• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2013 Fiscal Year Research-status Report

周囲の場の中の分子の状態の研究

Research Project

Project/Area Number 24540443
Research InstitutionTokyo University of Pharmacy and Life Science

Principal Investigator

横島 智  東京薬科大学, 薬学部, 准教授 (00532863)

Keywordsアミロイドβ / 分子動力学法 / フラグメント分子軌道法 / 光合成 / 励起状態
Research Abstract

フラグメント分子軌道法(FMO法)を非制限ハートリーフォック法(UHF法)や非制限密度汎関数法(UDFT法)が扱えるように修正し、その基底状態、励起エネルギー、振動解析を可能にした。これらの手法開発は、ポリマー中の分子の問題や、光合成における光化学系IIの酸素発生中心の問題の解析の際に活用できるものである。
アミロイドβについては、モノマーの局所安定構造の候補構造を増やして計算をおこない、局所的な折りたたみを形成するものから、大域的な折りたたみになるものまで様々な場合が出てくることを見出した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

アミロイドβについては、昨年度に引き続き多様な初期構造が作成可能であることから、その多様性にどう対処するかという困難に直面している。
FMO法の計算手法開発が進展していることから、ポリマー中のジアリールエテンや光化学系IIの酸素発生中心の方は順調に進展している。

Strategy for Future Research Activity

アミロイドβについては候補構造をしぼることで少なくともダイマーの話まで進みたい。
酸素発生中心とポリマー中のジアリールエテンについては環境中の励起状態ダイナミクスへと進めたい。

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

予想よりも旅費が安くすんだ。また、論文代金が安く上がった。
最終年度であることから積極的に学会発表と論文の代金に使われる予定である。

  • Research Products

    (6 results)

All 2014 2013

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Octahedral point-charge model and its application to fragment molecular orbital calculations of chemical shifts2014

    • Author(s)
      Qi Gao, Satoshi Yokojima, Dmitri G. Fedorov, Kazuo Kitaura, Minoru Sakurai, Shinichiro Nakamura
    • Journal Title

      Chemical Physics Letters

      Volume: 593 Pages: 165-173

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2014.01.001

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Unrestricted density functional theory based on the fragment molecular orbital method for the ground and excited state calculations of large systems2014

    • Author(s)
      Hiroya Nakata, Dmitri G. Fedorov, Satoshi Yokojima, Kazuo Kitaura, Minoru Sakurai, Shinichiro Nakamura
    • Journal Title

      THE JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS

      Volume: 140 Pages: 144101 1-11

    • DOI

      10.1063/1.4870261

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Efficient vibrational analysis for unrestricted Hartree-Fock based on the fragment molecular orbital method2014

    • Author(s)
      Hiroya Nakata, Dmitri G. Fedorov, Satoshi Yokojima, Kazuo Kitaura, Shinichiro Nakamura
    • Journal Title

      Chemical Physics Letters

      Volume: 603 Pages: 67-74

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2014.04.028

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] アミロイドβの構造探索III2014

    • Author(s)
      横島 智
    • Organizer
      日本物理学会第69回年次大会
    • Place of Presentation
      東海大学 湘南キャンパス
    • Year and Date
      20140329-20140329
  • [Presentation] アミロイドβの構造探索2013

    • Author(s)
      横島 智
    • Organizer
      第51回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      国立京都国際会館
    • Year and Date
      20131029-20131029
  • [Presentation] アミロイドβの構造探索II2013

    • Author(s)
      横島 智
    • Organizer
      日本物理学会2013年秋季大会
    • Place of Presentation
      徳島大学常三島キャンパス
    • Year and Date
      20130928-20130928

URL: 

Published: 2015-05-28  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi