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2014 Fiscal Year Annual Research Report

金属錯体型塩基対のDNAポリメラーゼによる認識

Research Project

Project/Area Number 24550199
Research InstitutionOsaka University of Pharmaceutical Sciences

Principal Investigator

浦田 秀仁  大阪薬科大学, 薬学部, 教授 (80211085)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2015-03-31
Keywords金属錯体型塩基対 / DNAポリメラーゼ / プライマー伸長反応
Outline of Annual Research Achievements

シトシン-シトシン (C-C)ミスマッチ塩基対がAg(I)イオンにより安定化されるという小野らの報告に基づき、一本鎖領域にCを含む鋳型鎖を用いてAg(I)イオン存在下でプライマー伸長反応を検討したところ、dCTPではなくdATPが取り込まれることを見出した。この反応はDNAポリメラーゼとしてKlenow fragment(KF)以外のTaq polymeraseやKOD dash polymeraseでも進行する一般性を持つことを明らかにした。このように、Ag(I)イオン存在下でのDNAポリメラーゼによる伸長反応では、熱力学的に安定とされるC-Ag(I)-C錯体型塩基対ではなく、C-Ag(I)-A錯体型塩基対が形成されることが明らかになった(Angew. Chem. Int. Ed., 2012, 51, 6464.)。
また、Ag(I)イオン存在下、各種ミスマッチ塩基対が形成されうるプライマー伸長反応の網羅的解析で、鋳型鎖のCに対してdATPだけでなくdTTPも取り込まれることを明らかにした。この結果から、DNAポリメラーゼとしてKF exo-を作用させ、3種(C-Ag(I)-C, C-Ag(I)-A, C-Ag(I)-T)の銀錯体型塩基対の形成しやすさを定性的に比較し、C-Ag(I)-A > C-Ag(I)-T >> C-Ag(I)-Cとなることを明らかにした。また、鋳型鎖CにdTTPを取り込む反応 (C-Ag(I)-T形成反応) はAg(I)イオン特異的であり、鋳型鎖チミンにdTTPを取り込む反応 (T-Hg(II)-T形成反応) はHg(II)イオン特異的であることを利用し、同一配列内にCとTを含む鋳型鎖を用いてプライマー伸長反応を行い、Ag(I)イオンとHg(II)イオンをそれぞれ位置特異的に二重鎖DNA中に取り込むことに初めて成功した (Angew. Chem. Int. Ed., 2014, 53, 6624)。

  • Research Products

    (3 results)

All 2015 2014

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Regulated incorporation of two different metal ions into programmed sites in a duplex by DNA polymerase catalyzed primer extension2014

    • Author(s)
      Tatsuya Funai, Junko Nakamura, Yuki Miyazaki, Risa Kiriu, Osamu Nakagawa, Shun-ichi Wada, Akira Ono and Hidehito Urata
    • Journal Title

      Angew. Chem. Int. Ed.

      Volume: 53 Pages: 6624-6627

    • DOI

      10.1002/anie.201311235

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] DNA polymerase による銀(I) 錯体型塩基対形成の塩基選 択性2015

    • Author(s)
      桐生里紗,舩井達也,中村淳子,林淳祐,和田俊一, 浦田秀仁
    • Organizer
      日本薬学会第135年会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-28
  • [Presentation] Recognition of Metal-Mediated Base Pairs by DNA Polymerases2014

    • Author(s)
      Tatsuya Funai, Junko Nakamura, Yuki Miyazaki, Risa Kiriu, Osamu Nakagawa, Shun-ichi Wada, Akira Ono, and Hidehito Urata
    • Organizer
      第24回金属の関与する生体関連反応シンポジウム
    • Place of Presentation
      京都薬科大学
    • Year and Date
      2014-06-14 – 2014-06-15

URL: 

Published: 2016-06-01  

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