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2014 Fiscal Year Annual Research Report

シロイヌナズナの葉の形成におけるAS2のエピジェネティックな遺伝子抑制機構の解明

Research Project

Project/Area Number 24570061
Research InstitutionChubu University

Principal Investigator

町田 千代子  中部大学, 応用生物学部, 教授 (70314060)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2015-03-31
Keywords植物 / 発生・分化 / 遺伝子 / 発現制御 / マイクロアレイ / エピジェネティック制御 / DNAメチル化
Outline of Annual Research Achievements

植物の発生分化過程では全能性を保持した分化スイッチが起ると考えられている。このような過程では、植物に特徴的なエピジェネティックな抑制制御が働いている可能性があるが、その仕組みは明らかになっていない。葉は茎頂メリステムから分化する地上部の主要な器官であり、表裏のある左右相称で扁平な形態的特徴をもつ。葉の発生初期には、裏側的性質をもつ棒状の形態をしているが、発生の進行に伴い、表側の細胞が分化すると、側方方向への葉の細胞増殖がおこり扁平になると考えられている。本研究の目的は、葉の分化をモデルとして、植物の分化に特徴的なエピジェネティックな抑制の仕組みを解明する事である。我々は、シロイヌナズナの葉の表側分化に関わる因子であるAS1とAS2に着目して研究を進めた結果、AS1-AS2複合体は裏側化因子ARF3を直接抑制制御すること、ARF3とARF4をsmall RNAを介して間接的にも制御する二重の制御を明らかにした。トポイソメラーゼIαやクロマチン再構成因子等がAS1-AS2と共に ARF3 の発現抑制に関わること、AS1とAS2 は、ARF3 のgene body DNAメチル化レベルの維持に関わることを示唆した。26年度は、トポイソメラーゼIαの阻害剤カンプトテシンを投与したシロイヌナズナを用いて、新奇なアルゴリズム(KB-FuzzyART)によるマイクロアレイ解析を行い、ARF3の下流因子候補を抽出し、遺伝学的解析を行い、細部周期進行制御に関わるKRP5(CDKインヒビター)とサイトカイニン合成に関わる因子(IPT3)を同定した。さらに、カンプトテシンを投与した場合のARF3遺伝子座のDNAメチル化レベルの解析を進行中である。以上の結果から、AS1-AS2はARF3のエピジェネティックな制御に関わり、ARF3の制御を介して、KRP5とIPT3を抑制し、葉の表側分化と側方方向の細胞増殖を制御している可能性が考えられる。

  • Research Products

    (25 results)

All 2015 2014 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 2 results) Presentation (21 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Protein encoded by oncogene 6b from Agrobacterium tumefaciens has a reprogramming potential and histone chaperone-like activity.2014

    • Author(s)
      Ishibashi N., Kitakura S., Terakura S., Machida C. and Machida Y.
    • Journal Title

      Front. Plant Sci.

      Volume: 5 Pages: 572

    • DOI

      10.3389/fpls.2014.00572.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] シロイヌナズナの葉の裏と表の発生分化の仕組みを探る-葉の左右相称性と表側の細胞分化の鍵因子AS1-AS2の標的遺伝子ETTIN(ARF3)の同定と制御機構2014

    • Author(s)
      岩崎まゆみ・高橋広夫・深澤弘・町田泰則・小島晶子・町田千代子
    • Journal Title

      中部大学生物機能開発研究所紀要

      Volume: 14 Pages: 35-43

    • Open Access
  • [Presentation] シロイヌナズナのBOBBER1とFASCIATA2 は葉の発生において協調的に機能する2015

    • Author(s)
      石橋奈々子・町田千代子・町田泰則
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学世田谷キャンパス(東京都世田谷区)
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-18
  • [Presentation] シロイヌナズナの葉の向背軸性の確立におけるAS1-AS2-ETT 経路を介したサイトカイニン合成遺伝子の制御2015

    • Author(s)
      小島晶子・石橋奈々子・香田佳那・小嶋美紀子・高橋広夫・榊原 均・町田泰則・町田千代子
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学世田谷キャンパス(東京都世田谷区)
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-18
  • [Presentation] シロイヌナズナの葉の向背軸形成におけるAS1-AS2 によるKRP5 遺伝子発現の抑制機能の解明2015

    • Author(s)
      伊藤卓馬・中川彩美・石橋奈々子・高橋宏夫・小島晶子・町田泰則・町田千代子
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学世田谷キャンパス(東京都世田谷区)
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-18
  • [Presentation] ケミカルバイオロジーによるシロイヌナズナの葉の向背軸形成に関わる因子の探索2015

    • Author(s)
      玉井元樹・中川彩美・伊藤卓馬・大賀一臣・高橋広夫・小島晶子・町田泰則・町田千代子
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学世田谷キャンパス(東京都世田谷区)
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-18
  • [Presentation] カンプトテシン産生植物チャボイナモリの DNAトポイソメラーゼI は、カンプトテシン投与したas1 における葉の向背軸不全を抑圧する2015

    • Author(s)
      大河内俊貴・高橋真理・中川彩美・山崎真巳・斉藤和季・町田泰則・町田千代子
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学世田谷キャンパス(東京都世田谷区)
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-18
  • [Presentation] シロイヌナズナの葉の向背軸極性分化におけるETT 下流因子IPT3 遺伝子の役割の解明2015

    • Author(s)
      香田佳那・石橋奈々子・小嶋美紀子・中川彩美・高橋広夫・榊原 均・町田泰則・町田千代子・小島晶子
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学世田谷キャンパス(東京都世田谷区)
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-18
  • [Presentation] AS1-AS2 が関わる葉の向軸側分化におけるINCURVATA2 及びReplication Factor C subunit 3の役割の解明2015

    • Author(s)
      Luong Quy Toan・氣多澄江・浅井俊晴・舟橋明華・中川彩美・石橋奈々子・町田泰則・町田千代子
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学世田谷キャンパス(東京都世田谷区)
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-18
  • [Presentation] シロイヌナズナの葉の向背軸分化に関わるAS2タンパク質の分裂期における核小体周縁部局在の解析2014

    • Author(s)
      町田千代子・Luo Lilan・石橋奈々子・栗原大輔・氣多澄江・町田泰則
    • Organizer
      第37回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2014-11-25 – 2014-11-27
  • [Presentation] シロイヌナズナの葉の発生分化のロバストネスを支えるAS1-AS2の機能解明2014

    • Author(s)
      中川彩美・高橋広夫・伊藤卓馬・玉井元樹・大河内俊貴・小島晶子・町田泰則・町田千代子
    • Organizer
      第37回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2014-11-25 – 2014-11-27
  • [Presentation] シロイヌナズナの葉の表・裏分化におけるAS2-AS1複合体と核小体の役割2014

    • Author(s)
      町田泰則・松村葉子・石橋奈々子・氣多澄江・小島晶子・町田千代子
    • Organizer
      第37回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2014-11-25 – 2014-11-27
  • [Presentation] Epigenetic regulation of ETTIN in leaf adaxial-abaxial patterning in Arabidopsis thaliana.2014

    • Author(s)
      VIAL-PRADEL S., Nakagawa A., Iwasaki M., Ito T., Machida Y., Machida C.
    • Organizer
      XII France-Japan Workshop on Plant Science 2014 -Plant Responses to Environment
    • Place of Presentation
      Yayoi Auditorium, The University of Tokyo
    • Year and Date
      2014-10-27 – 2014-10-29
  • [Presentation] シロイヌナズナの葉の軸形成におけるETTIN制御ネットワークの解明2014

    • Author(s)
      中川彩美・高橋広夫・伊藤卓馬・小島晶子・町田泰則・町田千代子
    • Organizer
      日本植物学会第78回大会
    • Place of Presentation
      明治大学生田キャンパス(神奈川県川崎市)
    • Year and Date
      2014-09-12 – 2014-09-14
  • [Presentation] シロイヌナズナの葉の発生においてAS1-AS2はサイトカイニン合成を制御する2014

    • Author(s)
      小島晶子・石橋奈々子・小嶋美紀子・高橋広夫・香田佳那・榊原均・町田泰則・町田千代子
    • Organizer
      日本植物学会第78回大会
    • Place of Presentation
      明治大学生田キャンパス(神奈川県川崎市)
    • Year and Date
      2014-09-12 – 2014-09-14
  • [Presentation] シロイヌナズナのAS1-AS2が関わる葉の軸形成におけるDNAポリメラーゼαの役割の解明2014

    • Author(s)
      Luong Quy Toan・氣多澄江・舟橋明華・中川彩美・石橋奈々子・町田泰則・町田千代子
    • Organizer
      日本植物学会第78回大会
    • Place of Presentation
      明治大学生田キャンパス(神奈川県川崎市)
    • Year and Date
      2014-09-12 – 2014-09-14
  • [Presentation] 葉形成に関わるASYMMETRIC LEAVES2タンパク質による核内スペックル形成に必要な領域2014

    • Author(s)
      町田泰則・Lilan Luo・石橋奈々子・笹部美知子・町田千代子・鈴木崇紀
    • Organizer
      日本植物学会第78回大会
    • Place of Presentation
      明治大学生田キャンパス(神奈川県川崎市)
    • Year and Date
      2014-09-12 – 2014-09-14
  • [Presentation] Chemical genetic analyses infer that AS1-AS2 controls cell division through ETTIN in leaf adaxial-abaxial and medio-lateral patterning2014

    • Author(s)
      Nakagawa A., Takahashi H., Ito T., Kojima S., Machida Y., Machida C.
    • Organizer
      The 25th International Conference on Arabidopsis Research, ICAR2014
    • Place of Presentation
      University of British Columbia Vancouver, Canada
    • Year and Date
      2014-07-28 – 2014-08-01
  • [Presentation] Epigenetic regulator ASYMMETRIC LEAVES2 protein presented around nucleoli and required for establishment of leaf adaxial cell differentiation consistently forms speckles during mitosis2014

    • Author(s)
      Machida C., Luo L., Keta S., Kurihara D., Ishibashi N., Sasabe M., Machida Y.
    • Organizer
      The 25th International Conference on Arabidopsis Research, ICAR2014
    • Place of Presentation
      University of British Columbia Vancouver, Canada
    • Year and Date
      2014-07-28 – 2014-08-01
  • [Presentation] Epigenetic regulator AS1-AS2 is involved in gene body DNA methylation of ETTIN in establishment of leaf adaxial-abaxial polarity in Arabidopsis thaliana2014

    • Author(s)
      Ito T., Vial-Pradel S., Takada E., Nakagawa A., Iwasaki M., Machida Y., Machida C.
    • Organizer
      The 25th International Conference on Arabidopsis Research, ICAR2014
    • Place of Presentation
      University of British Columbia Vancouver, Canada
    • Year and Date
      2014-07-28 – 2014-08-01
  • [Presentation] Knowledge-based bioinformatic analyses of microarrays predict that epigenetic regulator AS1-AS2 controls cell division through ETTIN in leaf adaxial-abaxial patterning2014

    • Author(s)
      Takahashi H., Nakagawa A., Ishibashi N., Kojima S., Machida Y., Machida C.
    • Organizer
      The 25th International Conference on Arabidopsis Research, ICAR2014
    • Place of Presentation
      University of British Columbia Vancouver, Canada
    • Year and Date
      2014-07-28 – 2014-08-01
  • [Presentation] ASYMMETRIC LEAVES1 (AS1) and AS2 regulate the expression of AtIPT3 through AUXIN RESPONSE FACTOR3/ETTIN function during leaf development in Arabidopsis thaliana.2014

    • Author(s)
      Kojima S., Takahashi H., Ishibashi N., Handayani A., Matsumura Y., Machida Y., Machida C.
    • Organizer
      International Symposium on Auxins and Cytokinins in Plant Development
    • Place of Presentation
      Prague, Czech Republic
    • Year and Date
      2014-06-29 – 2014-07-04
  • [Presentation] AS2 and BOB1 synergistically regulate cytokinin levels and the establishment of leaf adaxial-abaxial polarity through the ETT/ARF3-IPT3 pathway in Arabidopsis thaliana.2014

    • Author(s)
      Ishibashi N., Kojima S., Kojima M., Sakakibara H., Takahashi H., Machida C. Machida Y.
    • Organizer
      International Symposium on Auxins and Cytokinins in Plant Development
    • Place of Presentation
      Prague, Czech Republic
    • Year and Date
      2014-06-29 – 2014-07-04
  • [Remarks] 中部大学 応用生物学部 応用生物学化学科 町田研究室

    • URL

      http://stu.isc.chubu.ac.jp/bio/public/Bio_Chem/labo/machida_lab/index.html

  • [Remarks] 中部大学 応用生物学部 応用生物学化学科 教員情報

    • URL

      http://www.chubu.ac.jp/about/faculty/profile/a6cde1928363540bd3162e39f6d033681deac316.html

URL: 

Published: 2016-06-01  

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