
      Murakami M, Kouyama T
    • Organizer
      Pacifichem 2015
    • Place of Presentation
      Honolulu
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Crystallographic study of the LM intermediate of squid rhodopsin2015

    • Author(s)
      村上緑,神山勉
    • Organizer
      第53回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      金沢
    • Year and Date
      2015-09-13 – 2015-09-15
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2017-01-06  

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