2012 Fiscal Year Annual Research Report
脳悪性リンパ腫の全エクソンシーケンスを応用したゲノム創薬・バイオマーカー研究
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24390347
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Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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| Research Institution | Kyoto Prefectural University of Medicine |
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Principal Investigator |
山中 龍也 京都府立医科大学, 医学部, 教授 (20323991)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
池中 一裕 自然科学研究機構, 生理学研究所, 教授 (00144527)
川口 淳 久留米大学, バイオ統計センター, 講師 (60389319)
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| Project Period (FY) |
2012-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | 脳原発リンパ腫 / ゲノム解析 / バイオマーカー / シーケンス |
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| Research Abstract |
中枢神経系原発悪性リンパ腫(PCNSL)は中枢神経系に原発する節外性非ホジキン型リンパ腫で、多くはB細胞リンパ腫である。High dose Methotrexate (HD-MTX)の化学療法はPCNSLに広く用いられるレジメンである。しかしながら、本治療法の問題点として、
1)5年生存率は約30%と、全身性非ホジキン病と比べ、治療成績は不良である。
2)副作用として晩発性の神経毒性がある。
3)多くは再発し治療抵抗性となり、新たな治療スケジュールの開発が待たれている
以上の、事項を背景として、PCNSLの凍結腫瘍組織50例のゲノム解析から、予後・治療反応性を予測するバイオマーカー、新規の分子標的薬開発のための標的分子の探索を行ってきた。GeneChip U133を用いた遺伝子発現解析、GeneChip miRNA 2.0 Arrayを用いたmicroRNA解析、GeneChip Human Mapping 250K Nsp arrayを用いたSNPアレイ解析を行った。遺伝子発現解析から予後と相関する21個の遺伝子セットが選択された。それらの21個の遺伝子の発現値を用いた予後予測式を考案した。今後さらにバイオマーカーの実用化を目指し、脳リンパ腫の幹細胞、MTX耐性細胞株の樹立を行い、次世代シーケンサーを用いて全エクソンキャプチャーシーケンスも考慮した遺伝子発現情報、microRNA、SNPアレイ解析を用いた体系的な解析から標的分子を同定し、ケミカルバイオロジー・抗体・アプタマー・microRNA創薬の手法を用いた分子標的創薬を進める。中枢神経系原発悪性リンパ腫組織サンプルの収集の困難さから、このような多数症例のゲノム解析に基づく研究を行っている施設は国際的にも見られず、我々の研究の新規制・独自性が期待できる。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
PCNSL50症例の凍結腫瘍組織からのDNA,RNA、および臨床情報の収集はほぼ予定どうり進んでいる。次世代型シーケンサーを用いた遺伝子解析を進める予定であったが、まだ、器機の調整中であり、実際の解析は開始できていない。
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| Strategy for Future Research Activity |
次世代シーケンサーによる解析を進行させ、分子標的の探索を進める。
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| Expenditure Plans for the Next FY Research Funding |
次世代シーケンサーによる解析を中心に使用する。
なお、本年度に購入予定の次世代型シーケンス解析用試薬を翌年度に購入することとなったため、助成金に残額が生じた。
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Research Products
(7 results)
