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2012 Fiscal Year Annual Research Report

酵素による難分解性ポリマーの分解・除去・加工技術の開発

Research Project

Project/Area Number 24380055
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

金谷 茂則  大阪大学, 大学院・工学研究科, 教授 (30273585)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2015-03-31
Keywordsサチライシン / セリンプロテアーゼ / 超好熱菌 / プリオン分解 / クチナーゼ / 成熟化 / X線結晶構造解析 / 菌体外漏出
Research Abstract

(1)LC-cutinaseの結晶構造解析と基質結合部位の同定:LC-cutinaseの結晶構造を1.5Åの分解能で決定した。その結果、LC-cutinaseは、10本のαヘリックスと分子中央部の1枚の大きなβシートを形成する9本のβ鎖から成ること、分子内にジスルフィド結合(Cys275-Cys292)を一つもつことを明らかにした。また、Ser165、Asp210、His242が活性部位を、Tyr95、Phe125、Tyr127、Met166、Trp190、Phe243が基質結合部位を形成することを明らかにした。
(2)LC-cutinaseの大腸菌菌体外漏出機構の解析:LC-cutinaseの大腸菌菌体外への漏出に必要な領域を同定する目的で、N末端領域を欠失させた3種類の変異体LCC(58-293)、LCC(68-293)、LCC(83-293)を構築し、菌体外漏出を解析した。その結果、LCC(58-293)とLCC(68-293)は菌体外に漏出するが、LCC(83-293)は菌体外に漏出しないことを明らかにした。従って、β2鎖が菌体外漏出に必要であることが示唆された。
(3)効率の良いTk-subtilisinの成熟化法の開発:プロペプチドドメインに変異を導入した2つのPro-Tk-subtilisin変異体(F17H、L69P)がいずれも野生型酵素より速く成熟化することを明らかにした。また、これらの変異体の成熟化速度が向上したのは、L69Pの場合はプロペプチドの阻害活性の低下により、F17Hの場合はプロペプチドの安定性の低下により、プロペプチドが分解されやすくなったためであることを明らかにした。
(4)Tk-SPによる異常プリオン分解:Tk-SPの生産量の向上を目的として、Pro-Tk-SPとそのプロペプチド(ProN)の共発現系を構築した。しかし、ProNは不溶性タンパク質として菌体内に蓄積するため、Pro-Tk-SPの成熟化を抑制することはできず、その生産量を向上させることはできなかった。一方、プリオン病に感染したマウスの脳から異常プリオンタンパク質を抽出し、Tk-SPによる分解をウエスタンブロッティング法により解析することにより、Tk-subtilisin同様、Tk-SPも異常プリオンを分解することを明らかにした。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

今年度の目標としていた、1)LC-cutinaseの結晶構造解析、2)LC-cutinaseの大腸菌菌体外漏出領域の同定、3)Tk-subtilisinの成熟化速度の向上、4)Tk-SPの大量生産、5)Tk-SPによる異常プリオンの分解、のうち、1)、3)、5)についてはほぼ完全に目的を達成したため。また、2)と4)についても、来年度中に目的を達成できる目途がついたため。

Strategy for Future Research Activity

当初の予定通り、LC-cutinaseの高活性化と安定化、漏出シグナルの同定(限定化)、Tk-subtilisinの高機能化を検討する。Tk-SPの大量生産に関しては、プロペプチドの可溶性タンパク質としての発現とPro-Tk-SPとの共発現不溶性融合タンパク質としての発現と再構成、などを検討する。また新たに、Tk-SPのキレート剤に対する安定〓や、Tk-subtilisinやTk-SPによる異常プリオンタンパク質分解機構の解析に取り組む。

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

本研究を推進するために基金助成金で特任研究員を1名雇用している。雇用は初年度10月に開始したが、優れた研究成果を得るためにはこの特任研究員をできるだけ長期間継続して雇用することが望ましい。従って、次年度に繰り越した初年度の基金助成金の一部は、次年度の基金助成金と合わせて、現在雇用している特任研究員の次年度の雇用や旅費に充当する。また次年度の補助金は、初年度同様、物品費や旅費に充当する。

  • Research Products

    (14 results)

All 2013 2012

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results) Presentation (6 results)

  • [Journal Article] Accelerated maturation of Tk-subtilisin by a Leu→Pro mutation at the C-terminus of propeptide which reduces the binding of propeptide to Tk-subtilisin.2013

    • Author(s)
      Uehara, R., Ueda, Y., You, D-J., Koga, Y., and Kanaya, S.
    • Journal Title

      FEBS Journal

      Volume: 280 Pages: 994-1006

    • DOI

      10.1111/febs.12091.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Enzymatic activity of a subtilisin homo log, Tk-SP, from Thermococcus kodakarensis in detergents and its ability to degrade the abnormal prion protein.2013

    • Author(s)
      Hirata, A., Hori, Y., Koga, Y., Sakudo, A., Ikuta, K., Kanaya, S.,
    • Journal Title

      BMC Biotechnology

      Volume: 13 Pages: 19

    • DOI

      10.1186/1472-6750-13-19.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Requirement of Ca2+ ions for the hyperthermostability of Tk-subtilisin from Thermococcus kodakarensis.2012

    • Author(s)
      Uehara, R., Takeuchi, Y., Tanaka, S., Takano, K., Koga. Y., and Kanaya S.
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 51 Pages: 5369-5378

    • DOI

      10.1021/bi300427u.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structure and characterization of RNase H3 from Aquifex aeolicus.2012

    • Author(s)
      Jongruja, N., You, D-J., Angkawidjaja, C., Kanaya. E., Koga,
    • Journal Title

      FEBS Journal

      Volume: 279 Pages: 2737-2753

    • DOI

      10.1111/j.1742-4658.2012.08657.x.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Requirement of lid2 for interfacial activation of a family I.3 lipase with unique two lid structures.2012

    • Author(s)
      Cheng, M., Angkawidjaja, C., Koga, Y., and Kanaya, S.
    • Journal Title

      FEBS Journal

      Volume: 279 Pages: 3727-3737

    • DOI

      10.1111/j.1742-4658.2012.08734.x.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Requirement of insertion sequence IS1 for thermal adaptation of Pro-Tk-subtilisin from hyper thermophilic archaeon.2012

    • Author(s)
      Uehara, R., Tanaka, S., Takano, K., Koga, Y., and Kanaya, S.
    • Journal Title

      Extremophiles

      Volume: 16 Pages: 841-851

    • DOI

      DOI:10.1007/s00792-012-0479-3.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A dual role of divalent metal ions in catalysis and folding of RNase H1 from extreme halophilic archaeon Halobacterium sp. NRC-1.2012

    • Author(s)
      Tannous, E., Yokoyama, K., You, D-J., Koga, Y., and Kanaya, S.
    • Journal Title

      FEBS Open Bio

      Volume: 2 Pages: 345-352

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Slow unfolding pathway of the hyper thermophilic Tk-RNase H2 examined by pulse proteolysis using the stable protease Tk-subtilisin.2012

    • Author(s)
      Okada, J., Koga, Y., Takano, K., and Kanaya, S.
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 51 Pages: 9178-9191

    • DOI

      10.1021/bi300973n

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 超好熱菌由来プロテアーゼTk-subtilisinのCa2+依存性耐熱化機構2012

    • Author(s)
      上原 了、竹内勇希、田中俊一、高野和文、古賀雄一、金谷茂則
    • Organizer
      第64回日本生物工学会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場、神戸
    • Year and Date
      20121023-20121026
  • [Presentation] プロペプチドの改変によるTk-subtilisinの成熟化速度の促進2012

    • Author(s)
      勇崎孝太、上原 了、三田雄大、古賀雄一、金谷茂則
    • Organizer
      第64回日本生物工学会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場、神戸
    • Year and Date
      20121023-20121026
  • [Presentation] Isolation of LC-cutinase with PET-Degrading Activity from Leaf-branch Compost using a Metagenomic Approach2012

    • Author(s)
      Sintawee SVLAIMAN, Saya YAMATO, Dong-Ju YOU, Eiko KANAYA, Yuichi KOGA, and Shigenori KANAYA
    • Organizer
      第64回日本生物工学会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場、神戸
    • Year and Date
      20121023-20121026
  • [Presentation] Proteolysis of PrPSc with a thermostable protease and the analysis of its infectivity2012

    • Author(s)
      Yuichi Koga, Shunichi Tanaka, Akikazu Sakudo, Azumi Hirata, Kazufumi Takano, Kazuyoshi Ikuta, Shigenori Kanaya
    • Organizer
      Asian Pacific Prion Symposium (APPS) 2012
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、横浜
    • Year and Date
      20120729-20120730
  • [Presentation] Tk-subtilisinによる異常型プリオンタンパク質分解効果の生物学的検討2012

    • Author(s)
      平田あずみ、古賀雄一、田中俊一、作道章一、生田和良、金谷茂則、高野和文
    • Organizer
      第23回日本生体防御学会総会
    • Place of Presentation
      品川区総合区民会館、東京
    • Year and Date
      20120709-20120711
  • [Presentation] Degradation of abnormal prion protein by a hyper-stable protease2012

    • Author(s)
      Yuki Hori, Azumi Hirata, Yuichi Koga, Akikazu Sakudo, Kazuyoshi Ikuta, Shigenori Kanaya, and Kazufumi Takano
    • Organizer
      Prion 2012
    • Place of Presentation
      アムステルダム、オランダ
    • Year and Date
      20120509-20120512

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Published: 2014-07-16   Modified: 2019-06-06  

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