2014 Fiscal Year Annual Research Report
高密度遺伝子解析と先端生殖技術を利用した優良遺伝子構成既知子牛の効率的生産
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24380151
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| Research Institution | Utsunomiya University |
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Principal Investigator |
吉澤 緑 宇都宮大学, 農学部, 教授 (60114162)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
福井 えみ子 宇都宮大学, 農学部, 准教授 (20208341)
松本 浩道 宇都宮大学, 農学部, 准教授 (70241552)
長尾 慶和 宇都宮大学, 農学部, 教授 (70291953)
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| Project Period (FY) |
2012-04-01 – 2015-03-31
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| Keywords | ウシ / 遺伝子多型 / ゲノムコピー数多型 / 一塩基多型 / 経済形質 / ゲノム / 繁殖性 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
栃木県畜産酪農研究センターのホルスタイン種雌牛個体の全ゲノムの一塩基多型(SNP)解析およびコピー数多型(CNV)解析を用いて欠損や重複を網羅的に調査した。その結果と乳量や乳脂率との比較解析が可能か否かを検討した。90頭の血液から抽出したDNAの全ゲノムSNPおよびCNV解析は、Illumina社のBovineLD Genotype BeadChip (v1.1)またはBovineSNP50K(v2)で行い、GenomeStudio v2011.1 を用いて処理した。またSNP解析結果と乳量および乳脂率データを用いて、解析ソフトウエアSNP & Variation Suite 2015 (Golden Helix社)によりGenotype Association TestおよびHaplotype Trend Regressionを行い、SNPと乳量、乳脂率の相関のある染色体の位置を絞り込み、NCBIのBov Mapから当該染色体に位置する遺伝子の同定を試みた。CNV解析では、３個体で多型が、そのうち2個体では、第5番染色体のテロメア末端側の欠損（約332000塩基）、第12番染色体のテロメア末端側の欠損（約1444000塩基）が各々認められ、1個体では第12番染色体の欠損があったが、遺伝子部位を同定できなかった。53頭のSNP情報と乳量および乳脂率データを比較解析したところ、平均乳量（305日）は約10,400kg、平均乳脂率は約4%で家畜改良増殖目標値と比較して高い値を示した。SNP結果の照合で、乳量では第１番染色体にピークが認められたが、ここに位置する遺伝子は、DPPA3-4,Sox, ASIP,MC1R等であり、乳脂率では第21番染色体にピークが認められたが、ここに位置する遺伝子はTM6SF1、FAM等であり、乳量および乳脂率に直接関連のある遺伝子を同定できなかった。
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| Research Progress Status |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Causes of Carryover |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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