2012 Fiscal Year Annual Research Report
ヒト上科で種特異的に生じている反復配列増減の比較ゲノム実験に基づく定量的な解析
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24370098
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
古賀 章彦 京都大学, 霊長類研究所, 教授 (80192574)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
島田 敦子 東京大学, 大学院・理学系研究科, 助教 (20376552)
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| Project Period (FY) |
2012-04-01 – 2015-03-31
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| Keywords | ゲノム / 進化 / 遺伝学 / 人類学 / 霊長類 / 反復配列 |
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| Research Abstract |
本研究課題は、ヒト上科の種で急速な増幅(生成を含む)や縮小(消失を含む)のあった反復配列を網羅的に同定し、そのうちから種の適応進化に深く関わっていると推測されるものを選び出すことを、目的としている。選んだものについての進化的意義の本格的な解析は、後年の別建ての研究課題とするが、少数の有力な候補についての解析は本研究課題に含めている。
今年度(1年目)は、テナガザル科4属にまたがる計6種について探索を行い、4つの反復配列を、急速な増幅を遂げたものの候補として同定した。また、本研究課題の探索の対象はヒト上科に設定していたものの、これを修正し、新世界ザルも対象に含めた。本研究課題の実験法の原理は、生物種に依存せずどの生物種にも適用できること、および並行して実施している挑戦的萌芽研究から、新世界ザルに属するヨザルに特異な反復配列があると推測されたためである。その結果、ヨザルで急速な増幅を遂げた反復配列の同定に至った。
テナガザル科で同定した4つの反復配列のうちの1つ、およびヨザルで同定した反復配列は、当該のホスト種では規模が大きく、かつ、ごく近縁の種には存在しない。この結果から、増幅の速度がきわめて高いものと推測した。そこで、3年目に行う予定であった実態の解析を、前倒しにして小規模で行った。いずれも、アルファサテライトDNA(霊長類のセントロメアの主要なDNA成分)の派生型であるとの結論を得た。ヨザルについてはすでに論文に発表し、テナガザルのほうは論文の作成を開始したところである。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
1: Research has progressed more than it was originally planned.
Reason
「9.研究実績の概要」欄に記すように、対象とする生物種の範囲の拡大、および3年目に予定していた解析の1年目での実施が、実現している。
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| Strategy for Future Research Activity |
1年目は、ヒト上科のうちテナガザル科の4種のみに限定して探索を行った。2年目は、当初の予定どおり、対象にテナガザル科の他の種、およびヒト科(チンパンジー、ゴリラ等)を含める。また、1年目に計画を拡張して加えた新世界ザル(タマリン、マーモセット等)についても、探索を継続する。
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| Expenditure Plans for the Next FY Research Funding |
実験法の改良にも常時留意していた。それが奏功して消耗品の使用が効率化し、資金に余剰が生じた。次年度は探索の規模を予定より拡大し、この余剰分と来年度分を合わせて使用することで、計画全体の達成度の向上を図る。
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