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2013 Fiscal Year Annual Research Report

脂質超分子構造の形成メカニズム

Research Project

Project/Area Number 24390045
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

藤本 豊士  名古屋大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (50115929)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 大崎 雄樹  名古屋大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (00378027)
鈴木 倫毅  名古屋大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (80456649)
Project Period (FY) 2012-04-01 – 2015-03-31
Keywordsオートファジー / ホスファチジルイノシトール3燐酸 / 電子顕微鏡 / オートファゴソーム / 急速凍結・凍結割断レプリカ標識法
Research Abstract

オートファゴソームの形成に必須であることが知られている膜脂質ホスファチジルイノシトール3燐酸(PI3P)の局在について、急速凍結・凍結割断レプリカ標識法を用いて解析した。オートファジーを誘導した酵母、哺乳類細胞を急速凍結し、凍結割断レプリカを作製し、p40phoxのPXドメインをプローブとして標識して電子顕微鏡観察した。標識特異性については異なるホスフォイノシチドを含むリポソームを同様に処理、標識して確認した。解析の結果、酵母のオートファゴソームおよびオートファジー小体では、PI3Pが膜の細胞質側よりも閉鎖空間側(2枚のオートファゴソーム膜の間にある閉鎖空間に面した側)により多く存在するのに対し、哺乳類細胞ではオートファゴソーム膜の細胞質側に限局して存在し、酵母と対照的な分布を示すことが明らかになった。酵母オートファゴソームのPI3Pの非対称性分布は、細胞質に存在する2つのPI3P脱燐酸化酵素を欠損させた変異株(slj3Δymr1Δ)では消失した。この結果から、酵母オートファゴソームではもともと対称性に存在するPI3Pのうち、細胞質側のPI3Pが分解されることによって非対称性分布が完成すると推測された。閉鎖空間側にPI3Pが生じる機構に関しては、フリッパーゼによる輸送、膜新生過程での内在化などが関与する可能性がある。今回の研究結果は酵母と哺乳類細胞のオートファジー膜形成の過程に大きな違いがあることを示唆している。オートファジー膜形成機構を解明するためには閉鎖空間側にPI3Pが生じるメカニズムを解析することが重要な鍵になると考えられる。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

膜脂質の局在を独自に開発した新たな電子顕微鏡の方法で解析し、オートファジー膜について新しい知見を得ることができたため。

Strategy for Future Research Activity

本年度の研究ではホスファチジルイノシトール3燐酸が閉鎖空間側(内腔側)に出現することが明らかになったが、その分子メカニズムは不明である。この機構を追究することは、オートファジー膜形成の根本的なメカニズムの解明につながることが期待できるので今後の研究ではこの点に焦点をあてて解析を進める予定である。

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

年度末に購入し、本研究費で支払いを行う予定であった試薬の納入が遅れ、新年度にずれ込んだため。
すでに試薬は発注済みであり、納品後ただちに研究に使用する予定である。

  • Research Products

    (12 results)

All 2014 2013

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 5 results)

  • [Journal Article] Integrated omics study delineates the dynamics of lipid droplets in the Rhodococcus opacus PD630.2014

    • Author(s)
      Chen Y, Ding Y, Yang L, Yu J, Liu G, Wang X, Zhang S, Yu D, Song L, Zhang H, Zhang C, Huo L, Huo C, Wang Y, Du Y, Zhang H, Zhang P, Na H, Xu S, Zhu Y, Xie Z, He T, Zhang Y, Wang G, Fan Z, Yang F, Liu H, Wang X, Zhang X, Zhang MQ, Li Y, Steinbüchel A, Fujimoto T, Cichello S, Yu J, Liu P.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res

      Volume: 42 Pages: 1052-1064

    • DOI

      10.1093/nar/gkt932

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Yeast and mammalian autophagosomes exhibit distinct phosphatidylinositol 3-phosphate asymmetries.2014

    • Author(s)
      Cheng J, Fujita A, Yamamoto H, Tatematsu T, Kakuta S, Obara K, Ohsumi Y, Fujimoto T.
    • Journal Title

      Nat Commun

      Volume: 5 Pages: 3207

    • DOI

      10.1038/ncomms4207

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Open questions in lipid droplet biology2014

    • Author(s)
      Ohsaki Y, Suzuki M, Fujimoto T.
    • Journal Title

      Chem Biol

      Volume: 21 Pages: 86-96

    • DOI

      10.1016/j.chembiol.2013.08.009

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Microscopic methods to observe the distribution of lipids in the cellular membrane2014

    • Author(s)
      Takatori S, Mesman, R, Fujimoto T.
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 53 Pages: 639-653

    • DOI

      10.1021/bi401598v

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Protein kinase Ceta is targeted to lipid droplets.2013

    • Author(s)
      Suzuki M, Iio Y, Saito N, Fujimoto T.
    • Journal Title

      Histochem Cell Biol

      Volume: 139 Pages: 505-511

    • DOI

      10.1007/s00418-013-1083-z

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Inhibition of ADP-ribosylation suppresses aberrant accumulation of lipidated apolipoprotein B in the endoplasmic reticulum.2013

    • Author(s)
      Ohsaki Y, Cheng J, Yamairi K, Pan X, Hussain MM, Fujimoto T.
    • Journal Title

      FEBS Lett

      Volume: 587 Pages: 3696-3702

    • DOI

      10.1016/j.febslet.2013.09.036

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Inhibition of NPC1L1 by ezetimibe activates autophagy in human hepatocyte and reduces mutant α1-antitrypsin Z deposition.2013

    • Author(s)
      Yamamura T, Ohsaki Y, Suzuki M, Shinohara Y, Tatematsu T, Cheng J, Okada M, Ohmiya N, Hirooka Y, Goto H, Fujimoto T.
    • Journal Title

      Hepatology

      Volume: 59 Pages: 1591-1559

    • DOI

      10.1002/hep.26930

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 脂肪滴の新たな機能と動態2013

    • Author(s)
      藤本豊士
    • Organizer
      細胞内ロジスティクス・シンポジウム
    • Place of Presentation
      淡路夢舞台国際会議場(淡路市)
    • Year and Date
      20130917-20130918
    • Invited
  • [Presentation] 細胞質と核における脂肪滴の生理的意義2013

    • Author(s)
      大﨑雄樹、藤本豊士
    • Organizer
      第86回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      20130911-20130913
    • Invited
  • [Presentation] Analysis of Membrane Lipids by Electron Microscopy2013

    • Author(s)
      Toyoshi Fujimoto
    • Organizer
      XXIII International Symposium on Morphological Sciences
    • Place of Presentation
      朱鷺メッセ新潟コンベンションセンター(新潟市)
    • Year and Date
      20130910-20130913
    • Invited
  • [Presentation] Nanoscale distribution of membrane lipids observed by electron microscopy2013

    • Author(s)
      Toyoshi Fujimoto
    • Organizer
      47th Symposium of The Polish Society for Histochemistry and Cytochemistry
    • Place of Presentation
      Olsztyn, Poland
    • Year and Date
      20130904-20130906
    • Invited
  • [Presentation] 膜脂質の微細局在を見るための方法について2013

    • Author(s)
      藤本豊士
    • Organizer
      第8回スフィンゴテラピィ研究会
    • Place of Presentation
      山中温泉河鹿荘ロイヤルホテル(加賀市)
    • Year and Date
      20130712-20130713
    • Invited

URL: 

Published: 2015-05-28  

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