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2012 Fiscal Year Research-status Report

細胞内でのnon-B DNAの構造変化のダイナミクス研究

Research Project

Project/Area Number 24550188
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

CHOI Jungkweon  大阪大学, 産業科学研究所, 特任助教 (00574328)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2015-03-31
KeywordsNon-B DNA / G-quadruple / 電荷分離
Research Abstract

DNAの酸化と還元は様々な生命現象における本質的な過程であり、その重要性は明確であり、さらに生命化学やナノ生命工学への応用の可能性からも、近年、DNA中の電子・正孔移動が注目されている。今回我々はレーザーフラッシュフォトリシスとパルスラジオリシスを用いてnon-B DNAの一つであるG-四重鎖中における正孔移動と捕獲についての研究を行った。G-四重鎖はグアニン(G)を多く含む様々な配列によって形成されるDNA二次構造であり、生体外においてテロメアーゼの結合を阻害することや、転写抑制因子として働くことから注目を集めている。近年、DNA中における正孔移動の全体的な効率を決定する上で、正孔捕獲は重要な過程であると考えられるようになった。これまでDNAの酸化における、G-カルテットの役割についての知見は得られていなかった。本研究では、リボフラビンが修飾されたG-四重鎖(Rf-G―q)では、リボフラビンとG塩基間の電荷分離が、平面構造を有するG-カルテットの優れた正孔捕獲能によって効率的に進行することが明らかになった。1 さらに、リボフラビンからG塩基への効率的な電荷移動の後、電荷分離状態が生成し、その後、電荷再結合によるリボフラビンの三重項励起状態(3Rf*)の生成が~0.7ns程度の時間領域で起こることが観察された。すなわち、G-四重鎖のG-カルテットがG一つや2・3つ連続したGより低い酸化電位を有するがわかった。このことはG-四重鎖が遺伝子の酸化損傷に対する捕捉剤として働きうることを意味する。本研究で得られた知見から、DNAの損傷と修復において、G-四重鎖の果たす役割が注目され、今後の解明が待たれる。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

研究計画通りに進んでおり、これまでに得られた結果をもとに論文を作成しているからである。

Strategy for Future Research Activity

得られた結果をもとに生きている細胞内でG-quadruplex DNAの構造変化のダイナミクスを明らかにする。高い空間分解能(数nm-数十nm)と時間分解能(<50 ps)を持つ共焦点蛍光顕微鏡システムを使用して細胞内での構造変化を解明する。

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

1. 遺伝子導入装置購入
2. データ解析のためのコンピュータおよびプログラムの購入

  • Research Products

    (11 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (9 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Hole-Trapping of G-Quartets in a G-Quadruplex2013

    • Author(s)
      J. Choi, J. Park, A. Tanaka, M. J. Park, Y. J. Jang, M. Fujitsuka, S. K. Kim,, and T. Majima
    • Journal Title

      Angew. Chem. Int. Ed.

      Volume: 52 Pages: 1134-1138

    • DOI

      10.1002/anie.201208149.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Folding Dynamics of Cytochrome c Using Pulse Radiolysis2012

    • Author(s)
      J. Choi, M. Fujitsuka, S. Tojo, and T. Majima
    • Journal Title

      J. Am. Chem. Soc.

      Volume: 134 Pages: 13430-13435

    • DOI

      10.1021/ja304904p

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] G-四重鎖のG-カルテットにおける正孔捕獲2013

    • Author(s)
      崔正権、田中敦志、藤塚守、真嶋哲朗
    • Organizer
      日本化学会第93春季年会
    • Place of Presentation
      滋賀県草津市、立命館大学びわこ・くさつキャンパス
    • Year and Date
      20130322-20130325
  • [Presentation] Folding dynamics of cytochrome c investigated by pulse radiolysis2013

    • Author(s)
      Jungkweon Choi, Mamoru Fujitsuka, Sachiko Tojo, Tetsuro Majima
    • Organizer
      The 16th SANKEN International Symposium 2013
    • Place of Presentation
      大阪、大阪大学、産業科学研究所
    • Year and Date
      20130122-20130123
  • [Presentation] Electron Transfer-triggered Folding Dynamics of Cytochrome c2012

    • Author(s)
      Jungkweon Choi, Mamoru Fujitsuka, Sachiko Tojo, and Tetsuro Majima
    • Organizer
      7th Asian Photochemistry Conference
    • Place of Presentation
      大阪、大阪大学、Icho Kaikan
    • Year and Date
      20121112-20121114
  • [Presentation] Folding/Unfolding Dynamics of Cytochrome c2012

    • Author(s)
      Jungkweon Choi, Tetsuro Majima
    • Organizer
      KCS 110th National Meeting
    • Place of Presentation
      BEXCO, Busan, Korea
    • Year and Date
      20121017-20121019
  • [Presentation] 単一分子レベルでのポリアデニンの自己集合に関する研究2012

    • Author(s)
      崔 正権、金 水縁、真嶋哲朗
    • Organizer
      光化学討論会
    • Place of Presentation
      東京、東京工業大学 大岡山キャンパス
    • Year and Date
      20120912-20120914
  • [Presentation] シトクロムcの折り畳み過程の研究2012

    • Author(s)
      崔 正権、藤塚 守、藤乗幸子、真嶋哲朗
    • Organizer
      第17回日本光生物学協会年会
    • Place of Presentation
      大阪、大阪大学、産業科学研究所
    • Year and Date
      20120817-20120818
  • [Presentation] pH変化によるi-motif DNAの構造変化のダイナミクス2012

    • Author(s)
      金 水縁、崔 正権、藤塚 守、藤乗幸子、真嶋哲朗
    • Organizer
      第17回日本光生物学協会年会
    • Place of Presentation
      大阪、大阪大学、産業科学研究所
    • Year and Date
      20120817-20120818
  • [Presentation] シトクロムcの折り畳み過程の研究2012

    • Author(s)
      崔 正権、藤塚 守、藤乗幸子、真嶋哲朗
    • Organizer
      第34回日本光医学・光生物学会
    • Place of Presentation
      神戸商工会議所と神戸国際会議場
    • Year and Date
      20120728-20120729
  • [Presentation] Dynamics of non-B DNA: G-quadruple, i-motif and A-motif

    • Author(s)
      Jungkweon Choi
    • Organizer
      日本化学会アジア国際シンポジウム光化学Division
    • Place of Presentation
      滋賀県草津市、立命館大学びわこ・くさつキャンパス
    • Invited

URL: 

Published: 2014-07-24  

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