2014 Fiscal Year Annual Research Report
次世代シークエンサーを用いたＧＭ－ＣＳＦ自己抗体産生機序の解明
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24390208
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| Research Institution | Niigata University |
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Principal Investigator |
中田 光 新潟大学, 医歯学総合病院, 教授 (80207802)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
田澤 立之 新潟大学, 医歯学総合病院, 准教授 (70301041)
中垣 和英 日本獣医生命科学大学, 獣医学部, 准教授 (90143635)
井上 義一 独立行政法人国立病院機構(近畿中央胸部疾患センター臨床研究センター), 臨床研究センター, センター長 (90240895)
根井 貴仁 日本医科大学, 医学部, 助教 (30597670)
瀧澤 淳 新潟大学, 医歯学系, 准教授 (70463990)
横崎 恭之 広島大学, 保健管理センター, 准教授 (80210607)
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| Project Period (FY) |
2012-04-01 – 2015-03-31
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| Keywords | 肺胞蛋白症 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
健常者５名、患者５名の末梢血単核球とbiotin化GM-CSFを反応させアビジン磁気ビーズを用いてソートしてきたGM-CSF自己抗体陽性B細胞からmRNA抽出、cDNA作製、IgM, IgG特異的なH鎖可変部の配列をもつPCR産物を得た。それを次世代シークエンサーにかけ、合計12万5千クローンの配列を得た。そのデータを抗体解析ソフト(international ImMunoGeneTics information system)により解析したところ、抗体をコードしているproductiveクローンが7万6千クローンあり、H鎖可変部のV領域、D領域、J領域のアミノ酸残基数、germ line配列からの変異率、アリル使用についてシークエンスをIgM型とIgG型の間、また、患者と健常者の間で比較したところ、患者、健常者ともにIgG型とIgM型のシークエンスには顕著な差がみられた。CDR1,2の変異率はIgGが圧倒的に高く、患者、健常者ともにほぼ等しい割合で、IgG型とIgM型のシークエンスを持っていた。IgG型とIgM型は異なるgermline alleleの組み合わせからなるが、患者毎に特定のCDR1,2,3配列が選択増殖していた。上記に加えて、自己免疫性肺胞蛋白症39名のdemographic data, clinical data, serum parameters (KL-6, CEA, SP-A, SP-D, GM-CSF autoantibody concentrations) を入力したデータベースを作成した。
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| Research Progress Status |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Causes of Carryover |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] Novel aspects on the pathogenesis of Mycoplasma pneumoniae pneumonia and therapeutic implications.2014
Author(s)
Saraya T, Kurai D, Nakagaki K, Sasaki Y, Niwa S, Tsukagoshi H, Nunokawa H, Ohkuma K, Tsujimoto N, Hirao S, Wada H, Ishii H, Nakata K, Kimura H, Kozawa K, Takizawa H, Goto H.
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Journal Title
Front Microbiol
Volume: 5
Pages: 410
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Prenatal molecular diagnosis of X-linked hydrocephalus via a silent C924T mutation in the L1CAM gene.2014
Author(s)
Serikawa T, Nishiyama K, Tohyama J, Tazawa R, Goto K, Kuriyama Y, Haino K, Kanemura Y, Yamasaki M, Nakata K, Takakuwa K, Enomoto T.
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Journal Title
Congenit Anom (Kyoto)
Volume: 54(4)
Pages: 243-5
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Secondary pulmonary alveolar proteinosis complicating myelodysplastic syndrome results in worsening of prognosis: a retrospective cohort study in Japan.2014
Author(s)
Ishii H, Seymour JF, Tazawa R, Inoue Y, Uchida N, Nishida A, Kogure Y, Saraya T, Tomii K, Takada T, Itoh Y, Hojo M, Ichiwata T, Goto H, Nakata K.
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Journal Title
BMC Pulm Med
Volume: 14
Pages: 37
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Standardized serum GM-CSF autoantibody testing for the routine clinical diagnosis of autoimmune pulmonary alveolar proteinosis.2014
Author(s)
Uchida K, Nakata K, Carey B, Chalk C, Suzuki T, Sakagami T, Koch DE, Stevens C, Inoue Y, Yamada Y, Trapnell BC.
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Journal Title
J Immunol Methods
Volume: 402(1-2)
Pages: 57-70
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Duration of benefit in patients with autoimmune pulmonary alveolar proteinosis after inhaled granulocyte-macrophage colony-stimulating factor therapy.2014
Author(s)
Tazawa R, Inoue Y, Arai T, Takada T, Kasahara Y, Hojo M, Ohkouchi S, Tsuchihashi Y, Yokoba M, Eda R, Nakayama H, Ishii H, Nei T, Morimoto K, Nasuhara Y, Ebina M, Akira M, Ichiwata T, Tatsumi K, Yamaguchi E, Nakata K.
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Journal Title
Chest
Volume: 145(4)
Pages: 729-37
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
