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2013 Fiscal Year Research-status Report

緑色細菌のグリセロ脂質ライブラリー:脂質の微細構造から見た光合成調節機構の解明

Research Project

Project/Area Number 24550065
Research InstitutionRitsumeikan University

Principal Investigator

溝口 正  立命館大学, 総合科学技術研究機構, 教授 (90343665)

Keywords脂質 / 光合成 / 生体分子 / 精密計測
Research Abstract

緑色光合成細菌をモデル生物とした糖脂質の網羅的な構造・組成解析を、蒸発光散乱型検出器(ELSD)をオンライン接続したLCMSを用いて行った。糖脂質分子を構成する二つのパーツ(糖構造と脂肪酸部の微細な構造)に焦点を絞り、その構造や組成比への生育環境因子の及ぼす影響を検証した。緑色光合成細菌の生育環境因子として、温度と光の質(=波長)に着目した。温度因子として、約30~60℃を至適温度する緑色光合成細菌の糖脂質を網羅的に解析した。その結果、至適温度の上昇にともない、糖構造の改変(単糖から二糖へ)、脂肪酸の不飽和構造の改変(シクロプロパン環化を経由した飽和型構造へ)を確認した。光因子として、赤、青、緑の三種類のLED光源を用いた「光の質」という観点より、糖脂質構造・組成への影響を検証した。より光の精度を高めるために、キセノン光源と各種バンドパスフィルターを用いた質の改善にも着手した(半値幅10 nmの輝線)。効率的なグリセロ脂質の解析を行うためにELSD検出器の増設を行い、微量サンプルへの対応策として、HPLCの超高速化にも着手した。緑色光合成細菌の糖脂質の人為的な構造改変として、構造特異的な阻害剤の利用と、触媒遺伝子群の探索とその変異株の作成も併せて行った。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本研究では、以下の2点を主たる研究目的として設定した。
目的1:緑色光合成細菌をモデル生物としたグリセロ脂質ライブラリーの構築。
至適生育温度の異なる緑色光合成細菌に対して、網羅的に合成される糖脂質の構造・組成解析を行った。細菌の生育温度と糖脂質の構造に明確な相関性が確認でき、生物における耐熱性獲得に関する知見を得た。得られた成果は、以下の論文として公表した:T. Mizoguchi et al., Photosynth. Res. 114 (2013) 179-188。
目的2:見えない脂質分子の微細な構造が誘起する生体膜特性の影響を、見えるクロロフィル色素をプローブとして評価するシステムの構築。緑色光合成細菌の光収穫用アンテナ器官であるクロロゾーム(=糖脂質の一分子膜より成るミセル様構造体)を単離し、内包されるクロロフィル色素をプローブとして用いることで、酸処理による糖脂質分子膜へのプロトン透過性を評価することに成功した。得られた成果は、以下の論文として公表した:T. Mizoguchi et al., Bioorg. Med. Chem. 21 (2013) 3689-3694。
本研究で構築した緑色光合成細菌の糖脂質解析システム(ELSD-ESI-LCMS)に対して、複数の共同研究の申し込みがあった。これらの共同研究を積極的に推進することで、本研究課題の更なる発展が期待される。

Strategy for Future Research Activity

未着手な課題として、以下の2点があげられる。
課題1:光合成膜と光収穫用アンテナ器官(クロロゾーム)のグリセロ脂質の組成比較によるクロロゾームの分化・形成メカニズムに関する知見の獲得。
課題2:糖脂質に加えて、リン脂質やトリアシルグリセロールを対象とした解析システムの構築。
これらの課題の達成に超高速HPLCが威力を発揮するものと考える。加えて、次の点を継続して実施し一定の成果を得たい。緑色光合成細菌の生育環境因子としての光の質と蓄積される糖脂質の構造・組成解析。微量サンプルへの対応として超高速HPLCを用いたグリセロ脂質解析システムの高感度化。緑色光合成細菌の糖脂質合成遺伝子群の探索とその変異株の作成。本研究で構築・進化させたグリセロ脂質解析システムを駆使して、種々の共同研究を積極的に推進して行きたい。

  • Research Products

    (42 results)

All 2014 2013 Other

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 9 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (32 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Isolation and structural determination of C8-vinyl-bacteriochlorophyll d from the bciA and bchU double mutant of the green sulfur bacterium Chlorobaculum tepidum2014

    • Author(s)
      Jiro Harada, Tadashi Mizoguchi, Kota Nomura and Hitoshi Tamiaki
    • Journal Title

      Photosynth. Res.

      Volume: 121 Pages: 13-23

    • DOI

      10.1007/s11120-014-0007-7

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Biosynthesis of bacteriochlorophyll c derivatives possessing chlorine and bromine atoms at the terminus of esterifying chains in the green sulfur photosynthetic bacterium Chlorobaculum tepidum2014

    • Author(s)
      Yoshitaka Saga, Keisuke Hayashi, Tadashi Mizoguchi and Hitoshi Tamiaki
    • Journal Title

      J. Biosci. Bioeng.

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1016/j.biosc.2013.12.023

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Isolation and characterization of new bacteriochlorophyll-c bearing a neopentyl substituent at the C8-position from the bciD-deletion mutant of the brown-colored green sulfur bacterium Chlorobaculum limnaeum2014

    • Author(s)
      Tadashi Mizoguchi, Jiro Harada and Hitoshi Tamiaki
    • Journal Title

      Photosynth. Res.

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1007/s11120-014-9977-8

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Chlorophyllide a oxidoreductase works as one of divinyl reductase specifically in bacteriochlorophyll a biosynthesis2014

    • Author(s)
      Jiro Harada, Tadashi Mizoguchi, Yusuke Tsukatani, Ayumi Tanaka and Hitoshi Tamiaki
    • Journal Title

      J. Biol. Chem.

      Volume: 289 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1074/jbc.M113.546739

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 反応中心色素の構造解析:HPLCを用いた精密計測2014

    • Author(s)
      溝口 正、民秋 均
    • Journal Title

      光合成研究最前線

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

  • [Journal Article] Reconstruction of rod self-aggregates of natural bacteriochlorophylls-c from Chloroflexus aurantiacus2013

    • Author(s)
      Sunao Shoji, Tadashi Mizoguchi and Hitoshi Tamiaki
    • Journal Title

      Chem. Phys. Lett.

      Volume: 578 Pages: 102-105

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2013.06.012

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Complete biosynthetic pathways for bacteriochlorophyll g in Heliobacterium modesticaldum: The C8-ethylidene group formation2013

    • Author(s)
      Yusuke Tsukatani, Haruki Yamamoto, Tadashi Mizoguchi,Yuichi Fujita and Hitoshi Tamiaki
    • Journal Title

      Biochim. Biophys. Acta

      Volume: 1827 Pages: 1200-1204

    • DOI

      10.1016/j.bbabio.2013.06.007

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 132,173-Cyclopheophorbide b enol as a catabolite of chlorophyll b in phycophagy by protists2013

    • Author(s)
      Yuichiro Kashiyama, Akiko Yokoyama, Takashi Shiratori, Isao Inouye, Yusuke Kinoshita, Tadashi Mizoguchi and Hitoshi Tamiaki
    • Journal Title

      FEBS Lett.

      Volume: 587 Pages: 2578-2583

    • DOI

      10.1016/j.febslet.2013.06.036

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Ene-thiol reaction on chlorophyll derivatives: effects of substrates, oxygen, and acid on oxidation and addition2013

    • Author(s)
      Takanori Fukusumi, Natsuki Takei, Yubi Tateno, Tadashi Mizoguchi, Satoshi Ito, Tsukasa Ikeda, Hitoshi Tamiaki, Toru Oba
    • Journal Title

      J. Porphyrins Phthalocyanines

      Volume: 17 Pages: 1188-1195

    • DOI

      10.1142/S1088424613500983

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Bacteriochlorophyll homolog compositions in the bchU mutants of green sulfur bacteria2013

    • Author(s)
      Yusuke Tsukatani, Jiro Harada, Tadashi Mizoguchi and Hitoshi Tamiaki
    • Journal Title

      Photochem. Photobiol. Sci.

      Volume: 12 Pages: 2195-2201

    • DOI

      10.1039/c3pp50253h

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 海洋性光合成色素クロロフィルcのpH-光センサー機能

    • Author(s)
      藤井律子、千住直輝、溝口正、伊波匡彦、市村彰男、橋本秀樹
    • Organizer
      第3回ポルフィリン-ALA学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学(東京都)
  • [Presentation] 緑色硫黄細菌の光捕集体クロロソームの脂質分析:阻害剤添加および変異体による解析

    • Author(s)
      塚谷祐介、溝口正、原田二朗、民秋均
    • Organizer
      第4回光合成学会シンポジウム
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県)
  • [Presentation] 色素合成酵素遺伝子bciDはバクテリオクロロフィル eのC7位のホルミル化に関与する

    • Author(s)
      原田二朗、溝口 正、佐藤壮一郎、塚谷祐介、横野牧生、野口正人、田中 歩、民秋 均
    • Organizer
      第4回光合成学会シンポジウム
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県)
  • [Presentation] 天然産バクテリオクロロフィルcによる針状自己集積体の構築

    • Author(s)
      民秋 均、庄司 淳、溝口 正
    • Organizer
      新学術領域「人工光合成」第2回合同班会議
    • Place of Presentation
      淡路島(兵庫県)
  • [Presentation] Biosynthesis of unnatural bacteriochlorophyll c esterified with linear alcohols possessing halogen in the green sulfur photosynthetic bacterium Chlorobaculum tepidum

    • Author(s)
      Yoshitaka Saga, Keisuke Hayashi, Tadashi Mizoguchi and Hitoshi Tamiaki
    • Organizer
      SNCPP13
    • Place of Presentation
      立命館大学(滋賀県)
  • [Presentation] Bacteriochlorophyll homolog composition analyses in mutants of green sulfur bacteria

    • Author(s)
      Yusuke Tsukatani, Jiro Harada, Tadashi Mizoguchi and Hitoshi Tamiaki
    • Organizer
      SNCPP13
    • Place of Presentation
      立命館大学(滋賀県)
  • [Presentation] A variety of composite bacteriochlorophyll pigments in purple photosynthetic bacteria

    • Author(s)
      Tadashi Mizoguchi, Megumi Isaji, Jiro Harada, Yusuke Tsukatani and Hitoshi Tamiaki
    • Organizer
      SNCPP13
    • Place of Presentation
      立命館大学(滋賀県)
  • [Presentation] Tubular supramolecules of natural bacteriochlorophylls-c and their synthetic analogs

    • Author(s)
      Sunao Shoji, Tadashi Mizoguchi, Hitoshi Tamiaki
    • Organizer
      SNCPP13
    • Place of Presentation
      立命館大学(滋賀県)
  • [Presentation] A chlorophyll catabolism by heterotrophic/phototrophic protists

    • Author(s)
      Yuichiro Kashiyama, Akiko Yokoyama, Yusuke Kinoshita, Takashi Shiratori, Tadashi Mizoguchi, Hitoshi Tamiaki
    • Organizer
      SNCPP13
    • Place of Presentation
      立命館大学(滋賀県)
    • Invited
  • [Presentation] 同一生体から精製したバクテリオクロロフィルc,eおよびfをそれぞれもつクロロソームの比較

    • Author(s)
      原田二朗、溝口 正、柴田 穣、塚谷祐介、野口正人、民秋 均
    • Organizer
      第21回 光合成セミナー(光合成の色素系と反応中心に関するセミナー)
    • Place of Presentation
      名古屋工業大学(愛知県)
  • [Presentation] 天然バクテリオクロロフィル-cとそのモデル分子によるチューブ状自己会合体の構築

    • Author(s)
      庄司 淳、溝口 正、民秋 均
    • Organizer
      第21回 光合成セミナー(光合成の色素系と反応中心に関するセミナー)
    • Place of Presentation
      名古屋工業大学(愛知県)
  • [Presentation] Chlorophyllide a oxidoreductase branches biosynthetic pathways for bacteriochlorophylls a and b

    • Author(s)
      Yusuke Tsukatani, Haruki Yamamoto, Jiro Harada, Jiro Nomata, Tadashi Mizoguchi, Yuichi Fujita and Hitoshi Tamiaki
    • Organizer
      Light Harvesting Meeting 2013
    • Place of Presentation
      St. Louis, USA
  • [Presentation] Chlorosomes containing bacteriochlorophyll c, e, or f in the brown-colored green sulfur bacterium Chlorobaculum limnaeum

    • Author(s)
      Jiro Harada, Tadashi Mizoguchi, Yusuke Tsukatani, Masato Noguchi and Hitoshi Tamiaki
    • Organizer
      Light Harvesting Meeting 2013
    • Place of Presentation
      St. Louis, USA
  • [Presentation] In vivo substitution at the terminus of the esterifying chain of bacteriochlorophyll c in the green sulfur photosynthetic bacterium Chlorobaculum tepidum

    • Author(s)
      Yoshitaka Saga, Keisuke Hayashi, Tadashi Mizoguchi and Hitoshi Tamiaki
    • Organizer
      Light Harvesting Meeting 2013
    • Place of Presentation
      St. Louis, USA
  • [Presentation] Inactivation of BchX, a subunit of chlorophyllide a oxidoreductase, in the green sulfur bacterium Chlorobaculum tepidum

    • Author(s)
      Chihiro Azai, Tadashi Mizoguchi and Hirozo Oh-oka
    • Organizer
      Light Harvesting Meeting 2013
    • Place of Presentation
      St. Louis, USA
  • [Presentation] Bacteriochlorophyll e biosynthetic pathway of the brown-colored green sulfur bacterium Chlorobaculum limnaeum

    • Author(s)
      Jiro Harada, Tadashi Mizoguchi, Yusuke Tsukatani, Souichiro Sato, Makio Yokono, Ayumi Tanaka, Masato Noguchi and Hitoshi Tamiaki
    • Organizer
      PS2013
    • Place of Presentation
      St. Louis, USA
  • [Presentation] Chlorophylls-c and protochlorophyllide-a in photosynthetic organisms are enantiomerically pure chlorophylls possessing a carboxylated porphyrin π-system

    • Author(s)
      Tadashi Mizoguchi and Hitoshi Tamiaki
    • Organizer
      PS2013
    • Place of Presentation
      St. Louis, USA
  • [Presentation] Lipid analyses in envelope protein mutants of chlorosomes of Chlorobaculum tepidum

    • Author(s)
      Yusuke Tsukatani, Tadashi Mizoguchi, Jennifer Thweatt, Marcus Tank, Donald A. Bryant and Hitoshi Tamiaki
    • Organizer
      PS2013
    • Place of Presentation
      St. Louis, USA
  • [Presentation] 光合成細菌の色素生合成を利用した光捕集バクテリオクロロフィルのエステル鎖改変

    • Author(s)
      佐賀佳央、林 圭介、廣田圭耶、川村権史、溝口 正、民秋 均
    • Organizer
      第7回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県)
  • [Presentation] Plasticity of chlorophyllide a oxidoreductase, a versatile nitrogenase-like enzyme

    • Author(s)
      Yusuke Tsukatani, Haruki Yamamoto, Jiro Harada, Jiro Nomata, Tadashi Mizoguchi, Yuichi Fujita and Hitoshi Tamiaki
    • Organizer
      第18回国際窒素固定会議
    • Place of Presentation
      フェニックス・シーガイア・リゾート(宮崎県)
  • [Presentation] 緑色硫黄光合成細菌の巨大アンテナ系で働く色素のC31位を水酸化する2つの酵素は、その立体化学に大きく関与する。

    • Author(s)
      原田二朗、寺村美里、溝口 正、塚谷祐介、民秋 均
    • Organizer
      第16回生命化学研究会
    • Place of Presentation
      熱海KKRホテル熱海(静岡県)
  • [Presentation] Regioselective reduction pathway of geranylgeranyl moiety in chlorophyll biosynthesis

    • Author(s)
      Kota Nomura, Tadashi Mizoguchi and Hitoshi Tamiaki
    • Organizer
      58th Annual Meeting of Biophysical Society
    • Place of Presentation
      San Francisco, USA
  • [Presentation] 超高感度クロロフィル分析システムの構築:単一細胞内クロロフィルの検出を目指して

    • Author(s)
      溝口 正
    • Organizer
      私立大学戦略的研究基盤形成支援事業第2回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      立命館大学(滋賀県)
  • [Presentation] 緑色硫黄細菌のバクテリオクロロフィルc生合成における酵素遺伝子bchFとbchVの関与したC3位の立体選択的水和反応

    • Author(s)
      溝口 正、寺村美里、原田二朗、塚谷祐介、民秋 均
    • Organizer
      第55回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      富山大学(富山県)
  • [Presentation] Chlorophyllide(Chlide) a還元酵素で新たに見出されたC8位ビニル還元活性の進化的意義

    • Author(s)
      原田二朗、溝口 正、塚谷祐介、横野牧生、田中 歩、民秋 均
    • Organizer
      第55回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      富山大学(富山県)
  • [Presentation] 緑色硫黄細菌Chlorobaculum tepidumにおいてbchX遺伝子はバクテリオクロロフィルa生合成に必須ではない

    • Author(s)
      浅井 智広、溝口 正、民秋 均、大岡 宏造
    • Organizer
      第55回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      富山大学(富山県)
  • [Presentation] クロロフィリドa還元酵素の導入による近赤外光吸収型色素の遺伝子工学的生産

    • Author(s)
      塚谷祐介、原田二朗、野亦次郎、溝口 正、藤田祐一、民秋 均
    • Organizer
      第55回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      富山大学(富山県)
  • [Presentation] クロロフィル色素合成における3-ビニルヒドロラターゼのin vitroでの反応

    • Author(s)
      民秋 均、寺村美里、溝口 正、塚谷祐介、原田二朗
    • Organizer
      日本化学会第94春季年会
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県)
  • [Presentation] 天然クロロフィルが有するイソプレノイドエステル鎖の生合成中間体の構造決定

    • Author(s)
      民秋 均、野村康大、溝口 正
    • Organizer
      日本化学会第94春季年会
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県)
  • [Presentation] Chlorophyllide a oxidoreductase catalyzes the formation of an ethylidene group of bacteriochlorophyll b

    • Author(s)
      Yusuke Tsukatani, Haruki Yamamoto, Jiro Harada, Jiro Nomata, Tadashi Mizoguchi, Yuichi Fujita and Hitoshi Tamiaki
    • Organizer
      International Conference on Porphyrins and Phthalocyanines (ICPP8)
    • Place of Presentation
      Istanbul, Republic of Turkey
  • [Presentation] 3番目のタイプのC8位ビニル還元酵素(DVR)として同定されたクロロフィリド a酸化還元酵素(COR)の研究から考察されるクロロフィル合成の進化

    • Author(s)
      原田二朗、溝口 正、塚谷祐介、横野牧生、田中 歩、民秋 均
    • Organizer
      日本光合成学会年会
    • Place of Presentation
      近畿大学(奈良県)
  • [Presentation] 紅色光合成細菌による「クロロフィル合成」

    • Author(s)
      塚谷祐介、原田二朗、溝口 正、民秋 均、増田真二
    • Organizer
      日本光合成学会年会
    • Place of Presentation
      近畿大学(奈良県)

URL: 

Published: 2015-05-28  

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