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2012 Fiscal Year Research-status Report

性ホルモンシグナリングの集団分化から探る魚類の繁殖システム多様化の遺伝基盤

Research Project

Project/Area Number 24570105
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Research InstitutionFukui Prefectural University

Principal Investigator

小北 智之  福井県立大学, 海洋生物資源学部, 准教授 (60372835)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2015-03-31
Keywords行動生態 / 行動遺伝 / 適応進化 / エコゲノミクス / QTLマッピング / トランスクリプトミクス / 性ステロイド / 魚類
Research Abstract

動物の繁殖行動は近縁種間・集団間ですら著しい多様性を示すが、多様化のメカニズムを詳細に検討する上でその遺伝基盤の解明は欠かせない。本研究はゲノミックリソースが既に充実しており、繁殖システムの対照的な集団間分化を示す日本産イトヨ類のハリヨをモデル系として、これまでほとんど解明されていない魚類繁殖行動の集団間変異の遺伝基盤に切り込むものである。申請者の先行研究で明らかにされた繁殖行動変異のプロキシとしての性ホルモンシグナリングの集団間変異をターゲットとして、多角的なゲノム科学のアプローチを駆使することによって、同定が難しい自然集団の“行動”遺伝子を同定することを最終的な目的としている。
平成24年度は、QTLマッピングによって雄の血中アンドロゲン濃度の集団間変異をもたらす遺伝子座を特定するために、作出した多数のF2交雑個体のフェノタイピング(血中の11-ケトテストステロン濃度)を実施した。その結果、F2世代における 11-ケトテストステロン濃度の表現型の分離に成功した。また、一部の個体では次世代シーケンサー(イルミナHiseq2000)を用いたRADseqによるジェノタイピングも実施し、この方法の有効性を確認した。平成25年度中に、追加のジェノタイピングを行い、QTL解析によりアンドロゲン濃度の集団間変異をもたらす原因遺伝子座を特定する予定である。
次に、精巣におけるアンドロゲン合成に関わる因子を主なターゲットとして、比較トランスクリプトーム解析を行った。共通環境で育成した合計4集団を用いて、繁殖フェーズの雄の精巣から抽出したmRNA を用いたマイクロアレイ解析を行った結果、アンドロゲンの合成に関わることが知られている酵素遺伝子群のうち、生態型間で発現量が明瞭に異なる遺伝子群を検出することに成功した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

各種の実験項目において、当初の計画書通りのペースでデータが取得できているため。各実験項目の成果は「研究実績の概要」に記している。

Strategy for Future Research Activity

H24年度は、当初の計画書通りのペースでデータが取得できたため、今後も同様のペースでデータを取得することによって、本研究課題中の最終目的に達することが充分可能である。

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

当初の計画書通り、作成した家系を用いたQTLマッピングのために以下の項目に研究費を使用する予定である。
(1)RADライブラリー作成のため試薬類の購入
(2)作成したライブラリーの配列を解読するための次世代シークエンス委託費(研究代表者の勤務先には次世代シーケンサーが設置されていないため)
(3)研究成果を学会発表するための旅費

  • Research Products

    (12 results)

All 2014 2013 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (7 results) (of which Invited: 1 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] エコゲノミクスにおける網羅的遺伝子発現解析-魚類での研究例から-2013

    • Author(s)
      小北智之
    • Journal Title

      生物科学

      Volume: 64 Pages: 141-150

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular signatures of lineage-specific adaptive evolution in a unique sea basin: the example of an anadromous goby Leucopsarion petersii2013

    • Author(s)
      Kokita, T., S. Takahashi, H. Kumada
    • Journal Title

      Molecular Ecology

      Volume: 22 Pages: 1341-1355

    • DOI

      doi:10.1111/mec.12184

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A RAD-based linkage map and comparative genomics in the gudgeons (genus Gnathopogon, Cyprinidae)2013

    • Author(s)
      Kakioka, R., T. Kokita, H. Kumada, K. Watanabe, N. Okuda
    • Journal Title

      BMC Genomics

      Volume: 14 Pages: 32

    • DOI

      doi:10.1186/1471-2164-14-32

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The origins of limnetic forms and cryptic divergence in Gnathopogon fishes (Cyprinidae) in Japan2013

    • Author(s)
      Kakioka, R., T. Kokita, R. Tabata, S. Mori, K. Watanabe
    • Journal Title

      Environmental Biology of Fishes

      Volume: 96 Pages: 631-644

    • DOI

      doi:10.1007/s10641-012-0054-x

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ハリヨ集団間における繁殖システム変異のエコゲノミクス - 第14回大会ワークショップ「エコゲノミクスで挑む進化学~次の10年~」-

    • Author(s)
      小北智之
    • Organizer
      日本進化学会
    • Place of Presentation
      東京
    • Invited
  • [Presentation] RADタグマーカーによるタモロコ属魚類の高密度連鎖地図構築と比較ゲノム解析

    • Author(s)
      柿岡諒・小北智之・熊田裕喜・渡辺勝敏・奥田昇
    • Organizer
      日本進化学会
    • Place of Presentation
      東京
  • [Presentation] 性ホルモンシグナリングの適応的な遺伝的分化と繁殖システムの多様化

    • Author(s)
      小北智之・山元麻由美・野々垣初音・北野載・松山倫也・森誠一
    • Organizer
      日本魚類学会
    • Place of Presentation
      下関
  • [Presentation] タモロコ属魚類における生息場所利用と関連した適応的形態進化の遺伝基盤

    • Author(s)
      柿岡諒・小北智之・熊田裕喜・渡辺勝敏・奥田昇
    • Organizer
      日本魚類学会
    • Place of Presentation
      下関
  • [Presentation] 移入イトヨとの交雑による在来ハリヨ集団の個体群特性の変化

    • Author(s)
      清水雅哉・森誠一・小北智之
    • Organizer
      日本魚類学会
    • Place of Presentation
      下関
  • [Presentation] イトヨ那須集団における近年の集団内鱗板変異パターンと遺伝的多様性

    • Author(s)
      鈴木悠斗・森誠一・吉田豊・小北智之
    • Organizer
      日本魚類学会
    • Place of Presentation
      下関
  • [Presentation] Change in population dynamics of a native threespine stickleback caused by introgressive hybridization with an congener

    • Author(s)
      Masaya Shimizu, Seiichi Mori, Tomoyuki Kokita
    • Organizer
      The 14th International Symposium on the Efficient Application and Preservation of Marine Biological Resources
    • Place of Presentation
      小浜
  • [Book] 魚類行動生態学入門2014

    • Author(s)
      小北智之
    • Total Pages
      未定
    • Publisher
      東海大学出版会

URL: 

Published: 2014-07-24  

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