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2013 Fiscal Year Research-status Report

microRNAのターゲット捕捉機構を狙い撃つ新規核酸素子の開発

Research Project

Project/Area Number 24550186
Research InstitutionKyoto Institute of Technology

Principal Investigator

山吉 麻子  京都工芸繊維大学, 工芸科学研究科, 助教 (70380532)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 村上 章  京都工芸繊維大学, 工芸科学研究科, 教授 (60210001)
KeywordsmicroRNA / アンチセンス核酸 / ペプチド / RISC
Research Abstract

microRNAの発現異常は様々な疾患の原因となることが知られている。microRNAは、RISC (RNA-induced silencing complex) と呼ばれるリボヌクレオプロテインとなった後、標的遺伝子を捕捉しその発現を制御する。本申請課題では、microRNA の標的鎖捕捉機構を狙い撃つ新規核酸素子の開発を目的とした。
本年度は、RISCからmicroRNAを解離させるペプチドコンジュゲート核酸(RINDA) の分子設計の最適化、microRNA解離能の評価、レポーター遺伝子を用いた迅速アッセイ系によるRISC機能阻害効果の評価を行った。Glu の連続配列 (EEE) を持つRINDA (E3)は、ペプチドを持たないオリゴ核酸(ASO)と比較し、RISCからのmicroRNA解離能ならびに生細胞中におけるRISC機能阻害効果が顕著に向上することが明らかとなった。一方、Lysの連続配列を有するRINDA(K3)-as のRISC機能阻害効果はASOより低下することが確認された。RISCにはmicroRNAの5'末端を保持する塩基性ポケットが存在することが知られているが、そのポケットとRINDAのペプチド配列との相互作用がRISCの機能を阻害する上で重要であると考えられる。今後、ガン細胞亢進性のmicroRNAを標的としたRINDA を種々設計し、その効果を網羅的に評価する予定である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

今年度は開発したRINDA-OligoがRISCからどの程度microRNAを解離することが可能であるかを定量評価する実験系の構築に成功し、RINDAのペプチド配列について概ねの最適化が完了した。また、生細胞中におけるRINDA-Oligo のRISC機能阻害効果についても評価することが出来た。RINDA-Oligoを用いることで、細胞内でのRISC 機能阻害を行えるだけでなく、その後の作用機序解析まで達成出来るものと確信している。よって、当初の研究計画通り、本研究課題の最終的な目的を実行するために十分な研究成果と知見を得られたと考えている。

Strategy for Future Research Activity

(1) ガン細胞亢進性 microRNA に対する RINDA-Oligo の機能評価
前年度、レポーター遺伝子を用いて分子構造の最適化された RINDA-Oligo の標的を、ガン細胞で高発現している microRNA (onco-miR) へ移行し、核酸医薬としての有効性を評価する。標的 onco-miR としては、ガン細胞で高発現していることが報告されているmiR-21およびmiR-10b、miR-133を選択する。対象としてヒト乳ガン細胞、ヒト子宮頸ガン細胞、ヒト白血病細胞を用い、合成したRINDA-Oligo の効果を評価する。コントロール分子と比較して、RINDA-Oligo がどの様な効果を発揮するかを、WST-1アッセイを用いた細胞増殖率評価、Migration Assay を用いた細胞遊走能評価を中心に検討する。可能であれば、担癌マウスを作成し、RINDA-Oligo を導入したガン細胞の造腫瘍性を検討し、in vivoでの有効性まで評価したい。
(2) RINDA-Oligo の分子構造のさらなる最適化
ガン細胞および実験動物を用いて得られた結果を、RINDA-Oligo のデザインに繰り返しフィードバックし、分子構造のさらなる最適化を行う。

  • Research Products

    (24 results)

All 2014 2013

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (20 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Novel photodynamic effect of psoralen-conjugated oligonucleotides for discrimination of methylation of cytosine in DNA2014

    • Author(s)
      Yamayoshi, A.*, Matsuyama, Y., Kushida, M., Kobori, A., Murakami A.
    • Journal Title

      Photochemistry and Photobiology

      Volume: 90 Pages: 716, 722

    • DOI

      doi: 10.1111/php.12232

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Functional regulation of RNA-induced silencing complex by photoreactive oligonucleotides2014

    • Author(s)
      Matsuyama, Y., Yamayoshi, A.*, Kobori, A., Murakami A.
    • Journal Title

      Bioorg Med Chem

      Volume: 22 Pages: 1003, 1007

    • DOI

      doi: 10.1016/j.bmc. 2013.12.044

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Dual-fluorescent RNA probes with extremely large Stokes shifts2013

    • Author(s)
      A. Kobori*, T. Ueda,Y. Sanada, A. Yamayoshi, A. Murakami.
    • Journal Title

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry.

      Volume: 77 Pages: 1117, 1119

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Non-coding RNA(7SK)の機能を模倣する新規核酸素子の創製(III) 7SK mimicによる転写反応のスイッチング2014

    • Author(s)
      岸本 恭介・山吉 麻子・吉本 航大・駒野 淳・小柳 義夫・小堀 哲生・村上 章
    • Organizer
      日本化学会第94春季年会
    • Place of Presentation
      名古屋大学東山キャンパス
    • Year and Date
      20140327-20140330
  • [Presentation] RISC機能の制御を目指した遺伝子制御素子の開発(I) RISCのmicroRNA保持機構の阻害を狙ったペプチドコンジュゲート核酸の開発2014

    • Author(s)
      有吉 純平・山吉 麻子・栄森 奈緒・小堀 哲生・村上 章
    • Organizer
      日本化学会第94春季年会
    • Place of Presentation
      名古屋大学東山キャンパス
    • Year and Date
      20140327-20140330
  • [Presentation] RISC機能の制御を目指した遺伝子制御素子の開発(II) 遺伝子制御素子の化学構造がRISC機能阻害効果に及ぼす影響2014

    • Author(s)
      山吉 麻子・中村 裕未・松山 洋平・小堀 哲生・村上 章
    • Organizer
      日本化学会第94春季年会
    • Place of Presentation
      名古屋大学東山キャンパス
    • Year and Date
      20140327-20140330
  • [Presentation] Development of novel transcriptional suppressors inspired by non-coding RNA,7SK2013

    • Author(s)
      山吉 麻子・岸本 恭介・林 里依・駒野 淳・小柳 義夫・小堀 哲生・村上 章
    • Organizer
      第36回 日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      20131203-20131206
  • [Presentation] Design of novel oligonucleotides for allosteric regulation of RISC function.2013

    • Author(s)
      山吉 麻子・中村 裕未・小堀 哲生・村上 章
    • Organizer
      第36回 日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      20131203-20131206
  • [Presentation] Structural insights for design of inhibitors targeting microRNA2013

    • Author(s)
      有吉 純平・山吉 麻子・小堀 哲生・村上 章
    • Organizer
      第36回 日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      20131203-20131206
  • [Presentation] RISCのガイド鎖保持機構の阻害を狙ったペプチドコンジュゲート核酸の開発2013

    • Author(s)
      有吉 純平・山吉 麻子・小堀 哲生・村上 章
    • Organizer
      第23回 アンチセンスシンポジウム
    • Place of Presentation
      徳島大学大塚講堂
    • Year and Date
      20131128-20131129
  • [Presentation] In vitro RNAisystemを用いたRISC-アンチセンス核酸の相互作用解析2013

    • Author(s)
      松山 洋平・山吉 麻子・小堀 哲生・村上 章
    • Organizer
      第23回 アンチセンスシンポジウム
    • Place of Presentation
      徳島大学大塚講堂
    • Year and Date
      20131128-20131129
  • [Presentation] RISC機能の制御を目指した遺伝子制御素子の開発2013

    • Author(s)
      山吉 麻子・中村 裕未・松山 洋平・小堀 哲生・村上 章
    • Organizer
      第23回 アンチセンスシンポジウム
    • Place of Presentation
      徳島大学大塚講堂
    • Year and Date
      20131128-20131129
  • [Presentation] Non-coding RNAの機能に着目した転写スイッチングシステムの開発(II) 7SKの機能を模倣した新規転写阻害剤の開発2013

    • Author(s)
      山吉 麻子・岸本 恭介・駒野 淳・小柳 義夫・小堀 哲生・村上 章
    • Organizer
      第23回 アンチセンスシンポジウム
    • Place of Presentation
      徳島大学大塚講堂
    • Year and Date
      20131128-20131129
  • [Presentation] New design principal of inhibitors targeting microRNA from binding behaviors of antisense oligonucleotides with RISC (I) Evaluation of binding affinities between RISC and artificial oligonucleotides by native agarose gel system.2013

    • Author(s)
      A. Yamayoshi, Y. Matsuyama, A. Kobori, A. Murakami
    • Organizer
      The 40th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry
    • Place of Presentation
      神奈川大学
    • Year and Date
      20131113-20131115
  • [Presentation] New design principal of inhibitors targeting microRNA from binding behaviors of antisense oligonucleotides with RISC (II) New insights for regulation of RISC function by antisense oligonucleotides.2013

    • Author(s)
      Y. Matsuyama, A. Yamayoshi, A. Kobori, A. Murakami
    • Organizer
      The 40th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry
    • Place of Presentation
      神奈川大学
    • Year and Date
      20131113-20131115
  • [Presentation] Structural insights for design of inhibitors targeting microRNA2013

    • Author(s)
      J. Ariyoshi, A. Yamayoshi, A. Kobori, A. Murakami
    • Organizer
      The 40th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry
    • Place of Presentation
      神奈川大学
    • Year and Date
      20131113-20131115
  • [Presentation] Syntesis and interaction behavior of peptide ribonucleic acid (PRNA)-PNA-DNA chimeras and application to expression control of gene information.2013

    • Author(s)
      R. Uematsu, T. Mizutani, Y. Araki, S. Sakamoto, J. Ariyoshi, A. Yamayoshi, A. Murakami, T. Wada
    • Organizer
      The 40th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry
    • Place of Presentation
      神奈川大学
    • Year and Date
      20131113-20131115
  • [Presentation] Studies on effects of introduction of phenylboronic acids derivatives upon anti-syn orientation control of peptide ribonucleic acids (PRNA) toward cancer cell specific oligonucleotide therapeutics.2013

    • Author(s)
      R. Uematsu, T. Mizutani, Y. Araki, S. Sakamoto, J. Ariyoshi, A. Yamayoshi, A. Murakami, T. Wada
    • Organizer
      The 40th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry
    • Place of Presentation
      神奈川大学
    • Year and Date
      20131113-20131115
  • [Presentation] microRNAを標的とする機能性核酸の新しい分子設計指針2013

    • Author(s)
      山吉 麻子・松山 洋平・小堀 哲生・村上 章
    • Organizer
      名古屋大学東山キャンパス
    • Place of Presentation
      第7回 バイオ関連化学シンポジウム
    • Year and Date
      20130927-20130929
  • [Presentation] microRNAを標的とする機能性核酸の新しい分子設計指針2013

    • Author(s)
      山吉 麻子・松山 洋平・小堀 哲生・村上 章
    • Organizer
      第62回高分子討論会
    • Place of Presentation
      金沢大学角間キャンパス
    • Year and Date
      20130911-20130913
  • [Presentation] In vitro RNAi系を用いたRISCとアンチセンス核酸との結合親和性の評価2013

    • Author(s)
      松山 洋平・山吉 麻子・小堀 哲生・村上 章
    • Organizer
      第23回バイオ・高分子シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京工業大学大学・大岡山キャンパス
    • Year and Date
      20130731-20130801
  • [Presentation] microRNA保持機構の阻害を狙った新規RISC機能制御分子の開発2013

    • Author(s)
      山吉 麻子・有吉 純平・小堀 哲生・村上 章
    • Organizer
      第23回バイオ・高分子シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京工業大学大学・大岡山キャンパス
    • Year and Date
      20130731-20130801
  • [Presentation] RISC機能の制御を目指したリンカー導入型遺伝子制御素子の開発2013

    • Author(s)
      山吉 麻子・中村 裕未・向井 貴俊・小堀 哲生・村上 章
    • Organizer
      第59回高分子研究発表会
    • Place of Presentation
      兵庫県民会館
    • Year and Date
      20130712-20130712
  • [Book] Phoregulation of DNA/RNA functions2014

    • Author(s)
      A.Yamayoshi, A. Kobori, A. Murakami
    • Total Pages
      未定
    • Publisher
      Pan Stanford Publishing Pte. Ltd.

URL: 

Published: 2015-05-28  

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