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2015 Fiscal Year Annual Research Report

ピリドキサール酵素の反応特異性制御機構の解明

Research Project

Project/Area Number 24570140
Research InstitutionOsaka Medical College

Principal Investigator

林 秀行  大阪医科大学, 医学部, 教授 (00183913)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 村川 武志  大阪医科大学, 医学部, 助教 (90445990)
Project Period (FY) 2012-04-01 – 2016-03-31
Keywords酵素反応機構 / ピリドキサール5'-リン酸 / 反応速度論 / プロトン化状態 / 反応中間体 / 副反応 / 反応特異性
Outline of Annual Research Achievements

平成26年度の研究により,トレオニン合成酵素(TS)と2-アミノホスホノペンタン酸(AP5)の反応の解析により,TS触媒反応の前半過程の解析の端緒が開かれた。このことに基づき,平成27年度はTSとAP5の反応の広域pHにおける解析を行った。その結果,pH依存性はTSとAP5の結合の段階のみに影響すること,すなわち,AP5のアミノ基が非プロトン化し,カルボキシ基が解離した形がTSに結合し,TS-AP5複合体が形成された後は,活性部位のプロトン化状態がpH 6~8の領域で変化がないことが判明した。これに加えて,TSとL-トレオニンの反応も広域pHで解析したところ,TSとAP5の反応と同様に,TSとL-トレオニンの結合段階のみがpH依存性を示し,やはりL-トレオニンのアミノ基が非プロトン化し,カルボキシ基が解離した形がTSに結合し,TS-L-トレオニン複合体においては活性部位のプロトン化状態がpH 6~8の領域で変化がないことが判明した。以上のことより,TSの反応の全体を通して,基質OPHSのリン酸基,およびリン酸基の脱離によって生成し,活性部位にとどまっているリン酸イオンと周囲の残基の,イオン的相互作用を中心とする強い相互作用が活性部位の反応に関わる残基,特にLys61のアミノ基,のプロトン化状態を一定に保ち,pHに依存しない触媒反応を可能としていることが明らかとなった。活性部位のプロトン化状態の多様性は種々の副反応が生じる原因となり,プロトン化状態を一定に保つことによって副反応の進行を抑制しているという機構が明らかとなった。

  • Research Products

    (3 results)

All 2015

All Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results)

  • [Presentation] Molecular dynamics study on the molecular mechanism of product-assisted catalysis in threonine synthase2015

    • Author(s)
      氏家謙,田中弥,庄司光男,原田隆平,栢沼愛,重田育照,村川武志,林秀行
    • Organizer
      第43回構造活性相関シンポジウム・第10回薬物の分子設計と開発に関する日中シンポジウム
    • Place of Presentation
      新潟
    • Year and Date
      2015-09-27 – 2015-09-29
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] トレオニン合成酵素における生成物支援触媒機構についての理論的解明2015

    • Author(s)
      庄司光男,氏家謙,栢沼愛,重田育照,村川武志,林秀行
    • Organizer
      第53回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      金沢
    • Year and Date
      2015-09-13 – 2015-09-15
  • [Presentation] Molecular dynamics study on the key catalytic intermediates of threonine synthase2015

    • Author(s)
      Mitsuo Shoji, Yuzuru Ujiie, Ryuhei Harada, Megumi Kayanuma, Yasuteru Shigeta, Takeshi Murakawa, Hideyuki Hayashi
    • Organizer
      The 29th Annual Symposium of the Protein Society
    • Place of Presentation
      Barcelona, Spain
    • Year and Date
      2015-07-22 – 2015-07-25
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2017-01-06  

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